Merge of itasc branch. Project files, scons and cmake should be working. Makefile...
authorBenoit Bolsee <benoit.bolsee@online.be>
Thu, 24 Sep 2009 21:22:24 +0000 (21:22 +0000)
committerBenoit Bolsee <benoit.bolsee@online.be>
Thu, 24 Sep 2009 21:22:24 +0000 (21:22 +0000)
386 files changed:
extern/Eigen2/Eigen/Array [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/Cholesky [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/Core [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/Dense [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/Eigen [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/Geometry [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/LU [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/LeastSquares [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/NewStdVector [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/QR [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/QtAlignedMalloc [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/SVD [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/Sparse [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/StdVector [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Array/BooleanRedux.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Array/CwiseOperators.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Functors.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Norms.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Array/PartialRedux.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Random.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Select.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Cholesky/CholeskyInstantiations.cpp [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Cholesky/LDLT.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Cholesky/LLT.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Assign.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Block.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CacheFriendlyProduct.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Coeffs.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CommaInitializer.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CoreInstantiations.cpp [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Cwise.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CwiseBinaryOp.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CwiseNullaryOp.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CwiseUnaryOp.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/DiagonalCoeffs.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/DiagonalMatrix.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/DiagonalProduct.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Dot.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Flagged.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Functors.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Fuzzy.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/GenericPacketMath.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/IO.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Map.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/MapBase.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/MathFunctions.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Matrix.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/MatrixBase.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/MatrixStorage.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Minor.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/NestByValue.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/NumTraits.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Part.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Product.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Redux.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/SolveTriangular.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Sum.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Swap.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Transpose.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Visitor.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/arch/AltiVec/PacketMath.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/arch/SSE/PacketMath.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/util/Constants.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/util/DisableMSVCWarnings.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/util/EnableMSVCWarnings.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/util/ForwardDeclarations.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/util/Macros.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/util/Memory.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/util/Meta.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/util/StaticAssert.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Core/util/XprHelper.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/AlignedBox.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/AngleAxis.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/EulerAngles.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/Hyperplane.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/OrthoMethods.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/ParametrizedLine.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/Quaternion.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/Rotation2D.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/RotationBase.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/Scaling.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/Transform.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Geometry/Translation.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/LU/Determinant.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/LU/Inverse.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/LU/LU.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/LeastSquares/LeastSquares.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/QR/EigenSolver.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/QR/HessenbergDecomposition.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/QR/QR.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/QR/QrInstantiations.cpp [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/QR/SelfAdjointEigenSolver.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/QR/Tridiagonalization.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/SVD/SVD.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/AmbiVector.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/CholmodSupport.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/CompressedStorage.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/CoreIterators.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/DynamicSparseMatrix.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/MappedSparseMatrix.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/RandomSetter.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseAssign.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseBlock.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseCwise.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseCwiseBinaryOp.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseCwiseUnaryOp.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseDiagonalProduct.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseDot.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseFlagged.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseFuzzy.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseLDLT.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseLLT.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseLU.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseMatrix.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseMatrixBase.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseProduct.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseRedux.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseTranspose.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseUtil.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SparseVector.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/SuperLUSupport.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/TaucsSupport.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/TriangularSolver.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/Eigen/src/Sparse/UmfPackSupport.h [new file with mode: 0644]
extern/Eigen2/eigen-update.sh [new file with mode: 0644]
extern/glew/make/msvc_9_0/glew.vcproj
intern/CMakeLists.txt
intern/Makefile
intern/SConscript
intern/audaspace/make/msvc_9_0/audaspace.vcproj
intern/boolop/make/msvc_9_0/boolop.vcproj
intern/bsp/make/msvc_9_0/bsplib.vcproj
intern/container/make/msvc_9_0/container.vcproj
intern/decimation/make/msvc_9_0/decimation.vcproj
intern/elbeem/make/msvc_9_0/elbeem.vcproj
intern/ghost/intern/GHOST_System.cpp
intern/ghost/make/msvc_9_0/ghost.vcproj
intern/guardedalloc/make/msvc_9_0/guardedalloc.vcproj
intern/iksolver/make/msvc_9_0/iksolver.vcproj
intern/itasc/Armature.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/Armature.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/CMakeLists.txt [new file with mode: 0644]
intern/itasc/Cache.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/Cache.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/ConstraintSet.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/ConstraintSet.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/ControlledObject.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/ControlledObject.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/CopyPose.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/CopyPose.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/Distance.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/Distance.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/FixedObject.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/FixedObject.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/Makefile [new file with mode: 0644]
intern/itasc/MovingFrame.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/MovingFrame.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/Object.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/SConscript [new file with mode: 0644]
intern/itasc/Scene.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/Scene.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/Solver.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/UncontrolledObject.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/UncontrolledObject.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/WDLSSolver.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/WDLSSolver.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/WSDLSSolver.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/WSDLSSolver.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/WorldObject.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/WorldObject.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/eigen_types.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/eigen_types.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/Makefile [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/chain.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/chain.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/chainfksolver.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/chainfksolverpos_recursive.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/chainfksolverpos_recursive.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/chainjnttojacsolver.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/chainjnttojacsolver.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/frameacc.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/frameacc.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/frameacc.inl [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/frames.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/frames.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/frames.inl [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/frames_io.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/frames_io.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/framevel.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/framevel.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/framevel.inl [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/inertia.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/inertia.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/jacobian.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/jacobian.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/jntarray.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/jntarray.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/jntarrayacc.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/jntarrayacc.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/jntarrayvel.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/jntarrayvel.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/joint.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/joint.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/kinfam_io.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/kinfam_io.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/segment.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/segment.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/tree.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/tree.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/treefksolver.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/treefksolverpos_recursive.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/treefksolverpos_recursive.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/treejnttojacsolver.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/treejnttojacsolver.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/Makefile [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/error.h [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/error_stack.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/error_stack.h [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/kdl-config.h [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/rall1d.h [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/rall2d.h [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/svd_eigen_HH.hpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/traits.h [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/utility.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/utility.h [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/utility_io.cpp [new file with mode: 0644]
intern/itasc/kdl/utilities/utility_io.h [new file with mode: 0644]
intern/itasc/make/msvc_9_0/itasc.vcproj [new file with mode: 0644]
intern/itasc/ublas_types.hpp [new file with mode: 0644]
intern/memutil/make/msvc_9_0/memutil.vcproj
intern/moto/make/msvc_9_0/moto.vcproj
intern/smoke/intern/WTURBULENCE.cpp
intern/smoke/make/msvc_9_0/smoke.vcproj
intern/string/make/msvc_9_0/string.vcproj
projectfiles_vc9/blender/BLO_readblenfile/BLO_readblenfile.vcproj
projectfiles_vc9/blender/BPY_python/BPY_python.vcproj
projectfiles_vc9/blender/avi/BL_avi.vcproj
projectfiles_vc9/blender/blender.sln
projectfiles_vc9/blender/blender.vcproj
projectfiles_vc9/blender/blenfont/BLF_blenfont.vcproj
projectfiles_vc9/blender/blenkernel/BKE_blenkernel.vcproj
projectfiles_vc9/blender/blenlib/BLI_blenlib.vcproj
projectfiles_vc9/blender/blenpluginapi/blenpluginapi/blenpluginapi.vcproj
projectfiles_vc9/blender/editors/ED_editors.vcproj
projectfiles_vc9/blender/gpu/BL_gpu.vcproj
projectfiles_vc9/blender/ikplugin/BIK_ikplugin.vcproj [new file with mode: 0644]
projectfiles_vc9/blender/imbuf/BL_imbuf.vcproj
projectfiles_vc9/blender/loader/BLO_loader.vcproj
projectfiles_vc9/blender/makesdna/DNA_makesdna.vcproj
projectfiles_vc9/blender/makesrna/RNA_makesrna.vcproj
projectfiles_vc9/blender/makesrna/RNA_rna.vcproj
projectfiles_vc9/blender/nodes/nodes.vcproj
projectfiles_vc9/blender/render/BRE_render.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/blenderhook/KX_blenderhook.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/converter/KX_converter.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/expression/EXP_expressions.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/gamelogic/SCA_GameLogic.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/gameplayer/axctl/GP_axctl.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/gameplayer/common/GP_common.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/gameplayer/ghost/GP_ghost.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/ketsji/KX_ketsji.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/ketsji/network/KX_network.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/network/loopbacknetwork/NG_loopbacknetwork.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/network/network/NG_network.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/physics/PHY_Physics/PHY_Bullet/PHY_Bullet.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/physics/PHY_Physics/PHY_Dummy/PHY_Dummy.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/physics/PHY_Physics/PHY_Ode/PHY_Ode.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/physics/PHY_Physics/PHY_Physics.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/rasterizer/RAS_rasterizer.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/rasterizer/openglrasterizer/RAS_openglrasterizer.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/scenegraph/SG_SceneGraph.vcproj
projectfiles_vc9/gameengine/videotexture/TEX_Video.vcproj
projectfiles_vc9/kernel/gen_messaging/gen_messaging.vcproj
projectfiles_vc9/kernel/system/SYS_system.vcproj
release/ui/buttons_data_bone.py
release/ui/buttons_object_constraint.py
source/blender/CMakeLists.txt
source/blender/Makefile
source/blender/SConscript
source/blender/blenkernel/BKE_action.h
source/blender/blenkernel/BKE_armature.h
source/blender/blenkernel/BKE_constraint.h
source/blender/blenkernel/CMakeLists.txt
source/blender/blenkernel/SConscript
source/blender/blenkernel/intern/Makefile
source/blender/blenkernel/intern/action.c
source/blender/blenkernel/intern/armature.c
source/blender/blenkernel/intern/constraint.c
source/blender/blenkernel/intern/pointcache.c
source/blender/blenkernel/intern/sca.c
source/blender/blenlib/BLI_ghash.h
source/blender/blenloader/intern/readfile.c
source/blender/blenloader/intern/writefile.c
source/blender/editors/CMakeLists.txt
source/blender/editors/armature/editarmature.c
source/blender/editors/armature/poseobject.c
source/blender/editors/include/ED_object.h
source/blender/editors/interface/interface_templates.c
source/blender/editors/object/Makefile
source/blender/editors/object/SConscript
source/blender/editors/object/object_constraint.c
source/blender/editors/space_logic/logic_window.c
source/blender/ikplugin/BIK_api.h [new file with mode: 0644]
source/blender/ikplugin/CMakeLists.txt [new file with mode: 0644]
source/blender/ikplugin/Makefile [new file with mode: 0644]
source/blender/ikplugin/SConscript [new file with mode: 0644]
source/blender/ikplugin/intern/Makefile [new file with mode: 0644]
source/blender/ikplugin/intern/ikplugin_api.c [new file with mode: 0644]
source/blender/ikplugin/intern/ikplugin_api.h [new file with mode: 0644]
source/blender/ikplugin/intern/iksolver_plugin.c [new file with mode: 0644]
source/blender/ikplugin/intern/iksolver_plugin.h [new file with mode: 0644]
source/blender/ikplugin/intern/itasc_plugin.cpp [new file with mode: 0644]
source/blender/ikplugin/intern/itasc_plugin.h [new file with mode: 0644]
source/blender/makesdna/DNA_action_types.h
source/blender/makesdna/DNA_actuator_types.h
source/blender/makesdna/DNA_constraint_types.h
source/blender/makesdna/DNA_sensor_types.h
source/blender/makesrna/RNA_access.h
source/blender/makesrna/SConscript
source/blender/makesrna/intern/CMakeLists.txt
source/blender/makesrna/intern/Makefile
source/blender/makesrna/intern/SConscript
source/blender/makesrna/intern/rna_actuator.c
source/blender/makesrna/intern/rna_constraint.c
source/blender/makesrna/intern/rna_pose.c
source/blender/makesrna/intern/rna_sensor.c
source/gameengine/Converter/BL_ActionActuator.cpp
source/gameengine/Converter/BL_ActionActuator.h
source/gameengine/Converter/BL_ArmatureActuator.cpp [new file with mode: 0644]
source/gameengine/Converter/BL_ArmatureActuator.h [new file with mode: 0644]
source/gameengine/Converter/BL_ArmatureChannel.cpp [new file with mode: 0644]
source/gameengine/Converter/BL_ArmatureChannel.h [new file with mode: 0644]
source/gameengine/Converter/BL_ArmatureConstraint.cpp [new file with mode: 0644]
source/gameengine/Converter/BL_ArmatureConstraint.h [new file with mode: 0644]
source/gameengine/Converter/BL_ArmatureObject.cpp
source/gameengine/Converter/BL_ArmatureObject.h
source/gameengine/Converter/BL_BlenderDataConversion.cpp
source/gameengine/Converter/BL_ShapeActionActuator.h
source/gameengine/Converter/CMakeLists.txt
source/gameengine/Converter/KX_ConvertActuators.cpp
source/gameengine/Converter/KX_ConvertSensors.cpp
source/gameengine/Converter/Makefile
source/gameengine/Converter/SConscript
source/gameengine/Expressions/CMakeLists.txt
source/gameengine/Expressions/PyObjectPlus.cpp
source/gameengine/Expressions/PyObjectPlus.h
source/gameengine/Expressions/SConscript
source/gameengine/GameLogic/SCA_2DFilterActuator.cpp
source/gameengine/GameLogic/SCA_BasicEventManager.cpp [new file with mode: 0644]
source/gameengine/GameLogic/SCA_BasicEventManager.h [new file with mode: 0644]
source/gameengine/GameLogic/SCA_EventManager.h
source/gameengine/GameLogic/SCA_IActuator.cpp
source/gameengine/GameLogic/SCA_IActuator.h
source/gameengine/GameLogic/SCA_IObject.cpp
source/gameengine/GameLogic/SCA_IObject.h
source/gameengine/GameLogic/SCA_PropertyActuator.cpp
source/gameengine/GameLogic/SCA_RandomActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KXNetwork/KX_NetworkMessageActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_ArmatureSensor.cpp [new file with mode: 0644]
source/gameengine/Ketsji/KX_ArmatureSensor.h [new file with mode: 0644]
source/gameengine/Ketsji/KX_CameraActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_ConstraintActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_GameActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_GameObject.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_GameObject.h
source/gameengine/Ketsji/KX_IpoActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_KetsjiEngine.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_KetsjiEngine.h
source/gameengine/Ketsji/KX_ObjectActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_ParentActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_PythonInit.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_PythonInitTypes.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_PythonSeq.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_PythonSeq.h
source/gameengine/Ketsji/KX_SCA_AddObjectActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_SCA_DynamicActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_SCA_EndObjectActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_SCA_ReplaceMeshActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_Scene.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_SceneActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_SoundActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_StateActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_TrackToActuator.cpp
source/gameengine/Ketsji/KX_VisibilityActuator.cpp
source/gameengine/PyDoc/GameTypes.py
source/gameengine/SceneGraph/SG_DList.h

diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/Array b/extern/Eigen2/Eigen/Array
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c847f95
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,39 @@
+#ifndef EIGEN_ARRAY_MODULE_H
+#define EIGEN_ARRAY_MODULE_H
+
+#include "Core"
+
+#include "src/Core/util/DisableMSVCWarnings.h"
+
+namespace Eigen {
+
+/** \defgroup Array_Module Array module
+  * This module provides several handy features to manipulate matrices as simple array of values.
+  * In addition to listed classes, it defines various methods of the Cwise interface
+  * (accessible from MatrixBase::cwise()), including:
+  *  - matrix-scalar sum,
+  *  - coeff-wise comparison operators,
+  *  - sin, cos, sqrt, pow, exp, log, square, cube, inverse (reciprocal).
+  *
+  * This module also provides various MatrixBase methods, including:
+  *  - \ref MatrixBase::all() "all", \ref MatrixBase::any() "any",
+  *  - \ref MatrixBase::Random() "random matrix initialization"
+  *
+  * \code
+  * #include <Eigen/Array>
+  * \endcode
+  */
+
+#include "src/Array/CwiseOperators.h"
+#include "src/Array/Functors.h"
+#include "src/Array/BooleanRedux.h"
+#include "src/Array/Select.h"
+#include "src/Array/PartialRedux.h"
+#include "src/Array/Random.h"
+#include "src/Array/Norms.h"
+
+} // namespace Eigen
+
+#include "src/Core/util/EnableMSVCWarnings.h"
+
+#endif // EIGEN_ARRAY_MODULE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/Cholesky b/extern/Eigen2/Eigen/Cholesky
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f1806f7
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,65 @@
+#ifndef EIGEN_CHOLESKY_MODULE_H
+#define EIGEN_CHOLESKY_MODULE_H
+
+#include "Core"
+
+#include "src/Core/util/DisableMSVCWarnings.h"
+
+// Note that EIGEN_HIDE_HEAVY_CODE has to be defined per module
+#if (defined EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS) && (EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS>=2)
+  #ifndef EIGEN_HIDE_HEAVY_CODE
+  #define EIGEN_HIDE_HEAVY_CODE
+  #endif
+#elif defined EIGEN_HIDE_HEAVY_CODE
+  #undef EIGEN_HIDE_HEAVY_CODE
+#endif
+
+namespace Eigen {
+
+/** \defgroup Cholesky_Module Cholesky module
+  *
+  * \nonstableyet
+  *
+  * This module provides two variants of the Cholesky decomposition for selfadjoint (hermitian) matrices.
+  * Those decompositions are accessible via the following MatrixBase methods:
+  *  - MatrixBase::llt(),
+  *  - MatrixBase::ldlt()
+  *
+  * \code
+  * #include <Eigen/Cholesky>
+  * \endcode
+  */
+
+#include "src/Array/CwiseOperators.h"
+#include "src/Array/Functors.h"
+#include "src/Cholesky/LLT.h"
+#include "src/Cholesky/LDLT.h"
+
+} // namespace Eigen
+
+#define EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(MATRIXTYPE,PREFIX) \
+  PREFIX template class LLT<MATRIXTYPE>; \
+  PREFIX template class LDLT<MATRIXTYPE>
+
+#define EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE(PREFIX) \
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix2f,PREFIX); \
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix2d,PREFIX); \
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix3f,PREFIX); \
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix3d,PREFIX); \
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix4f,PREFIX); \
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix4d,PREFIX); \
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(MatrixXf,PREFIX); \
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(MatrixXd,PREFIX); \
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(MatrixXcf,PREFIX); \
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(MatrixXcd,PREFIX)
+
+#ifdef EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS
+
+namespace Eigen {
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE(extern);
+} // namespace Eigen
+#endif
+
+#include "src/Core/util/EnableMSVCWarnings.h"
+
+#endif // EIGEN_CHOLESKY_MODULE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/Core b/extern/Eigen2/Eigen/Core
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f5e315a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,154 @@
+#ifndef EIGEN_CORE_H
+#define EIGEN_CORE_H
+
+// first thing Eigen does: prevent MSVC from committing suicide
+#include "src/Core/util/DisableMSVCWarnings.h"
+
+#ifdef _MSC_VER
+  #include <malloc.h> // for _aligned_malloc -- need it regardless of whether vectorization is enabled
+  #if (_MSC_VER >= 1500) // 2008 or later
+    // Remember that usage of defined() in a #define is undefined by the standard.
+    // a user reported that in 64-bit mode, MSVC doesn't care to define _M_IX86_FP.
+    #if (defined(_M_IX86_FP) && (_M_IX86_FP >= 2)) || defined(_M_X64)
+      #define EIGEN_SSE2_ON_MSVC_2008_OR_LATER
+    #endif   
+  #endif
+#endif
+
+#ifdef __GNUC__
+  #define EIGEN_GNUC_AT_LEAST(x,y) ((__GNUC__>=x && __GNUC_MINOR__>=y) || __GNUC__>x)
+#else
+  #define EIGEN_GNUC_AT_LEAST(x,y) 0
+#endif
+
+// Remember that usage of defined() in a #define is undefined by the standard
+#if (defined __SSE2__) && ( (!defined __GNUC__) || EIGEN_GNUC_AT_LEAST(4,2) )
+  #define EIGEN_SSE2_BUT_NOT_OLD_GCC
+#endif
+
+#ifndef EIGEN_DONT_VECTORIZE
+  #if defined (EIGEN_SSE2_BUT_NOT_OLD_GCC) || defined(EIGEN_SSE2_ON_MSVC_2008_OR_LATER)
+    #define EIGEN_VECTORIZE
+    #define EIGEN_VECTORIZE_SSE
+    #include <emmintrin.h>
+    #include <xmmintrin.h>
+    #ifdef __SSE3__
+      #include <pmmintrin.h>
+    #endif
+    #ifdef __SSSE3__
+      #include <tmmintrin.h>
+    #endif
+  #elif defined __ALTIVEC__
+    #define EIGEN_VECTORIZE
+    #define EIGEN_VECTORIZE_ALTIVEC
+    #include <altivec.h>
+    // We need to #undef all these ugly tokens defined in <altivec.h>
+    // => use __vector instead of vector
+    #undef bool
+    #undef vector
+    #undef pixel
+  #endif
+#endif
+
+#include <cstdlib>
+#include <cmath>
+#include <complex>
+#include <cassert>
+#include <functional>
+#include <iostream>
+#include <cstring>
+#include <string>
+#include <limits>
+
+#if (defined(_CPPUNWIND) || defined(__EXCEPTIONS)) && !defined(EIGEN_NO_EXCEPTIONS)
+  #define EIGEN_EXCEPTIONS
+#endif
+
+#ifdef EIGEN_EXCEPTIONS
+  #include <new>
+#endif
+
+// this needs to be done after all possible windows C header includes and before any Eigen source includes
+// (system C++ includes are supposed to be able to deal with this already):
+// windows.h defines min and max macros which would make Eigen fail to compile.
+#if defined(min) || defined(max)
+#error The preprocessor symbols 'min' or 'max' are defined. If you are compiling on Windows, do #define NOMINMAX to prevent windows.h from defining these symbols.
+#endif
+
+namespace Eigen {
+
+/** \defgroup Core_Module Core module
+  * This is the main module of Eigen providing dense matrix and vector support
+  * (both fixed and dynamic size) with all the features corresponding to a BLAS library
+  * and much more...
+  *
+  * \code
+  * #include <Eigen/Core>
+  * \endcode
+  */
+
+#include "src/Core/util/Macros.h"
+#include "src/Core/util/Constants.h"
+#include "src/Core/util/ForwardDeclarations.h"
+#include "src/Core/util/Meta.h"
+#include "src/Core/util/XprHelper.h"
+#include "src/Core/util/StaticAssert.h"
+#include "src/Core/util/Memory.h"
+
+#include "src/Core/NumTraits.h"
+#include "src/Core/MathFunctions.h"
+#include "src/Core/GenericPacketMath.h"
+
+#if defined EIGEN_VECTORIZE_SSE
+  #include "src/Core/arch/SSE/PacketMath.h"
+#elif defined EIGEN_VECTORIZE_ALTIVEC
+  #include "src/Core/arch/AltiVec/PacketMath.h"
+#endif
+
+#ifndef EIGEN_CACHEFRIENDLY_PRODUCT_THRESHOLD
+#define EIGEN_CACHEFRIENDLY_PRODUCT_THRESHOLD 16
+#endif
+
+#include "src/Core/Functors.h"
+#include "src/Core/MatrixBase.h"
+#include "src/Core/Coeffs.h"
+
+#ifndef EIGEN_PARSED_BY_DOXYGEN // work around Doxygen bug triggered by Assign.h r814874
+                                // at least confirmed with Doxygen 1.5.5 and 1.5.6
+  #include "src/Core/Assign.h"
+#endif
+
+#include "src/Core/MatrixStorage.h"
+#include "src/Core/NestByValue.h"
+#include "src/Core/Flagged.h"
+#include "src/Core/Matrix.h"
+#include "src/Core/Cwise.h"
+#include "src/Core/CwiseBinaryOp.h"
+#include "src/Core/CwiseUnaryOp.h"
+#include "src/Core/CwiseNullaryOp.h"
+#include "src/Core/Dot.h"
+#include "src/Core/Product.h"
+#include "src/Core/DiagonalProduct.h"
+#include "src/Core/SolveTriangular.h"
+#include "src/Core/MapBase.h"
+#include "src/Core/Map.h"
+#include "src/Core/Block.h"
+#include "src/Core/Minor.h"
+#include "src/Core/Transpose.h"
+#include "src/Core/DiagonalMatrix.h"
+#include "src/Core/DiagonalCoeffs.h"
+#include "src/Core/Sum.h"
+#include "src/Core/Redux.h"
+#include "src/Core/Visitor.h"
+#include "src/Core/Fuzzy.h"
+#include "src/Core/IO.h"
+#include "src/Core/Swap.h"
+#include "src/Core/CommaInitializer.h"
+#include "src/Core/Part.h"
+#include "src/Core/CacheFriendlyProduct.h"
+
+} // namespace Eigen
+
+#include "src/Core/util/EnableMSVCWarnings.h"
+
+#endif // EIGEN_CORE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/Dense b/extern/Eigen2/Eigen/Dense
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9655edc
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,8 @@
+#include "Core"
+#include "Array"
+#include "LU"
+#include "Cholesky"
+#include "QR"
+#include "SVD"
+#include "Geometry"
+#include "LeastSquares"
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/Eigen b/extern/Eigen2/Eigen/Eigen
new file mode 100644 (file)
index 0000000..654c8dc
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,2 @@
+#include "Dense"
+#include "Sparse"
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/Geometry b/extern/Eigen2/Eigen/Geometry
new file mode 100644 (file)
index 0000000..617b25e
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,51 @@
+#ifndef EIGEN_GEOMETRY_MODULE_H
+#define EIGEN_GEOMETRY_MODULE_H
+
+#include "Core"
+
+#include "src/Core/util/DisableMSVCWarnings.h"
+
+#include "Array"
+#include <limits>
+
+#ifndef M_PI
+#define M_PI 3.14159265358979323846
+#endif
+
+namespace Eigen {
+
+/** \defgroup Geometry_Module Geometry module
+  *
+  * \nonstableyet
+  *
+  * This module provides support for:
+  *  - fixed-size homogeneous transformations
+  *  - translation, scaling, 2D and 3D rotations
+  *  - quaternions
+  *  - \ref MatrixBase::cross() "cross product"
+  *  - \ref MatrixBase::unitOrthogonal() "orthognal vector generation"
+  *  - some linear components: parametrized-lines and hyperplanes
+  *
+  * \code
+  * #include <Eigen/Geometry>
+  * \endcode
+  */
+
+#include "src/Geometry/OrthoMethods.h"
+#include "src/Geometry/RotationBase.h"
+#include "src/Geometry/Rotation2D.h"
+#include "src/Geometry/Quaternion.h"
+#include "src/Geometry/AngleAxis.h"
+#include "src/Geometry/EulerAngles.h"
+#include "src/Geometry/Transform.h"
+#include "src/Geometry/Translation.h"
+#include "src/Geometry/Scaling.h"
+#include "src/Geometry/Hyperplane.h"
+#include "src/Geometry/ParametrizedLine.h"
+#include "src/Geometry/AlignedBox.h"
+
+} // namespace Eigen
+
+#include "src/Core/util/EnableMSVCWarnings.h"
+
+#endif // EIGEN_GEOMETRY_MODULE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/LU b/extern/Eigen2/Eigen/LU
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0ce6945
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,29 @@
+#ifndef EIGEN_LU_MODULE_H
+#define EIGEN_LU_MODULE_H
+
+#include "Core"
+
+#include "src/Core/util/DisableMSVCWarnings.h"
+
+namespace Eigen {
+
+/** \defgroup LU_Module LU module
+  * This module includes %LU decomposition and related notions such as matrix inversion and determinant.
+  * This module defines the following MatrixBase methods:
+  *  - MatrixBase::inverse()
+  *  - MatrixBase::determinant()
+  *
+  * \code
+  * #include <Eigen/LU>
+  * \endcode
+  */
+
+#include "src/LU/LU.h"
+#include "src/LU/Determinant.h"
+#include "src/LU/Inverse.h"
+
+} // namespace Eigen
+
+#include "src/Core/util/EnableMSVCWarnings.h"
+
+#endif // EIGEN_LU_MODULE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/LeastSquares b/extern/Eigen2/Eigen/LeastSquares
new file mode 100644 (file)
index 0000000..573a13c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,27 @@
+#ifndef EIGEN_REGRESSION_MODULE_H
+#define EIGEN_REGRESSION_MODULE_H
+
+#include "Core"
+
+#include "src/Core/util/DisableMSVCWarnings.h"
+
+#include "QR"
+#include "Geometry"
+
+namespace Eigen {
+
+/** \defgroup LeastSquares_Module LeastSquares module
+  * This module provides linear regression and related features.
+  *
+  * \code
+  * #include <Eigen/LeastSquares>
+  * \endcode
+  */
+
+#include "src/LeastSquares/LeastSquares.h"
+
+} // namespace Eigen
+
+#include "src/Core/util/EnableMSVCWarnings.h"
+
+#endif // EIGEN_REGRESSION_MODULE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/NewStdVector b/extern/Eigen2/Eigen/NewStdVector
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f37de5f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,168 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra.
+//
+// Copyright (C) 2009 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+// Copyright (C) 2009 Hauke Heibel <hauke.heibel@googlemail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_STDVECTOR_MODULE_H
+#define EIGEN_STDVECTOR_MODULE_H
+
+#include "Core"
+#include <vector>
+
+namespace Eigen {
+
+// This one is needed to prevent reimplementing the whole std::vector.
+template <class T>
+class aligned_allocator_indirection : public aligned_allocator<T>
+{
+public:
+  typedef size_t    size_type;
+  typedef ptrdiff_t difference_type;
+  typedef T*        pointer;
+  typedef const T*  const_pointer;
+  typedef T&        reference;
+  typedef const T&  const_reference;
+  typedef T         value_type;
+
+  template<class U>
+  struct rebind
+  {
+    typedef aligned_allocator_indirection<U> other;
+  };
+
+  aligned_allocator_indirection() throw() {}
+  aligned_allocator_indirection(const aligned_allocator_indirection& ) throw() : aligned_allocator<T>() {}
+  aligned_allocator_indirection(const aligned_allocator<T>& ) throw() {}
+  template<class U>
+  aligned_allocator_indirection(const aligned_allocator_indirection<U>& ) throw() {}
+  template<class U>
+  aligned_allocator_indirection(const aligned_allocator<U>& ) throw() {}
+  ~aligned_allocator_indirection() throw() {}
+};
+
+#ifdef _MSC_VER
+
+  // sometimes, MSVC detects, at compile time, that the argument x
+  // in std::vector::resize(size_t s,T x) won't be aligned and generate an error
+  // even if this function is never called. Whence this little wrapper.
+  #define EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T) Eigen::ei_workaround_msvc_std_vector<T>
+  template<typename T> struct ei_workaround_msvc_std_vector : public T
+  {
+    inline ei_workaround_msvc_std_vector() : T() {}
+    inline ei_workaround_msvc_std_vector(const T& other) : T(other) {}
+    inline operator T& () { return *static_cast<T*>(this); }
+    inline operator const T& () const { return *static_cast<const T*>(this); }
+    template<typename OtherT>
+    inline T& operator=(const OtherT& other)
+    { T::operator=(other); return *this; }
+    inline ei_workaround_msvc_std_vector& operator=(const ei_workaround_msvc_std_vector& other)
+    { T::operator=(other); return *this; }
+  };
+
+#else
+
+  #define EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T) T
+
+#endif
+
+}
+
+namespace std {
+
+#define EIGEN_STD_VECTOR_SPECIALIZATION_BODY \
+  public:  \
+    typedef T value_type; \
+    typedef typename vector_base::allocator_type allocator_type; \
+    typedef typename vector_base::size_type size_type;  \
+    typedef typename vector_base::iterator iterator;  \
+    typedef typename vector_base::const_iterator const_iterator;  \
+    explicit vector(const allocator_type& a = allocator_type()) : vector_base(a) {}  \
+    template<typename InputIterator> \
+    vector(InputIterator first, InputIterator last, const allocator_type& a = allocator_type()) \
+    : vector_base(first, last, a) {} \
+    vector(const vector& c) : vector_base(c) {}  \
+    explicit vector(size_type num, const value_type& val = value_type()) : vector_base(num, val) {} \
+    vector(iterator start, iterator end) : vector_base(start, end) {}  \
+    vector& operator=(const vector& x) {  \
+      vector_base::operator=(x);  \
+      return *this;  \
+    }
+
+template<typename T>
+class vector<T,Eigen::aligned_allocator<T> >
+  : public vector<EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T),
+                  Eigen::aligned_allocator_indirection<EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T)> >
+{
+  typedef vector<EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T),
+                 Eigen::aligned_allocator_indirection<EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T)> > vector_base;
+  EIGEN_STD_VECTOR_SPECIALIZATION_BODY
+
+  void resize(size_type new_size)
+  { resize(new_size, T()); }
+
+#if defined(_VECTOR_)
+  // workaround MSVC std::vector implementation
+  void resize(size_type new_size, const value_type& x)
+  {
+    if (vector_base::size() < new_size)
+      vector_base::_Insert_n(vector_base::end(), new_size - vector_base::size(), x);
+    else if (new_size < vector_base::size())
+      vector_base::erase(vector_base::begin() + new_size, vector_base::end());
+  }
+  void push_back(const value_type& x)
+  { vector_base::push_back(x); } 
+  using vector_base::insert;  
+  iterator insert(const_iterator position, const value_type& x)
+  { return vector_base::insert(position,x); }
+  void insert(const_iterator position, size_type new_size, const value_type& x)
+  { vector_base::insert(position, new_size, x); }
+#elif defined(_GLIBCXX_VECTOR) && EIGEN_GNUC_AT_LEAST(4,2)
+  // workaround GCC std::vector implementation
+  void resize(size_type new_size, const value_type& x)
+  {
+    if (new_size < vector_base::size())
+      vector_base::_M_erase_at_end(this->_M_impl._M_start + new_size);
+    else
+      vector_base::insert(vector_base::end(), new_size - vector_base::size(), x);
+  }
+#elif defined(_GLIBCXX_VECTOR) && (!EIGEN_GNUC_AT_LEAST(4,1))
+  // Note that before gcc-4.1 we already have: std::vector::resize(size_type,const T&),
+  // no no need to workaround !
+  using vector_base::resize;
+#else
+  // either GCC 4.1 or non-GCC
+  // default implementation which should always work.
+  void resize(size_type new_size, const value_type& x)
+  {
+    if (new_size < vector_base::size())
+      vector_base::erase(vector_base::begin() + new_size, vector_base::end());
+    else if (new_size > vector_base::size())
+      vector_base::insert(vector_base::end(), new_size - vector_base::size(), x);
+  }
+#endif
+
+};
+
+}
+
+#endif // EIGEN_STDVECTOR_MODULE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/QR b/extern/Eigen2/Eigen/QR
new file mode 100644 (file)
index 0000000..97907d1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,73 @@
+#ifndef EIGEN_QR_MODULE_H
+#define EIGEN_QR_MODULE_H
+
+#include "Core"
+
+#include "src/Core/util/DisableMSVCWarnings.h"
+
+#include "Cholesky"
+
+// Note that EIGEN_HIDE_HEAVY_CODE has to be defined per module
+#if (defined EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS) && (EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS>=2)
+  #ifndef EIGEN_HIDE_HEAVY_CODE
+  #define EIGEN_HIDE_HEAVY_CODE
+  #endif
+#elif defined EIGEN_HIDE_HEAVY_CODE
+  #undef EIGEN_HIDE_HEAVY_CODE
+#endif
+
+namespace Eigen {
+
+/** \defgroup QR_Module QR module
+  *
+  * \nonstableyet
+  *
+  * This module mainly provides QR decomposition and an eigen value solver.
+  * This module also provides some MatrixBase methods, including:
+  *  - MatrixBase::qr(),
+  *  - MatrixBase::eigenvalues(),
+  *  - MatrixBase::operatorNorm()
+  *
+  * \code
+  * #include <Eigen/QR>
+  * \endcode
+  */
+
+#include "src/QR/QR.h"
+#include "src/QR/Tridiagonalization.h"
+#include "src/QR/EigenSolver.h"
+#include "src/QR/SelfAdjointEigenSolver.h"
+#include "src/QR/HessenbergDecomposition.h"
+
+// declare all classes for a given matrix type
+#define EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(MATRIXTYPE,PREFIX) \
+  PREFIX template class QR<MATRIXTYPE>; \
+  PREFIX template class Tridiagonalization<MATRIXTYPE>; \
+  PREFIX template class HessenbergDecomposition<MATRIXTYPE>; \
+  PREFIX template class SelfAdjointEigenSolver<MATRIXTYPE>
+
+// removed because it does not support complex yet
+//  PREFIX template class EigenSolver<MATRIXTYPE>
+
+// declare all class for all types
+#define EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE(PREFIX) \
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix2f,PREFIX); \
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix2d,PREFIX); \
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix3f,PREFIX); \
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix3d,PREFIX); \
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix4f,PREFIX); \
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(Matrix4d,PREFIX); \
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(MatrixXf,PREFIX); \
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(MatrixXd,PREFIX); \
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(MatrixXcf,PREFIX); \
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE_TYPE(MatrixXcd,PREFIX)
+
+#ifdef EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS
+  EIGEN_QR_MODULE_INSTANTIATE(extern);
+#endif // EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS
+
+} // namespace Eigen
+
+#include "src/Core/util/EnableMSVCWarnings.h"
+
+#endif // EIGEN_QR_MODULE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/QtAlignedMalloc b/extern/Eigen2/Eigen/QtAlignedMalloc
new file mode 100644 (file)
index 0000000..fde2273
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,29 @@
+
+#ifndef EIGEN_QTMALLOC_MODULE_H
+#define EIGEN_QTMALLOC_MODULE_H
+
+#include "Core"
+
+#if (!EIGEN_MALLOC_ALREADY_ALIGNED)
+
+inline void *qMalloc(size_t size)
+{
+  return Eigen::ei_aligned_malloc(size);
+}
+
+inline void qFree(void *ptr)
+{
+  Eigen::ei_aligned_free(ptr);
+}
+
+inline void *qRealloc(void *ptr, size_t size)
+{
+  void* newPtr = Eigen::ei_aligned_malloc(size);
+  memcpy(newPtr, ptr, size);
+  Eigen::ei_aligned_free(ptr);
+  return newPtr;
+}
+
+#endif
+
+#endif // EIGEN_QTMALLOC_MODULE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/SVD b/extern/Eigen2/Eigen/SVD
new file mode 100644 (file)
index 0000000..eef0556
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,29 @@
+#ifndef EIGEN_SVD_MODULE_H
+#define EIGEN_SVD_MODULE_H
+
+#include "Core"
+
+#include "src/Core/util/DisableMSVCWarnings.h"
+
+namespace Eigen {
+
+/** \defgroup SVD_Module SVD module
+  *
+  * \nonstableyet
+  *
+  * This module provides SVD decomposition for (currently) real matrices.
+  * This decomposition is accessible via the following MatrixBase method:
+  *  - MatrixBase::svd()
+  *
+  * \code
+  * #include <Eigen/SVD>
+  * \endcode
+  */
+
+#include "src/SVD/SVD.h"
+
+} // namespace Eigen
+
+#include "src/Core/util/EnableMSVCWarnings.h"
+
+#endif // EIGEN_SVD_MODULE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/Sparse b/extern/Eigen2/Eigen/Sparse
new file mode 100644 (file)
index 0000000..536c284
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,132 @@
+#ifndef EIGEN_SPARSE_MODULE_H
+#define EIGEN_SPARSE_MODULE_H
+
+#include "Core"
+
+#include "src/Core/util/DisableMSVCWarnings.h"
+
+#include <vector>
+#include <map>
+#include <cstdlib>
+#include <cstring>
+#include <algorithm>
+
+#ifdef EIGEN_GOOGLEHASH_SUPPORT
+  #include <google/dense_hash_map>
+#endif
+
+#ifdef EIGEN_CHOLMOD_SUPPORT
+  extern "C" {
+    #include "cholmod.h"
+  }
+#endif
+
+#ifdef EIGEN_TAUCS_SUPPORT
+  // taucs.h declares a lot of mess
+  #define isnan
+  #define finite
+  #define isinf
+  extern "C" {
+    #include "taucs.h"
+  }
+  #undef isnan
+  #undef finite
+  #undef isinf
+
+  #ifdef min
+    #undef min
+  #endif
+  #ifdef max
+    #undef max
+  #endif
+  #ifdef complex
+    #undef complex
+  #endif
+#endif
+
+#ifdef EIGEN_SUPERLU_SUPPORT
+  typedef int int_t;
+  #include "superlu/slu_Cnames.h"
+  #include "superlu/supermatrix.h"
+  #include "superlu/slu_util.h"
+
+  namespace SuperLU_S {
+  #include "superlu/slu_sdefs.h"
+  }
+  namespace SuperLU_D {
+  #include "superlu/slu_ddefs.h"
+  }
+  namespace SuperLU_C {
+  #include "superlu/slu_cdefs.h"
+  }
+  namespace SuperLU_Z {
+  #include "superlu/slu_zdefs.h"
+  }
+  namespace Eigen { struct SluMatrix; }
+#endif
+
+#ifdef EIGEN_UMFPACK_SUPPORT
+  #include "umfpack.h"
+#endif
+
+namespace Eigen {
+
+/** \defgroup Sparse_Module Sparse module
+  *
+  * \nonstableyet
+  *
+  * See the \ref TutorialSparse "Sparse tutorial"
+  *
+  * \code
+  * #include <Eigen/QR>
+  * \endcode
+  */
+
+#include "src/Sparse/SparseUtil.h"
+#include "src/Sparse/SparseMatrixBase.h"
+#include "src/Sparse/CompressedStorage.h"
+#include "src/Sparse/AmbiVector.h"
+#include "src/Sparse/RandomSetter.h"
+#include "src/Sparse/SparseBlock.h"
+#include "src/Sparse/SparseMatrix.h"
+#include "src/Sparse/DynamicSparseMatrix.h"
+#include "src/Sparse/MappedSparseMatrix.h"
+#include "src/Sparse/SparseVector.h"
+#include "src/Sparse/CoreIterators.h"
+#include "src/Sparse/SparseTranspose.h"
+#include "src/Sparse/SparseCwise.h"
+#include "src/Sparse/SparseCwiseUnaryOp.h"
+#include "src/Sparse/SparseCwiseBinaryOp.h"
+#include "src/Sparse/SparseDot.h"
+#include "src/Sparse/SparseAssign.h"
+#include "src/Sparse/SparseRedux.h"
+#include "src/Sparse/SparseFuzzy.h"
+#include "src/Sparse/SparseFlagged.h"
+#include "src/Sparse/SparseProduct.h"
+#include "src/Sparse/SparseDiagonalProduct.h"
+#include "src/Sparse/TriangularSolver.h"
+#include "src/Sparse/SparseLLT.h"
+#include "src/Sparse/SparseLDLT.h"
+#include "src/Sparse/SparseLU.h"
+
+#ifdef EIGEN_CHOLMOD_SUPPORT
+# include "src/Sparse/CholmodSupport.h"
+#endif
+
+#ifdef EIGEN_TAUCS_SUPPORT
+# include "src/Sparse/TaucsSupport.h"
+#endif
+
+#ifdef EIGEN_SUPERLU_SUPPORT
+# include "src/Sparse/SuperLUSupport.h"
+#endif
+
+#ifdef EIGEN_UMFPACK_SUPPORT
+# include "src/Sparse/UmfPackSupport.h"
+#endif
+
+} // namespace Eigen
+
+#include "src/Core/util/EnableMSVCWarnings.h"
+
+#endif // EIGEN_SPARSE_MODULE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/StdVector b/extern/Eigen2/Eigen/StdVector
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c0744d6
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,147 @@
+#ifdef EIGEN_USE_NEW_STDVECTOR
+#include "NewStdVector"
+#else
+
+#ifndef EIGEN_STDVECTOR_MODULE_H
+#define EIGEN_STDVECTOR_MODULE_H
+
+#if defined(_GLIBCXX_VECTOR) || defined(_VECTOR_)
+#error you must include <Eigen/StdVector> before <vector>. Also note that <Eigen/Sparse> includes <vector>, so it must be included after <Eigen/StdVector> too.
+#endif                                                    
+
+#ifndef EIGEN_GNUC_AT_LEAST
+#ifdef __GNUC__
+  #define EIGEN_GNUC_AT_LEAST(x,y) ((__GNUC__>=x && __GNUC_MINOR__>=y) || __GNUC__>x)
+#else
+  #define EIGEN_GNUC_AT_LEAST(x,y) 0
+#endif
+#endif
+
+#define vector std_vector
+#include <vector>        
+#undef vector
+
+namespace Eigen {
+
+template<typename T> class aligned_allocator;
+
+// meta programming to determine if a class has a given member
+struct ei_does_not_have_aligned_operator_new_marker_sizeof {int a[1];};
+struct ei_has_aligned_operator_new_marker_sizeof {int a[2];};
+
+template<typename ClassType>
+struct ei_has_aligned_operator_new {
+    template<typename T>
+    static ei_has_aligned_operator_new_marker_sizeof
+    test(T const *, typename T::ei_operator_new_marker_type const * = 0);
+    static ei_does_not_have_aligned_operator_new_marker_sizeof
+    test(...);
+
+    // note that the following indirection is needed for gcc-3.3
+    enum {ret =  sizeof(test(static_cast<ClassType*>(0))) 
+              == sizeof(ei_has_aligned_operator_new_marker_sizeof) };
+};
+
+#ifdef _MSC_VER
+  
+  // sometimes, MSVC detects, at compile time, that the argument x
+  // in std::vector::resize(size_t s,T x) won't be aligned and generate an error
+  // even if this function is never called. Whence this little wrapper.
+  #define _EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T) Eigen::ei_workaround_msvc_std_vector<T>
+  template<typename T> struct ei_workaround_msvc_std_vector : public T
+  {
+    inline ei_workaround_msvc_std_vector() : T() {}
+    inline ei_workaround_msvc_std_vector(const T& other) : T(other) {}
+    inline operator T& () { return *static_cast<T*>(this); }
+    inline operator const T& () const { return *static_cast<const T*>(this); }
+    template<typename OtherT>
+    inline T& operator=(const OtherT& other)
+    { T::operator=(other); return *this; }
+    inline ei_workaround_msvc_std_vector& operator=(const ei_workaround_msvc_std_vector& other)
+    { T::operator=(other); return *this; }
+  };
+
+#else
+
+  #define _EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T) T
+
+#endif
+
+}
+
+namespace std {
+
+#define EIGEN_STD_VECTOR_SPECIALIZATION_BODY \
+  public:  \
+    typedef T value_type; \
+    typedef typename vector_base::allocator_type allocator_type; \
+    typedef typename vector_base::size_type size_type;  \
+    typedef typename vector_base::iterator iterator;  \
+    explicit vector(const allocator_type& __a = allocator_type()) : vector_base(__a) {}  \
+    vector(const vector& c) : vector_base(c) {}  \
+    vector(size_type num, const value_type& val = value_type()) : vector_base(num, val) {} \
+    vector(iterator start, iterator end) : vector_base(start, end) {}  \
+    vector& operator=(const vector& __x) {  \
+      vector_base::operator=(__x);  \
+      return *this;  \
+    }
+
+template<typename T,
+         typename AllocT = std::allocator<T>,
+         bool HasAlignedNew = Eigen::ei_has_aligned_operator_new<T>::ret>
+class vector : public std::std_vector<T,AllocT>
+{
+  typedef std_vector<T, AllocT> vector_base;
+  EIGEN_STD_VECTOR_SPECIALIZATION_BODY
+};
+
+template<typename T,typename DummyAlloc>
+class vector<T,DummyAlloc,true>
+  : public std::std_vector<_EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T),
+                           Eigen::aligned_allocator<_EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T)> >          
+{
+  typedef std_vector<_EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T),
+                     Eigen::aligned_allocator<_EIGEN_WORKAROUND_MSVC_STD_VECTOR(T)> > vector_base;
+  EIGEN_STD_VECTOR_SPECIALIZATION_BODY
+
+  void resize(size_type __new_size)
+  { resize(__new_size, T()); }     
+
+  #if defined(_VECTOR_)
+  // workaround MSVC std::vector implementation
+  void resize(size_type __new_size, const value_type& __x)                 
+  {                                                              
+    if (vector_base::size() < __new_size)                                 
+      vector_base::_Insert_n(vector_base::end(), __new_size - vector_base::size(), __x);
+    else if (__new_size < vector_base::size())
+      vector_base::erase(vector_base::begin() + __new_size, vector_base::end());
+  }
+  #elif defined(_GLIBCXX_VECTOR) && EIGEN_GNUC_AT_LEAST(4,2)
+  // workaround GCC std::vector implementation
+  void resize(size_type __new_size, const value_type& __x)
+  {                                              
+    if (__new_size < vector_base::size())               
+      vector_base::_M_erase_at_end(this->_M_impl._M_start + __new_size);
+    else                       
+      vector_base::insert(vector_base::end(), __new_size - vector_base::size(), __x); 
+  }                                                              
+  #elif defined(_GLIBCXX_VECTOR) && EIGEN_GNUC_AT_LEAST(4,1)
+  void resize(size_type __new_size, const value_type& __x)
+  {
+    if (__new_size < vector_base::size())
+      vector_base::erase(vector_base::begin() + __new_size, vector_base::end());
+    else
+      vector_base::insert(vector_base::end(), __new_size - vector_base::size(), __x);
+  }
+  #else
+  // Before gcc-4.1 we already have: std::vector::resize(size_type,const T&),
+  // so no need for a workaround !
+  using vector_base::resize;
+  #endif  
+};
+
+}
+
+#endif // EIGEN_STDVECTOR_MODULE_H
+
+#endif // EIGEN_USE_NEW_STDVECTOR
\ No newline at end of file
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/BooleanRedux.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/BooleanRedux.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4e82183
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,145 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_ALLANDANY_H
+#define EIGEN_ALLANDANY_H
+
+template<typename Derived, int UnrollCount>
+struct ei_all_unroller
+{
+  enum {
+    col = (UnrollCount-1) / Derived::RowsAtCompileTime,
+    row = (UnrollCount-1) % Derived::RowsAtCompileTime
+  };
+
+  inline static bool run(const Derived &mat)
+  {
+    return ei_all_unroller<Derived, UnrollCount-1>::run(mat) && mat.coeff(row, col);
+  }
+};
+
+template<typename Derived>
+struct ei_all_unroller<Derived, 1>
+{
+  inline static bool run(const Derived &mat) { return mat.coeff(0, 0); }
+};
+
+template<typename Derived>
+struct ei_all_unroller<Derived, Dynamic>
+{
+  inline static bool run(const Derived &) { return false; }
+};
+
+template<typename Derived, int UnrollCount>
+struct ei_any_unroller
+{
+  enum {
+    col = (UnrollCount-1) / Derived::RowsAtCompileTime,
+    row = (UnrollCount-1) % Derived::RowsAtCompileTime
+  };
+
+  inline static bool run(const Derived &mat)
+  {
+    return ei_any_unroller<Derived, UnrollCount-1>::run(mat) || mat.coeff(row, col);
+  }
+};
+
+template<typename Derived>
+struct ei_any_unroller<Derived, 1>
+{
+  inline static bool run(const Derived &mat) { return mat.coeff(0, 0); }
+};
+
+template<typename Derived>
+struct ei_any_unroller<Derived, Dynamic>
+{
+  inline static bool run(const Derived &) { return false; }
+};
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns true if all coefficients are true
+  *
+  * \addexample CwiseAll \label How to check whether a point is inside a box (using operator< and all())
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_all.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_all.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::any(), Cwise::operator<()
+  */
+template<typename Derived>
+inline bool MatrixBase<Derived>::all() const
+{
+  const bool unroll = SizeAtCompileTime * (CoeffReadCost + NumTraits<Scalar>::AddCost)
+                      <= EIGEN_UNROLLING_LIMIT;
+  if(unroll)
+    return ei_all_unroller<Derived,
+                           unroll ? int(SizeAtCompileTime) : Dynamic
+     >::run(derived());
+  else
+  {
+    for(int j = 0; j < cols(); ++j)
+      for(int i = 0; i < rows(); ++i)
+        if (!coeff(i, j)) return false;
+    return true;
+  }
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns true if at least one coefficient is true
+  *
+  * \sa MatrixBase::all()
+  */
+template<typename Derived>
+inline bool MatrixBase<Derived>::any() const
+{
+  const bool unroll = SizeAtCompileTime * (CoeffReadCost + NumTraits<Scalar>::AddCost)
+                      <= EIGEN_UNROLLING_LIMIT;
+  if(unroll)
+    return ei_any_unroller<Derived,
+                           unroll ? int(SizeAtCompileTime) : Dynamic
+           >::run(derived());
+  else
+  {
+    for(int j = 0; j < cols(); ++j)
+      for(int i = 0; i < rows(); ++i)
+        if (coeff(i, j)) return true;
+    return false;
+  }
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns the number of coefficients which evaluate to true
+  *
+  * \sa MatrixBase::all(), MatrixBase::any()
+  */
+template<typename Derived>
+inline int MatrixBase<Derived>::count() const
+{
+  return this->cast<bool>().cast<int>().sum();
+}
+
+#endif // EIGEN_ALLANDANY_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/CwiseOperators.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/CwiseOperators.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4b6346d
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,453 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_ARRAY_CWISE_OPERATORS_H
+#define EIGEN_ARRAY_CWISE_OPERATORS_H
+
+// -- unary operators --
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise square root of *this.
+  *
+  * Example: \include Cwise_sqrt.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_sqrt.out
+  *
+  * \sa pow(), square()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_sqrt_op)
+Cwise<ExpressionType>::sqrt() const
+{
+  return _expression();
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise exponential of *this.
+  *
+  * Example: \include Cwise_exp.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_exp.out
+  *
+  * \sa pow(), log(), sin(), cos()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_exp_op)
+Cwise<ExpressionType>::exp() const
+{
+  return _expression();
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise logarithm of *this.
+  *
+  * Example: \include Cwise_log.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_log.out
+  *
+  * \sa exp()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_log_op)
+Cwise<ExpressionType>::log() const
+{
+  return _expression();
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise cosine of *this.
+  *
+  * Example: \include Cwise_cos.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_cos.out
+  *
+  * \sa sin(), exp()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_cos_op)
+Cwise<ExpressionType>::cos() const
+{
+  return _expression();
+}
+
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise sine of *this.
+  *
+  * Example: \include Cwise_sin.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_sin.out
+  *
+  * \sa cos(), exp()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_sin_op)
+Cwise<ExpressionType>::sin() const
+{
+  return _expression();
+}
+
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise power of *this to the given exponent.
+  *
+  * Example: \include Cwise_pow.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_pow.out
+  *
+  * \sa exp(), log()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_pow_op)
+Cwise<ExpressionType>::pow(const Scalar& exponent) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_pow_op)(_expression(), ei_scalar_pow_op<Scalar>(exponent));
+}
+
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise inverse of *this.
+  *
+  * Example: \include Cwise_inverse.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_inverse.out
+  *
+  * \sa operator/(), operator*()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_inverse_op)
+Cwise<ExpressionType>::inverse() const
+{
+  return _expression();
+}
+
+/** \array_module
+  *
+  * \returns an expression of the coefficient-wise square of *this.
+  *
+  * Example: \include Cwise_square.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_square.out
+  *
+  * \sa operator/(), operator*(), abs2()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_square_op)
+Cwise<ExpressionType>::square() const
+{
+  return _expression();
+}
+
+/** \array_module
+  *
+  * \returns an expression of the coefficient-wise cube of *this.
+  *
+  * Example: \include Cwise_cube.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_cube.out
+  *
+  * \sa square(), pow()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_cube_op)
+Cwise<ExpressionType>::cube() const
+{
+  return _expression();
+}
+
+
+// -- binary operators --
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise \< operator of *this and \a other
+  *
+  * Example: \include Cwise_less.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_less.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::all(), MatrixBase::any(), operator>(), operator<=()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+inline const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::less)
+Cwise<ExpressionType>::operator<(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::less)(_expression(), other.derived());
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise \<= operator of *this and \a other
+  *
+  * Example: \include Cwise_less_equal.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_less_equal.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::all(), MatrixBase::any(), operator>=(), operator<()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+inline const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::less_equal)
+Cwise<ExpressionType>::operator<=(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::less_equal)(_expression(), other.derived());
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise \> operator of *this and \a other
+  *
+  * Example: \include Cwise_greater.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_greater.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::all(), MatrixBase::any(), operator>=(), operator<()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+inline const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::greater)
+Cwise<ExpressionType>::operator>(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::greater)(_expression(), other.derived());
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise \>= operator of *this and \a other
+  *
+  * Example: \include Cwise_greater_equal.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_greater_equal.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::all(), MatrixBase::any(), operator>(), operator<=()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+inline const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::greater_equal)
+Cwise<ExpressionType>::operator>=(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::greater_equal)(_expression(), other.derived());
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise == operator of *this and \a other
+  *
+  * \warning this performs an exact comparison, which is generally a bad idea with floating-point types.
+  * In order to check for equality between two vectors or matrices with floating-point coefficients, it is
+  * generally a far better idea to use a fuzzy comparison as provided by MatrixBase::isApprox() and
+  * MatrixBase::isMuchSmallerThan().
+  *
+  * Example: \include Cwise_equal_equal.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_equal_equal.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::all(), MatrixBase::any(), MatrixBase::isApprox(), MatrixBase::isMuchSmallerThan()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+inline const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::equal_to)
+Cwise<ExpressionType>::operator==(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::equal_to)(_expression(), other.derived());
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise != operator of *this and \a other
+  *
+  * \warning this performs an exact comparison, which is generally a bad idea with floating-point types.
+  * In order to check for equality between two vectors or matrices with floating-point coefficients, it is
+  * generally a far better idea to use a fuzzy comparison as provided by MatrixBase::isApprox() and
+  * MatrixBase::isMuchSmallerThan().
+  *
+  * Example: \include Cwise_not_equal.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_not_equal.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::all(), MatrixBase::any(), MatrixBase::isApprox(), MatrixBase::isMuchSmallerThan()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+inline const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::not_equal_to)
+Cwise<ExpressionType>::operator!=(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::not_equal_to)(_expression(), other.derived());
+}
+
+// comparisons to scalar value
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise \< operator of *this and a scalar \a s
+  *
+  * \sa operator<(const MatrixBase<OtherDerived> &) const
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::less)
+Cwise<ExpressionType>::operator<(Scalar s) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::less)(_expression(),
+            typename ExpressionType::ConstantReturnType(_expression().rows(), _expression().cols(), s));
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise \<= operator of *this and a scalar \a s
+  *
+  * \sa operator<=(const MatrixBase<OtherDerived> &) const
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::less_equal)
+Cwise<ExpressionType>::operator<=(Scalar s) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::less_equal)(_expression(),
+            typename ExpressionType::ConstantReturnType(_expression().rows(), _expression().cols(), s));
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise \> operator of *this and a scalar \a s
+  *
+  * \sa operator>(const MatrixBase<OtherDerived> &) const
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::greater)
+Cwise<ExpressionType>::operator>(Scalar s) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::greater)(_expression(),
+            typename ExpressionType::ConstantReturnType(_expression().rows(), _expression().cols(), s));
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise \>= operator of *this and a scalar \a s
+  *
+  * \sa operator>=(const MatrixBase<OtherDerived> &) const
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::greater_equal)
+Cwise<ExpressionType>::operator>=(Scalar s) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::greater_equal)(_expression(),
+            typename ExpressionType::ConstantReturnType(_expression().rows(), _expression().cols(), s));
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise == operator of *this and a scalar \a s
+  *
+  * \warning this performs an exact comparison, which is generally a bad idea with floating-point types.
+  * In order to check for equality between two vectors or matrices with floating-point coefficients, it is
+  * generally a far better idea to use a fuzzy comparison as provided by MatrixBase::isApprox() and
+  * MatrixBase::isMuchSmallerThan().
+  *
+  * \sa operator==(const MatrixBase<OtherDerived> &) const
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::equal_to)
+Cwise<ExpressionType>::operator==(Scalar s) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::equal_to)(_expression(),
+            typename ExpressionType::ConstantReturnType(_expression().rows(), _expression().cols(), s));
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns an expression of the coefficient-wise != operator of *this and a scalar \a s
+  *
+  * \warning this performs an exact comparison, which is generally a bad idea with floating-point types.
+  * In order to check for equality between two vectors or matrices with floating-point coefficients, it is
+  * generally a far better idea to use a fuzzy comparison as provided by MatrixBase::isApprox() and
+  * MatrixBase::isMuchSmallerThan().
+  *
+  * \sa operator!=(const MatrixBase<OtherDerived> &) const
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::not_equal_to)
+Cwise<ExpressionType>::operator!=(Scalar s) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::not_equal_to)(_expression(),
+            typename ExpressionType::ConstantReturnType(_expression().rows(), _expression().cols(), s));
+}
+
+// scalar addition
+
+/** \array_module
+  *
+  * \returns an expression of \c *this with each coeff incremented by the constant \a scalar
+  *
+  * Example: \include Cwise_plus.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_plus.out
+  *
+  * \sa operator+=(), operator-()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const typename Cwise<ExpressionType>::ScalarAddReturnType
+Cwise<ExpressionType>::operator+(const Scalar& scalar) const
+{
+  return typename Cwise<ExpressionType>::ScalarAddReturnType(m_matrix, ei_scalar_add_op<Scalar>(scalar));
+}
+
+/** \array_module
+  *
+  * Adds the given \a scalar to each coeff of this expression.
+  *
+  * Example: \include Cwise_plus_equal.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_plus_equal.out
+  *
+  * \sa operator+(), operator-=()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline ExpressionType& Cwise<ExpressionType>::operator+=(const Scalar& scalar)
+{
+  return m_matrix.const_cast_derived() = *this + scalar;
+}
+
+/** \array_module
+  *
+  * \returns an expression of \c *this with each coeff decremented by the constant \a scalar
+  *
+  * Example: \include Cwise_minus.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_minus.out
+  *
+  * \sa operator+(), operator-=()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+inline const typename Cwise<ExpressionType>::ScalarAddReturnType
+Cwise<ExpressionType>::operator-(const Scalar& scalar) const
+{
+  return *this + (-scalar);
+}
+
+/** \array_module
+  *
+  * Substracts the given \a scalar from each coeff of this expression.
+  *
+  * Example: \include Cwise_minus_equal.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_minus_equal.out
+  *
+  * \sa operator+=(), operator-()
+  */
+
+template<typename ExpressionType>
+inline ExpressionType& Cwise<ExpressionType>::operator-=(const Scalar& scalar)
+{
+  return m_matrix.const_cast_derived() = *this - scalar;
+}
+
+#endif // EIGEN_ARRAY_CWISE_OPERATORS_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Functors.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Functors.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0aae7fd
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,305 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_ARRAY_FUNCTORS_H
+#define EIGEN_ARRAY_FUNCTORS_H
+
+/** \internal
+  * \array_module
+  *
+  * \brief Template functor to add a scalar to a fixed other one
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, Array::operator+
+  */
+/* If you wonder why doing the ei_pset1() in packetOp() is an optimization check ei_scalar_multiple_op */
+template<typename Scalar>
+struct ei_scalar_add_op {
+  typedef typename ei_packet_traits<Scalar>::type PacketScalar;
+  // FIXME default copy constructors seems bugged with std::complex<>
+  inline ei_scalar_add_op(const ei_scalar_add_op& other) : m_other(other.m_other) { }
+  inline ei_scalar_add_op(const Scalar& other) : m_other(other) { }
+  inline Scalar operator() (const Scalar& a) const { return a + m_other; }
+  inline const PacketScalar packetOp(const PacketScalar& a) const
+  { return ei_padd(a, ei_pset1(m_other)); }
+  const Scalar m_other;
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_add_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = NumTraits<Scalar>::AddCost, PacketAccess = ei_packet_traits<Scalar>::size>1 }; };
+
+/** \internal
+  *
+  * \array_module
+  *
+  * \brief Template functor to compute the square root of a scalar
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, Cwise::sqrt()
+  */
+template<typename Scalar> struct ei_scalar_sqrt_op EIGEN_EMPTY_STRUCT {
+  inline const Scalar operator() (const Scalar& a) const { return ei_sqrt(a); }
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_sqrt_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = 5 * NumTraits<Scalar>::MulCost, PacketAccess = false }; };
+
+/** \internal
+  *
+  * \array_module
+  *
+  * \brief Template functor to compute the exponential of a scalar
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, Cwise::exp()
+  */
+template<typename Scalar> struct ei_scalar_exp_op EIGEN_EMPTY_STRUCT {
+  inline const Scalar operator() (const Scalar& a) const { return ei_exp(a); }
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_exp_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = 5 * NumTraits<Scalar>::MulCost, PacketAccess = false }; };
+
+/** \internal
+  *
+  * \array_module
+  *
+  * \brief Template functor to compute the logarithm of a scalar
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, Cwise::log()
+  */
+template<typename Scalar> struct ei_scalar_log_op EIGEN_EMPTY_STRUCT {
+  inline const Scalar operator() (const Scalar& a) const { return ei_log(a); }
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_log_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = 5 * NumTraits<Scalar>::MulCost, PacketAccess = false }; };
+
+/** \internal
+  *
+  * \array_module
+  *
+  * \brief Template functor to compute the cosine of a scalar
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, Cwise::cos()
+  */
+template<typename Scalar> struct ei_scalar_cos_op EIGEN_EMPTY_STRUCT {
+  inline const Scalar operator() (const Scalar& a) const { return ei_cos(a); }
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_cos_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = 5 * NumTraits<Scalar>::MulCost, PacketAccess = false }; };
+
+/** \internal
+  *
+  * \array_module
+  *
+  * \brief Template functor to compute the sine of a scalar
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, Cwise::sin()
+  */
+template<typename Scalar> struct ei_scalar_sin_op EIGEN_EMPTY_STRUCT {
+  inline const Scalar operator() (const Scalar& a) const { return ei_sin(a); }
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_sin_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = 5 * NumTraits<Scalar>::MulCost, PacketAccess = false }; };
+
+/** \internal
+  *
+  * \array_module
+  *
+  * \brief Template functor to raise a scalar to a power
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, Cwise::pow
+  */
+template<typename Scalar>
+struct ei_scalar_pow_op {
+  // FIXME default copy constructors seems bugged with std::complex<>
+  inline ei_scalar_pow_op(const ei_scalar_pow_op& other) : m_exponent(other.m_exponent) { }
+  inline ei_scalar_pow_op(const Scalar& exponent) : m_exponent(exponent) {}
+  inline Scalar operator() (const Scalar& a) const { return ei_pow(a, m_exponent); }
+  const Scalar m_exponent;
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_pow_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = 5 * NumTraits<Scalar>::MulCost, PacketAccess = false }; };
+
+/** \internal
+  *
+  * \array_module
+  *
+  * \brief Template functor to compute the inverse of a scalar
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, Cwise::inverse()
+  */
+template<typename Scalar>
+struct ei_scalar_inverse_op {
+  inline Scalar operator() (const Scalar& a) const { return Scalar(1)/a; }
+  template<typename PacketScalar>
+  inline const PacketScalar packetOp(const PacketScalar& a) const
+  { return ei_pdiv(ei_pset1(Scalar(1)),a); }
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_inverse_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = NumTraits<Scalar>::MulCost, PacketAccess = int(ei_packet_traits<Scalar>::size)>1 }; };
+
+/** \internal
+  *
+  * \array_module
+  *
+  * \brief Template functor to compute the square of a scalar
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, Cwise::square()
+  */
+template<typename Scalar>
+struct ei_scalar_square_op {
+  inline Scalar operator() (const Scalar& a) const { return a*a; }
+  template<typename PacketScalar>
+  inline const PacketScalar packetOp(const PacketScalar& a) const
+  { return ei_pmul(a,a); }
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_square_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = NumTraits<Scalar>::MulCost, PacketAccess = int(ei_packet_traits<Scalar>::size)>1 }; };
+
+/** \internal
+  *
+  * \array_module
+  *
+  * \brief Template functor to compute the cube of a scalar
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, Cwise::cube()
+  */
+template<typename Scalar>
+struct ei_scalar_cube_op {
+  inline Scalar operator() (const Scalar& a) const { return a*a*a; }
+  template<typename PacketScalar>
+  inline const PacketScalar packetOp(const PacketScalar& a) const
+  { return ei_pmul(a,ei_pmul(a,a)); }
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_cube_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = 2*NumTraits<Scalar>::MulCost, PacketAccess = int(ei_packet_traits<Scalar>::size)>1 }; };
+
+// default ei_functor_traits for STL functors:
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::multiplies<T> >
+{ enum { Cost = NumTraits<T>::MulCost, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::divides<T> >
+{ enum { Cost = NumTraits<T>::MulCost, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::plus<T> >
+{ enum { Cost = NumTraits<T>::AddCost, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::minus<T> >
+{ enum { Cost = NumTraits<T>::AddCost, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::negate<T> >
+{ enum { Cost = NumTraits<T>::AddCost, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::logical_or<T> >
+{ enum { Cost = 1, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::logical_and<T> >
+{ enum { Cost = 1, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::logical_not<T> >
+{ enum { Cost = 1, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::greater<T> >
+{ enum { Cost = 1, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::less<T> >
+{ enum { Cost = 1, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::greater_equal<T> >
+{ enum { Cost = 1, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::less_equal<T> >
+{ enum { Cost = 1, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::equal_to<T> >
+{ enum { Cost = 1, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::not_equal_to<T> >
+{ enum { Cost = 1, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::binder2nd<T> >
+{ enum { Cost = ei_functor_traits<T>::Cost, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::binder1st<T> >
+{ enum { Cost = ei_functor_traits<T>::Cost, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::unary_negate<T> >
+{ enum { Cost = 1 + ei_functor_traits<T>::Cost, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T>
+struct ei_functor_traits<std::binary_negate<T> >
+{ enum { Cost = 1 + ei_functor_traits<T>::Cost, PacketAccess = false }; };
+
+#ifdef EIGEN_STDEXT_SUPPORT
+
+template<typename T0,typename T1>
+struct ei_functor_traits<std::project1st<T0,T1> >
+{ enum { Cost = 0, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T0,typename T1>
+struct ei_functor_traits<std::project2nd<T0,T1> >
+{ enum { Cost = 0, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T0,typename T1>
+struct ei_functor_traits<std::select2nd<std::pair<T0,T1> > >
+{ enum { Cost = 0, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T0,typename T1>
+struct ei_functor_traits<std::select1st<std::pair<T0,T1> > >
+{ enum { Cost = 0, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T0,typename T1>
+struct ei_functor_traits<std::unary_compose<T0,T1> >
+{ enum { Cost = ei_functor_traits<T0>::Cost + ei_functor_traits<T1>::Cost, PacketAccess = false }; };
+
+template<typename T0,typename T1,typename T2>
+struct ei_functor_traits<std::binary_compose<T0,T1,T2> >
+{ enum { Cost = ei_functor_traits<T0>::Cost + ei_functor_traits<T1>::Cost + ei_functor_traits<T2>::Cost, PacketAccess = false }; };
+
+#endif // EIGEN_STDEXT_SUPPORT
+
+#endif // EIGEN_ARRAY_FUNCTORS_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Norms.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Norms.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..6b92e6a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,80 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_ARRAY_NORMS_H
+#define EIGEN_ARRAY_NORMS_H
+
+template<typename Derived, int p>
+struct ei_lpNorm_selector
+{
+  typedef typename NumTraits<typename ei_traits<Derived>::Scalar>::Real RealScalar;
+  inline static RealScalar run(const MatrixBase<Derived>& m)
+  {
+    return ei_pow(m.cwise().abs().cwise().pow(p).sum(), RealScalar(1)/p);
+  }
+};
+
+template<typename Derived>
+struct ei_lpNorm_selector<Derived, 1>
+{
+  inline static typename NumTraits<typename ei_traits<Derived>::Scalar>::Real run(const MatrixBase<Derived>& m)
+  {
+    return m.cwise().abs().sum();
+  }
+};
+
+template<typename Derived>
+struct ei_lpNorm_selector<Derived, 2>
+{
+  inline static typename NumTraits<typename ei_traits<Derived>::Scalar>::Real run(const MatrixBase<Derived>& m)
+  {
+    return m.norm();
+  }
+};
+
+template<typename Derived>
+struct ei_lpNorm_selector<Derived, Infinity>
+{
+  inline static typename NumTraits<typename ei_traits<Derived>::Scalar>::Real run(const MatrixBase<Derived>& m)
+  {
+    return m.cwise().abs().maxCoeff();
+  }
+};
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns the \f$ \ell^p \f$ norm of *this, that is, returns the p-th root of the sum of the p-th powers of the absolute values
+  *          of the coefficients of *this. If \a p is the special value \a Eigen::Infinity, this function returns the \f$ \ell^p\infty \f$
+  *          norm, that is the maximum of the absolute values of the coefficients of *this.
+  *
+  * \sa norm()
+  */
+template<typename Derived>
+template<int p>
+inline typename NumTraits<typename ei_traits<Derived>::Scalar>::Real MatrixBase<Derived>::lpNorm() const
+{
+  return ei_lpNorm_selector<Derived, p>::run(*this);
+}
+
+#endif // EIGEN_ARRAY_NORMS_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/PartialRedux.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/PartialRedux.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b1e8fd4
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,342 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_PARTIAL_REDUX_H
+#define EIGEN_PARTIAL_REDUX_H
+
+/** \array_module \ingroup Array
+  *
+  * \class PartialReduxExpr
+  *
+  * \brief Generic expression of a partially reduxed matrix
+  *
+  * \param MatrixType the type of the matrix we are applying the redux operation
+  * \param MemberOp type of the member functor
+  * \param Direction indicates the direction of the redux (Vertical or Horizontal)
+  *
+  * This class represents an expression of a partial redux operator of a matrix.
+  * It is the return type of PartialRedux functions,
+  * and most of the time this is the only way it is used.
+  *
+  * \sa class PartialRedux
+  */
+
+template< typename MatrixType, typename MemberOp, int Direction>
+class PartialReduxExpr;
+
+template<typename MatrixType, typename MemberOp, int Direction>
+struct ei_traits<PartialReduxExpr<MatrixType, MemberOp, Direction> >
+{
+  typedef typename MemberOp::result_type Scalar;
+  typedef typename MatrixType::Scalar InputScalar;
+  typedef typename ei_nested<MatrixType>::type MatrixTypeNested;
+  typedef typename ei_cleantype<MatrixTypeNested>::type _MatrixTypeNested;
+  enum {
+    RowsAtCompileTime = Direction==Vertical   ? 1 : MatrixType::RowsAtCompileTime,
+    ColsAtCompileTime = Direction==Horizontal ? 1 : MatrixType::ColsAtCompileTime,
+    MaxRowsAtCompileTime = Direction==Vertical   ? 1 : MatrixType::MaxRowsAtCompileTime,
+    MaxColsAtCompileTime = Direction==Horizontal ? 1 : MatrixType::MaxColsAtCompileTime,
+    Flags = (unsigned int)_MatrixTypeNested::Flags & HereditaryBits,
+    TraversalSize = Direction==Vertical ? RowsAtCompileTime : ColsAtCompileTime
+  };
+  #if EIGEN_GNUC_AT_LEAST(3,4)
+  typedef typename MemberOp::template Cost<InputScalar,int(TraversalSize)> CostOpType;
+  #else
+  typedef typename MemberOp::template Cost<InputScalar,TraversalSize> CostOpType;
+  #endif
+  enum {
+    CoeffReadCost = TraversalSize * ei_traits<_MatrixTypeNested>::CoeffReadCost + int(CostOpType::value)
+  };
+};
+
+template< typename MatrixType, typename MemberOp, int Direction>
+class PartialReduxExpr : ei_no_assignment_operator,
+  public MatrixBase<PartialReduxExpr<MatrixType, MemberOp, Direction> >
+{
+  public:
+
+    EIGEN_GENERIC_PUBLIC_INTERFACE(PartialReduxExpr)
+    typedef typename ei_traits<PartialReduxExpr>::MatrixTypeNested MatrixTypeNested;
+    typedef typename ei_traits<PartialReduxExpr>::_MatrixTypeNested _MatrixTypeNested;
+
+    PartialReduxExpr(const MatrixType& mat, const MemberOp& func = MemberOp())
+      : m_matrix(mat), m_functor(func) {}
+
+    int rows() const { return (Direction==Vertical   ? 1 : m_matrix.rows()); }
+    int cols() const { return (Direction==Horizontal ? 1 : m_matrix.cols()); }
+
+    const Scalar coeff(int i, int j) const
+    {
+      if (Direction==Vertical)
+        return m_functor(m_matrix.col(j));
+      else
+        return m_functor(m_matrix.row(i));
+    }
+
+  protected:
+    const MatrixTypeNested m_matrix;
+    const MemberOp m_functor;
+};
+
+#define EIGEN_MEMBER_FUNCTOR(MEMBER,COST)                           \
+  template <typename ResultType>                                    \
+  struct ei_member_##MEMBER EIGEN_EMPTY_STRUCT {                    \
+    typedef ResultType result_type;                                 \
+    template<typename Scalar, int Size> struct Cost                 \
+    { enum { value = COST }; };                                     \
+    template<typename Derived>                                      \
+    inline ResultType operator()(const MatrixBase<Derived>& mat) const     \
+    { return mat.MEMBER(); } \
+  }
+
+EIGEN_MEMBER_FUNCTOR(squaredNorm, Size * NumTraits<Scalar>::MulCost + (Size-1)*NumTraits<Scalar>::AddCost);
+EIGEN_MEMBER_FUNCTOR(norm, (Size+5) * NumTraits<Scalar>::MulCost + (Size-1)*NumTraits<Scalar>::AddCost);
+EIGEN_MEMBER_FUNCTOR(sum, (Size-1)*NumTraits<Scalar>::AddCost);
+EIGEN_MEMBER_FUNCTOR(minCoeff, (Size-1)*NumTraits<Scalar>::AddCost);
+EIGEN_MEMBER_FUNCTOR(maxCoeff, (Size-1)*NumTraits<Scalar>::AddCost);
+EIGEN_MEMBER_FUNCTOR(all, (Size-1)*NumTraits<Scalar>::AddCost);
+EIGEN_MEMBER_FUNCTOR(any, (Size-1)*NumTraits<Scalar>::AddCost);
+EIGEN_MEMBER_FUNCTOR(count, (Size-1)*NumTraits<Scalar>::AddCost);
+
+/** \internal */
+template <typename BinaryOp, typename Scalar>
+struct ei_member_redux {
+  typedef typename ei_result_of<
+                     BinaryOp(Scalar)
+                   >::type  result_type;
+  template<typename _Scalar, int Size> struct Cost
+  { enum { value = (Size-1) * ei_functor_traits<BinaryOp>::Cost }; };
+  ei_member_redux(const BinaryOp func) : m_functor(func) {}
+  template<typename Derived>
+  inline result_type operator()(const MatrixBase<Derived>& mat) const
+  { return mat.redux(m_functor); }
+  const BinaryOp m_functor;
+};
+
+/** \array_module \ingroup Array
+  *
+  * \class PartialRedux
+  *
+  * \brief Pseudo expression providing partial reduction operations
+  *
+  * \param ExpressionType the type of the object on which to do partial reductions
+  * \param Direction indicates the direction of the redux (Vertical or Horizontal)
+  *
+  * This class represents a pseudo expression with partial reduction features.
+  * It is the return type of MatrixBase::colwise() and MatrixBase::rowwise()
+  * and most of the time this is the only way it is used.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_colwise.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_colwise.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::colwise(), MatrixBase::rowwise(), class PartialReduxExpr
+  */
+template<typename ExpressionType, int Direction> class PartialRedux
+{
+  public:
+
+    typedef typename ei_traits<ExpressionType>::Scalar Scalar;
+    typedef typename ei_meta_if<ei_must_nest_by_value<ExpressionType>::ret,
+        ExpressionType, const ExpressionType&>::ret ExpressionTypeNested;
+
+    template<template<typename _Scalar> class Functor> struct ReturnType
+    {
+      typedef PartialReduxExpr<ExpressionType,
+                               Functor<typename ei_traits<ExpressionType>::Scalar>,
+                               Direction
+                              > Type;
+    };
+
+    template<typename BinaryOp> struct ReduxReturnType
+    {
+      typedef PartialReduxExpr<ExpressionType,
+                               ei_member_redux<BinaryOp,typename ei_traits<ExpressionType>::Scalar>,
+                               Direction
+                              > Type;
+    };
+
+    typedef typename ExpressionType::PlainMatrixType CrossReturnType;
+    
+    inline PartialRedux(const ExpressionType& matrix) : m_matrix(matrix) {}
+
+    /** \internal */
+    inline const ExpressionType& _expression() const { return m_matrix; }
+
+    template<typename BinaryOp>
+    const typename ReduxReturnType<BinaryOp>::Type
+    redux(const BinaryOp& func = BinaryOp()) const;
+
+    /** \returns a row (or column) vector expression of the smallest coefficient
+      * of each column (or row) of the referenced expression.
+      *
+      * Example: \include PartialRedux_minCoeff.cpp
+      * Output: \verbinclude PartialRedux_minCoeff.out
+      *
+      * \sa MatrixBase::minCoeff() */
+    const typename ReturnType<ei_member_minCoeff>::Type minCoeff() const
+    { return _expression(); }
+
+    /** \returns a row (or column) vector expression of the largest coefficient
+      * of each column (or row) of the referenced expression.
+      *
+      * Example: \include PartialRedux_maxCoeff.cpp
+      * Output: \verbinclude PartialRedux_maxCoeff.out
+      *
+      * \sa MatrixBase::maxCoeff() */
+    const typename ReturnType<ei_member_maxCoeff>::Type maxCoeff() const
+    { return _expression(); }
+
+    /** \returns a row (or column) vector expression of the squared norm
+      * of each column (or row) of the referenced expression.
+      *
+      * Example: \include PartialRedux_squaredNorm.cpp
+      * Output: \verbinclude PartialRedux_squaredNorm.out
+      *
+      * \sa MatrixBase::squaredNorm() */
+    const typename ReturnType<ei_member_squaredNorm>::Type squaredNorm() const
+    { return _expression(); }
+
+    /** \returns a row (or column) vector expression of the norm
+      * of each column (or row) of the referenced expression.
+      *
+      * Example: \include PartialRedux_norm.cpp
+      * Output: \verbinclude PartialRedux_norm.out
+      *
+      * \sa MatrixBase::norm() */
+    const typename ReturnType<ei_member_norm>::Type norm() const
+    { return _expression(); }
+
+    /** \returns a row (or column) vector expression of the sum
+      * of each column (or row) of the referenced expression.
+      *
+      * Example: \include PartialRedux_sum.cpp
+      * Output: \verbinclude PartialRedux_sum.out
+      *
+      * \sa MatrixBase::sum() */
+    const typename ReturnType<ei_member_sum>::Type sum() const
+    { return _expression(); }
+
+    /** \returns a row (or column) vector expression representing
+      * whether \b all coefficients of each respective column (or row) are \c true.
+      *
+      * \sa MatrixBase::all() */
+    const typename ReturnType<ei_member_all>::Type all() const
+    { return _expression(); }
+
+    /** \returns a row (or column) vector expression representing
+      * whether \b at \b least one coefficient of each respective column (or row) is \c true.
+      *
+      * \sa MatrixBase::any() */
+    const typename ReturnType<ei_member_any>::Type any() const
+    { return _expression(); }
+    
+    /** \returns a row (or column) vector expression representing
+      * the number of \c true coefficients of each respective column (or row).
+      *
+      * Example: \include PartialRedux_count.cpp
+      * Output: \verbinclude PartialRedux_count.out
+      *
+      * \sa MatrixBase::count() */
+    const PartialReduxExpr<ExpressionType, ei_member_count<int>, Direction> count() const
+    { return _expression(); }
+
+    /** \returns a 3x3 matrix expression of the cross product
+      * of each column or row of the referenced expression with the \a other vector.
+      *
+      * \geometry_module
+      *
+      * \sa MatrixBase::cross() */
+    template<typename OtherDerived>
+    const CrossReturnType cross(const MatrixBase<OtherDerived>& other) const
+    {
+      EIGEN_STATIC_ASSERT_MATRIX_SPECIFIC_SIZE(CrossReturnType,3,3)
+      EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_SPECIFIC_SIZE(OtherDerived,3)
+      EIGEN_STATIC_ASSERT((ei_is_same_type<Scalar, typename OtherDerived::Scalar>::ret),
+        YOU_MIXED_DIFFERENT_NUMERIC_TYPES__YOU_NEED_TO_USE_THE_CAST_METHOD_OF_MATRIXBASE_TO_CAST_NUMERIC_TYPES_EXPLICITLY)
+
+      if(Direction==Vertical)
+        return (CrossReturnType()
+                                 << _expression().col(0).cross(other),
+                                    _expression().col(1).cross(other),
+                                    _expression().col(2).cross(other)).finished();
+      else
+        return (CrossReturnType() 
+                                 << _expression().row(0).cross(other),
+                                    _expression().row(1).cross(other),
+                                    _expression().row(2).cross(other)).finished();
+    }
+
+  protected:
+    ExpressionTypeNested m_matrix;
+};
+
+/** \array_module
+  *
+  * \returns a PartialRedux wrapper of *this providing additional partial reduction operations
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_colwise.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_colwise.out
+  *
+  * \sa rowwise(), class PartialRedux
+  */
+template<typename Derived>
+inline const PartialRedux<Derived,Vertical>
+MatrixBase<Derived>::colwise() const
+{
+  return derived();
+}
+
+/** \array_module
+  *
+  * \returns a PartialRedux wrapper of *this providing additional partial reduction operations
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_rowwise.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_rowwise.out
+  *
+  * \sa colwise(), class PartialRedux
+  */
+template<typename Derived>
+inline const PartialRedux<Derived,Horizontal>
+MatrixBase<Derived>::rowwise() const
+{
+  return derived();
+}
+
+/** \returns a row or column vector expression of \c *this reduxed by \a func
+  *
+  * The template parameter \a BinaryOp is the type of the functor
+  * of the custom redux operator. Note that func must be an associative operator.
+  *
+  * \sa class PartialRedux, MatrixBase::colwise(), MatrixBase::rowwise()
+  */
+template<typename ExpressionType, int Direction>
+template<typename BinaryOp>
+const typename PartialRedux<ExpressionType,Direction>::template ReduxReturnType<BinaryOp>::Type
+PartialRedux<ExpressionType,Direction>::redux(const BinaryOp& func) const
+{
+  return typename ReduxReturnType<BinaryOp>::Type(_expression(), func);
+}
+
+#endif // EIGEN_PARTIAL_REDUX_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Random.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Random.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9185fe4
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,156 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_RANDOM_H
+#define EIGEN_RANDOM_H
+
+template<typename Scalar> struct ei_scalar_random_op EIGEN_EMPTY_STRUCT {
+  inline ei_scalar_random_op(void) {}
+  inline const Scalar operator() (int, int) const { return ei_random<Scalar>(); }
+};
+template<typename Scalar>
+struct ei_functor_traits<ei_scalar_random_op<Scalar> >
+{ enum { Cost = 5 * NumTraits<Scalar>::MulCost, PacketAccess = false, IsRepeatable = false }; };
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns a random matrix (not an expression, the matrix is immediately evaluated).
+  *
+  * The parameters \a rows and \a cols are the number of rows and of columns of
+  * the returned matrix. Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size matrix types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a rows and \a cols as arguments, so ei_random() should be used
+  * instead.
+  *
+  * \addexample RandomExample \label How to create a matrix with random coefficients
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_random_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_random_int_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setRandom(), MatrixBase::Random(int), MatrixBase::Random()
+  */
+template<typename Derived>
+inline const CwiseNullaryOp<ei_scalar_random_op<typename ei_traits<Derived>::Scalar>, Derived>
+MatrixBase<Derived>::Random(int rows, int cols)
+{
+  return NullaryExpr(rows, cols, ei_scalar_random_op<Scalar>());
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns a random vector (not an expression, the vector is immediately evaluated).
+  *
+  * The parameter \a size is the size of the returned vector.
+  * Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size vector types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a size as argument, so ei_random() should be used
+  * instead.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_random_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_random_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setRandom(), MatrixBase::Random(int,int), MatrixBase::Random()
+  */
+template<typename Derived>
+inline const CwiseNullaryOp<ei_scalar_random_op<typename ei_traits<Derived>::Scalar>, Derived>
+MatrixBase<Derived>::Random(int size)
+{
+  return NullaryExpr(size, ei_scalar_random_op<Scalar>());
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * \returns a fixed-size random matrix or vector
+  * (not an expression, the matrix is immediately evaluated).
+  *
+  * This variant is only for fixed-size MatrixBase types. For dynamic-size types, you
+  * need to use the variants taking size arguments.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_random.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_random.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setRandom(), MatrixBase::Random(int,int), MatrixBase::Random(int)
+  */
+template<typename Derived>
+inline const CwiseNullaryOp<ei_scalar_random_op<typename ei_traits<Derived>::Scalar>, Derived>
+MatrixBase<Derived>::Random()
+{
+  return NullaryExpr(RowsAtCompileTime, ColsAtCompileTime, ei_scalar_random_op<Scalar>());
+}
+
+/** \array_module
+  * 
+  * Sets all coefficients in this expression to random values.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_setRandom.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_setRandom.out
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp, setRandom(int), setRandom(int,int)
+  */
+template<typename Derived>
+inline Derived& MatrixBase<Derived>::setRandom()
+{
+  return *this = Random(rows(), cols());
+}
+
+/** Resizes to the given \a size, and sets all coefficients in this expression to random values.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * Example: \include Matrix_setRandom_int.cpp
+  * Output: \verbinclude Matrix_setRandom_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setRandom(), setRandom(int,int), class CwiseNullaryOp, MatrixBase::Random()
+  */
+template<typename _Scalar, int _Rows, int _Cols, int _Options, int _MaxRows, int _MaxCols>
+EIGEN_STRONG_INLINE Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>&
+Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>::setRandom(int size)
+{
+  resize(size);
+  return setRandom();
+}
+
+/** Resizes to the given size, and sets all coefficients in this expression to random values.
+  *
+  * \param rows the new number of rows
+  * \param cols the new number of columns
+  *
+  * Example: \include Matrix_setRandom_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude Matrix_setRandom_int_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setRandom(), setRandom(int), class CwiseNullaryOp, MatrixBase::Random()
+  */
+template<typename _Scalar, int _Rows, int _Cols, int _Options, int _MaxRows, int _MaxCols>
+EIGEN_STRONG_INLINE Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>&
+Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>::setRandom(int rows, int cols)
+{
+  resize(rows, cols);
+  return setRandom();
+}
+
+#endif // EIGEN_RANDOM_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Select.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Array/Select.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..9dc3fb1
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,159 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_SELECT_H
+#define EIGEN_SELECT_H
+
+/** \array_module \ingroup Array
+  *
+  * \class Select
+  *
+  * \brief Expression of a coefficient wise version of the C++ ternary operator ?:
+  *
+  * \param ConditionMatrixType the type of the \em condition expression which must be a boolean matrix
+  * \param ThenMatrixType the type of the \em then expression
+  * \param ElseMatrixType the type of the \em else expression
+  *
+  * This class represents an expression of a coefficient wise version of the C++ ternary operator ?:.
+  * It is the return type of MatrixBase::select() and most of the time this is the only way it is used.
+  *
+  * \sa MatrixBase::select(const MatrixBase<ThenDerived>&, const MatrixBase<ElseDerived>&) const
+  */
+
+template<typename ConditionMatrixType, typename ThenMatrixType, typename ElseMatrixType>
+struct ei_traits<Select<ConditionMatrixType, ThenMatrixType, ElseMatrixType> >
+{
+  typedef typename ei_traits<ThenMatrixType>::Scalar Scalar;
+  typedef typename ConditionMatrixType::Nested ConditionMatrixNested;
+  typedef typename ThenMatrixType::Nested ThenMatrixNested;
+  typedef typename ElseMatrixType::Nested ElseMatrixNested;
+  enum {
+    RowsAtCompileTime = ConditionMatrixType::RowsAtCompileTime,
+    ColsAtCompileTime = ConditionMatrixType::ColsAtCompileTime,
+    MaxRowsAtCompileTime = ConditionMatrixType::MaxRowsAtCompileTime,
+    MaxColsAtCompileTime = ConditionMatrixType::MaxColsAtCompileTime,
+    Flags = (unsigned int)ThenMatrixType::Flags & ElseMatrixType::Flags & HereditaryBits,
+       CoeffReadCost = ei_traits<typename ei_cleantype<ConditionMatrixNested>::type>::CoeffReadCost
+       + EIGEN_ENUM_MAX(ei_traits<typename ei_cleantype<ThenMatrixNested>::type>::CoeffReadCost,
+                        ei_traits<typename ei_cleantype<ElseMatrixNested>::type>::CoeffReadCost)
+  };
+};
+
+template<typename ConditionMatrixType, typename ThenMatrixType, typename ElseMatrixType>
+class Select : ei_no_assignment_operator,
+  public MatrixBase<Select<ConditionMatrixType, ThenMatrixType, ElseMatrixType> >
+{
+  public:
+
+    EIGEN_GENERIC_PUBLIC_INTERFACE(Select)
+
+    Select(const ConditionMatrixType& conditionMatrix,
+           const ThenMatrixType& thenMatrix,
+           const ElseMatrixType& elseMatrix)
+      : m_condition(conditionMatrix), m_then(thenMatrix), m_else(elseMatrix)
+    {
+      ei_assert(m_condition.rows() == m_then.rows() && m_condition.rows() == m_else.rows());
+      ei_assert(m_condition.cols() == m_then.cols() && m_condition.cols() == m_else.cols());
+    }
+
+    int rows() const { return m_condition.rows(); }
+    int cols() const { return m_condition.cols(); }
+
+    const Scalar coeff(int i, int j) const
+    {
+      if (m_condition.coeff(i,j))
+        return m_then.coeff(i,j);
+      else
+        return m_else.coeff(i,j);
+    }
+    
+    const Scalar coeff(int i) const
+    {
+      if (m_condition.coeff(i))
+        return m_then.coeff(i);
+      else
+        return m_else.coeff(i);
+    }
+
+  protected:
+    const typename ConditionMatrixType::Nested m_condition;
+    const typename ThenMatrixType::Nested m_then;
+    const typename ElseMatrixType::Nested m_else;
+};
+
+
+/** \array_module
+  *
+  * \returns a matrix where each coefficient (i,j) is equal to \a thenMatrix(i,j)
+  * if \c *this(i,j), and \a elseMatrix(i,j) otherwise.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_select.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_select.out
+  *
+  * \sa class Select
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename ThenDerived,typename ElseDerived>
+inline const Select<Derived,ThenDerived,ElseDerived>
+MatrixBase<Derived>::select(const MatrixBase<ThenDerived>& thenMatrix,
+                            const MatrixBase<ElseDerived>& elseMatrix) const
+{
+  return Select<Derived,ThenDerived,ElseDerived>(derived(), thenMatrix.derived(), elseMatrix.derived());
+}
+
+/** \array_module
+  *
+  * Version of MatrixBase::select(const MatrixBase&, const MatrixBase&) with
+  * the \em else expression being a scalar value.
+  *
+  * \sa MatrixBase::select(const MatrixBase<ThenDerived>&, const MatrixBase<ElseDerived>&) const, class Select
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename ThenDerived>
+inline const Select<Derived,ThenDerived, NestByValue<typename ThenDerived::ConstantReturnType> >
+MatrixBase<Derived>::select(const MatrixBase<ThenDerived>& thenMatrix,
+                            typename ThenDerived::Scalar elseScalar) const
+{
+  return Select<Derived,ThenDerived,NestByValue<typename ThenDerived::ConstantReturnType> >(
+    derived(), thenMatrix.derived(), ThenDerived::Constant(rows(),cols(),elseScalar));
+}
+
+/** \array_module
+  *
+  * Version of MatrixBase::select(const MatrixBase&, const MatrixBase&) with
+  * the \em then expression being a scalar value.
+  *
+  * \sa MatrixBase::select(const MatrixBase<ThenDerived>&, const MatrixBase<ElseDerived>&) const, class Select
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename ElseDerived>
+inline const Select<Derived, NestByValue<typename ElseDerived::ConstantReturnType>, ElseDerived >
+MatrixBase<Derived>::select(typename ElseDerived::Scalar thenScalar,
+                            const MatrixBase<ElseDerived>& elseMatrix) const
+{
+  return Select<Derived,NestByValue<typename ElseDerived::ConstantReturnType>,ElseDerived>(
+    derived(), ElseDerived::Constant(rows(),cols(),thenScalar), elseMatrix.derived());
+}
+
+#endif // EIGEN_SELECT_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Cholesky/CholeskyInstantiations.cpp b/extern/Eigen2/Eigen/src/Cholesky/CholeskyInstantiations.cpp
new file mode 100644 (file)
index 0000000..e7f40a2
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,35 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS
+#define EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS
+#endif
+#include "../../Core"
+#undef EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS
+
+#include "../../Cholesky"
+
+namespace Eigen {
+  EIGEN_CHOLESKY_MODULE_INSTANTIATE();
+}
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Cholesky/LDLT.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Cholesky/LDLT.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..205b78a
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,198 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_LDLT_H
+#define EIGEN_LDLT_H
+
+/** \ingroup cholesky_Module
+  *
+  * \class LDLT
+  *
+  * \brief Robust Cholesky decomposition of a matrix and associated features
+  *
+  * \param MatrixType the type of the matrix of which we are computing the LDL^T Cholesky decomposition
+  *
+  * This class performs a Cholesky decomposition without square root of a symmetric, positive definite
+  * matrix A such that A = L D L^* = U^* D U, where L is lower triangular with a unit diagonal
+  * and D is a diagonal matrix.
+  *
+  * Compared to a standard Cholesky decomposition, avoiding the square roots allows for faster and more
+  * stable computation.
+  *
+  * Note that during the decomposition, only the upper triangular part of A is considered. Therefore,
+  * the strict lower part does not have to store correct values.
+  *
+  * \sa MatrixBase::ldlt(), class LLT
+  */
+template<typename MatrixType> class LDLT
+{
+  public:
+
+    typedef typename MatrixType::Scalar Scalar;
+    typedef typename NumTraits<typename MatrixType::Scalar>::Real RealScalar;
+    typedef Matrix<Scalar, MatrixType::ColsAtCompileTime, 1> VectorType;
+
+    LDLT(const MatrixType& matrix)
+      : m_matrix(matrix.rows(), matrix.cols())
+    {
+      compute(matrix);
+    }
+
+    /** \returns the lower triangular matrix L */
+    inline Part<MatrixType, UnitLowerTriangular> matrixL(void) const { return m_matrix; }
+
+    /** \returns the coefficients of the diagonal matrix D */
+    inline DiagonalCoeffs<MatrixType> vectorD(void) const { return m_matrix.diagonal(); }
+
+    /** \returns true if the matrix is positive definite */
+    inline bool isPositiveDefinite(void) const { return m_isPositiveDefinite; }
+
+    template<typename RhsDerived, typename ResultType>
+    bool solve(const MatrixBase<RhsDerived> &b, ResultType *result) const;
+
+    template<typename Derived>
+    bool solveInPlace(MatrixBase<Derived> &bAndX) const;
+
+    void compute(const MatrixType& matrix);
+
+  protected:
+    /** \internal
+      * Used to compute and store the cholesky decomposition A = L D L^* = U^* D U.
+      * The strict upper part is used during the decomposition, the strict lower
+      * part correspond to the coefficients of L (its diagonal is equal to 1 and
+      * is not stored), and the diagonal entries correspond to D.
+      */
+    MatrixType m_matrix;
+
+    bool m_isPositiveDefinite;
+};
+
+/** Compute / recompute the LLT decomposition A = L D L^* = U^* D U of \a matrix
+  */
+template<typename MatrixType>
+void LDLT<MatrixType>::compute(const MatrixType& a)
+{
+  assert(a.rows()==a.cols());
+  const int size = a.rows();
+  m_matrix.resize(size, size);
+  m_isPositiveDefinite = true;
+  const RealScalar eps = ei_sqrt(precision<Scalar>());
+
+  if (size<=1)
+  {
+    m_matrix = a;
+    return;
+  }
+
+  // Let's preallocate a temporay vector to evaluate the matrix-vector product into it.
+  // Unlike the standard LLT decomposition, here we cannot evaluate it to the destination
+  // matrix because it a sub-row which is not compatible suitable for efficient packet evaluation.
+  // (at least if we assume the matrix is col-major)
+  Matrix<Scalar,MatrixType::RowsAtCompileTime,1> _temporary(size);
+
+  // Note that, in this algorithm the rows of the strict upper part of m_matrix is used to store
+  // column vector, thus the strange .conjugate() and .transpose()...
+
+  m_matrix.row(0) = a.row(0).conjugate();
+  m_matrix.col(0).end(size-1) = m_matrix.row(0).end(size-1) / m_matrix.coeff(0,0);
+  for (int j = 1; j < size; ++j)
+  {
+    RealScalar tmp = ei_real(a.coeff(j,j) - (m_matrix.row(j).start(j) * m_matrix.col(j).start(j).conjugate()).coeff(0,0));
+    m_matrix.coeffRef(j,j) = tmp;
+
+    if (tmp < eps)
+    {
+      m_isPositiveDefinite = false;
+      return;
+    }
+
+    int endSize = size-j-1;
+    if (endSize>0)
+    {
+      _temporary.end(endSize) = ( m_matrix.block(j+1,0, endSize, j)
+                                  * m_matrix.col(j).start(j).conjugate() ).lazy();
+
+      m_matrix.row(j).end(endSize) = a.row(j).end(endSize).conjugate()
+                                   - _temporary.end(endSize).transpose();
+
+      m_matrix.col(j).end(endSize) = m_matrix.row(j).end(endSize) / tmp;
+    }
+  }
+}
+
+/** Computes the solution x of \f$ A x = b \f$ using the current decomposition of A.
+  * The result is stored in \a result
+  *
+  * \returns true in case of success, false otherwise.
+  *
+  * In other words, it computes \f$ b = A^{-1} b \f$ with
+  * \f$ {L^{*}}^{-1} D^{-1} L^{-1} b \f$ from right to left.
+  *
+  * \sa LDLT::solveInPlace(), MatrixBase::ldlt()
+  */
+template<typename MatrixType>
+template<typename RhsDerived, typename ResultType>
+bool LDLT<MatrixType>
+::solve(const MatrixBase<RhsDerived> &b, ResultType *result) const
+{
+  const int size = m_matrix.rows();
+  ei_assert(size==b.rows() && "LLT::solve(): invalid number of rows of the right hand side matrix b");
+  *result = b;
+  return solveInPlace(*result);
+}
+
+/** This is the \em in-place version of solve().
+  *
+  * \param bAndX represents both the right-hand side matrix b and result x.
+  *
+  * This version avoids a copy when the right hand side matrix b is not
+  * needed anymore.
+  *
+  * \sa LDLT::solve(), MatrixBase::ldlt()
+  */
+template<typename MatrixType>
+template<typename Derived>
+bool LDLT<MatrixType>::solveInPlace(MatrixBase<Derived> &bAndX) const
+{
+  const int size = m_matrix.rows();
+  ei_assert(size==bAndX.rows());
+  if (!m_isPositiveDefinite)
+    return false;
+  matrixL().solveTriangularInPlace(bAndX);
+  bAndX = (m_matrix.cwise().inverse().template part<Diagonal>() * bAndX).lazy();
+  m_matrix.adjoint().template part<UnitUpperTriangular>().solveTriangularInPlace(bAndX);
+  return true;
+}
+
+/** \cholesky_module
+  * \returns the Cholesky decomposition without square root of \c *this
+  */
+template<typename Derived>
+inline const LDLT<typename MatrixBase<Derived>::PlainMatrixType>
+MatrixBase<Derived>::ldlt() const
+{
+  return derived();
+}
+
+#endif // EIGEN_LDLT_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Cholesky/LLT.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Cholesky/LLT.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..42c959f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,219 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_LLT_H
+#define EIGEN_LLT_H
+
+/** \ingroup cholesky_Module
+  *
+  * \class LLT
+  *
+  * \brief Standard Cholesky decomposition (LL^T) of a matrix and associated features
+  *
+  * \param MatrixType the type of the matrix of which we are computing the LL^T Cholesky decomposition
+  *
+  * This class performs a LL^T Cholesky decomposition of a symmetric, positive definite
+  * matrix A such that A = LL^* = U^*U, where L is lower triangular.
+  *
+  * While the Cholesky decomposition is particularly useful to solve selfadjoint problems like  D^*D x = b,
+  * for that purpose, we recommend the Cholesky decomposition without square root which is more stable
+  * and even faster. Nevertheless, this standard Cholesky decomposition remains useful in many other
+  * situations like generalised eigen problems with hermitian matrices.
+  *
+  * Remember that Cholesky decompositions are not rank-revealing. This LLT decomposition is only stable on positive definite matrices,
+  * use LDLT instead for the semidefinite case. Also, do not use a Cholesky decomposition to determine whether a system of equations
+  * has a solution.
+  *
+  * \sa MatrixBase::llt(), class LDLT
+  */
+ /* HEY THIS DOX IS DISABLED BECAUSE THERE's A BUG EITHER HERE OR IN LDLT ABOUT THAT (OR BOTH)
+  * Note that during the decomposition, only the upper triangular part of A is considered. Therefore,
+  * the strict lower part does not have to store correct values.
+  */
+template<typename MatrixType> class LLT
+{
+  private:
+    typedef typename MatrixType::Scalar Scalar;
+    typedef typename NumTraits<typename MatrixType::Scalar>::Real RealScalar;
+    typedef Matrix<Scalar, MatrixType::ColsAtCompileTime, 1> VectorType;
+
+    enum {
+      PacketSize = ei_packet_traits<Scalar>::size,
+      AlignmentMask = int(PacketSize)-1
+    };
+
+  public:
+
+    /** 
+    * \brief Default Constructor.
+    *
+    * The default constructor is useful in cases in which the user intends to
+    * perform decompositions via LLT::compute(const MatrixType&).
+    */
+    LLT() : m_matrix(), m_isInitialized(false) {}
+
+    LLT(const MatrixType& matrix)
+      : m_matrix(matrix.rows(), matrix.cols()),
+        m_isInitialized(false)
+    {
+      compute(matrix);
+    }
+
+    /** \returns the lower triangular matrix L */
+    inline Part<MatrixType, LowerTriangular> matrixL(void) const 
+    { 
+      ei_assert(m_isInitialized && "LLT is not initialized.");
+      return m_matrix; 
+    }
+    
+    /** \deprecated */
+    inline bool isPositiveDefinite(void) const { return m_isInitialized && m_isPositiveDefinite; }
+
+    template<typename RhsDerived, typename ResultType>
+    bool solve(const MatrixBase<RhsDerived> &b, ResultType *result) const;
+
+    template<typename Derived>
+    bool solveInPlace(MatrixBase<Derived> &bAndX) const;
+
+    void compute(const MatrixType& matrix);
+
+  protected:
+    /** \internal
+      * Used to compute and store L
+      * The strict upper part is not used and even not initialized.
+      */
+    MatrixType m_matrix;
+    bool m_isInitialized;
+    bool m_isPositiveDefinite;
+};
+
+/** Computes / recomputes the Cholesky decomposition A = LL^* = U^*U of \a matrix
+  */
+template<typename MatrixType>
+void LLT<MatrixType>::compute(const MatrixType& a)
+{
+  assert(a.rows()==a.cols());
+  m_isPositiveDefinite = true;
+  const int size = a.rows();
+  m_matrix.resize(size, size);
+  // The biggest overall is the point of reference to which further diagonals
+  // are compared; if any diagonal is negligible compared
+  // to the largest overall, the algorithm bails.  This cutoff is suggested
+  // in "Analysis of the Cholesky Decomposition of a Semi-definite Matrix" by
+  // Nicholas J. Higham. Also see "Accuracy and Stability of Numerical
+  // Algorithms" page 217, also by Higham.
+  const RealScalar cutoff = machine_epsilon<Scalar>() * size * a.diagonal().cwise().abs().maxCoeff();
+  RealScalar x;
+  x = ei_real(a.coeff(0,0));
+  m_matrix.coeffRef(0,0) = ei_sqrt(x);
+  if(size==1)
+  {
+    m_isInitialized = true;
+    return;
+  }
+  m_matrix.col(0).end(size-1) = a.row(0).end(size-1).adjoint() / ei_real(m_matrix.coeff(0,0));
+  for (int j = 1; j < size; ++j)
+  {
+    x = ei_real(a.coeff(j,j)) - m_matrix.row(j).start(j).squaredNorm();
+    if (x < cutoff)
+    {
+      m_isPositiveDefinite = false;
+      continue;
+    }
+
+    m_matrix.coeffRef(j,j) = x = ei_sqrt(x);
+
+    int endSize = size-j-1;
+    if (endSize>0) {
+      // Note that when all matrix columns have good alignment, then the following
+      // product is guaranteed to be optimal with respect to alignment.
+      m_matrix.col(j).end(endSize) =
+        (m_matrix.block(j+1, 0, endSize, j) * m_matrix.row(j).start(j).adjoint()).lazy();
+
+      // FIXME could use a.col instead of a.row
+      m_matrix.col(j).end(endSize) = (a.row(j).end(endSize).adjoint()
+        - m_matrix.col(j).end(endSize) ) / x;
+    }
+  }
+
+  m_isInitialized = true;
+}
+
+/** Computes the solution x of \f$ A x = b \f$ using the current decomposition of A.
+  * The result is stored in \a result
+  *
+  * \returns true always! If you need to check for existence of solutions, use another decomposition like LU, QR, or SVD.
+  *
+  * In other words, it computes \f$ b = A^{-1} b \f$ with
+  * \f$ {L^{*}}^{-1} L^{-1} b \f$ from right to left.
+  *
+  * Example: \include LLT_solve.cpp
+  * Output: \verbinclude LLT_solve.out
+  *
+  * \sa LLT::solveInPlace(), MatrixBase::llt()
+  */
+template<typename MatrixType>
+template<typename RhsDerived, typename ResultType>
+bool LLT<MatrixType>::solve(const MatrixBase<RhsDerived> &b, ResultType *result) const
+{
+  ei_assert(m_isInitialized && "LLT is not initialized.");
+  const int size = m_matrix.rows();
+  ei_assert(size==b.rows() && "LLT::solve(): invalid number of rows of the right hand side matrix b");
+  return solveInPlace((*result) = b);
+}
+
+/** This is the \em in-place version of solve().
+  *
+  * \param bAndX represents both the right-hand side matrix b and result x.
+  *
+  * \returns true always! If you need to check for existence of solutions, use another decomposition like LU, QR, or SVD.
+  *
+  * This version avoids a copy when the right hand side matrix b is not
+  * needed anymore.
+  *
+  * \sa LLT::solve(), MatrixBase::llt()
+  */
+template<typename MatrixType>
+template<typename Derived>
+bool LLT<MatrixType>::solveInPlace(MatrixBase<Derived> &bAndX) const
+{
+  ei_assert(m_isInitialized && "LLT is not initialized.");
+  const int size = m_matrix.rows();
+  ei_assert(size==bAndX.rows());
+  matrixL().solveTriangularInPlace(bAndX);
+  m_matrix.adjoint().template part<UpperTriangular>().solveTriangularInPlace(bAndX);
+  return true;
+}
+
+/** \cholesky_module
+  * \returns the LLT decomposition of \c *this
+  */
+template<typename Derived>
+inline const LLT<typename MatrixBase<Derived>::PlainMatrixType>
+MatrixBase<Derived>::llt() const
+{
+  return LLT<PlainMatrixType>(derived());
+}
+
+#endif // EIGEN_LLT_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Assign.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Assign.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..5720507
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,445 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2007 Michael Olbrich <michael.olbrich@gmx.net>
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_ASSIGN_H
+#define EIGEN_ASSIGN_H
+
+/***************************************************************************
+* Part 1 : the logic deciding a strategy for vectorization and unrolling
+***************************************************************************/
+
+template <typename Derived, typename OtherDerived>
+struct ei_assign_traits
+{
+public:
+  enum {
+    DstIsAligned = Derived::Flags & AlignedBit,
+    SrcIsAligned = OtherDerived::Flags & AlignedBit,
+    SrcAlignment = DstIsAligned && SrcIsAligned ? Aligned : Unaligned
+  };
+
+private:
+  enum {
+    InnerSize = int(Derived::Flags)&RowMajorBit
+              ? Derived::ColsAtCompileTime
+              : Derived::RowsAtCompileTime,
+    InnerMaxSize = int(Derived::Flags)&RowMajorBit
+              ? Derived::MaxColsAtCompileTime
+              : Derived::MaxRowsAtCompileTime,
+    PacketSize = ei_packet_traits<typename Derived::Scalar>::size
+  };
+
+  enum {
+    MightVectorize = (int(Derived::Flags) & int(OtherDerived::Flags) & ActualPacketAccessBit)
+                  && ((int(Derived::Flags)&RowMajorBit)==(int(OtherDerived::Flags)&RowMajorBit)),
+    MayInnerVectorize  = MightVectorize && int(InnerSize)!=Dynamic && int(InnerSize)%int(PacketSize)==0
+                       && int(DstIsAligned) && int(SrcIsAligned),
+    MayLinearVectorize = MightVectorize && (int(Derived::Flags) & int(OtherDerived::Flags) & LinearAccessBit),
+    MaySliceVectorize  = MightVectorize && int(InnerMaxSize)>=3*PacketSize /* slice vectorization can be slow, so we only
+      want it if the slices are big, which is indicated by InnerMaxSize rather than InnerSize, think of the case
+      of a dynamic block in a fixed-size matrix */
+  };
+
+public:
+  enum {
+    Vectorization = int(MayInnerVectorize)  ? int(InnerVectorization)
+                  : int(MayLinearVectorize) ? int(LinearVectorization)
+                  : int(MaySliceVectorize)  ? int(SliceVectorization)
+                                            : int(NoVectorization)
+  };
+
+private:
+  enum {
+    UnrollingLimit      = EIGEN_UNROLLING_LIMIT * (int(Vectorization) == int(NoVectorization) ? 1 : int(PacketSize)),
+    MayUnrollCompletely = int(Derived::SizeAtCompileTime) * int(OtherDerived::CoeffReadCost) <= int(UnrollingLimit),
+    MayUnrollInner      = int(InnerSize * OtherDerived::CoeffReadCost) <= int(UnrollingLimit)
+  };
+
+public:
+  enum {
+    Unrolling = (int(Vectorization) == int(InnerVectorization) || int(Vectorization) == int(NoVectorization))
+              ? (
+                   int(MayUnrollCompletely) ? int(CompleteUnrolling)
+                 : int(MayUnrollInner)      ? int(InnerUnrolling)
+                                            : int(NoUnrolling)
+                )
+              : int(Vectorization) == int(LinearVectorization)
+              ? ( int(MayUnrollCompletely) && int(DstIsAligned) ? int(CompleteUnrolling) : int(NoUnrolling) )
+              : int(NoUnrolling)
+  };
+};
+
+/***************************************************************************
+* Part 2 : meta-unrollers
+***************************************************************************/
+
+/***********************
+*** No vectorization ***
+***********************/
+
+template<typename Derived1, typename Derived2, int Index, int Stop>
+struct ei_assign_novec_CompleteUnrolling
+{
+  enum {
+    row = int(Derived1::Flags)&RowMajorBit
+        ? Index / int(Derived1::ColsAtCompileTime)
+        : Index % Derived1::RowsAtCompileTime,
+    col = int(Derived1::Flags)&RowMajorBit
+        ? Index % int(Derived1::ColsAtCompileTime)
+        : Index / Derived1::RowsAtCompileTime
+  };
+
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    dst.copyCoeff(row, col, src);
+    ei_assign_novec_CompleteUnrolling<Derived1, Derived2, Index+1, Stop>::run(dst, src);
+  }
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2, int Stop>
+struct ei_assign_novec_CompleteUnrolling<Derived1, Derived2, Stop, Stop>
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &, const Derived2 &) {}
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2, int Index, int Stop>
+struct ei_assign_novec_InnerUnrolling
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src, int row_or_col)
+  {
+    const bool rowMajor = int(Derived1::Flags)&RowMajorBit;
+    const int row = rowMajor ? row_or_col : Index;
+    const int col = rowMajor ? Index : row_or_col;
+    dst.copyCoeff(row, col, src);
+    ei_assign_novec_InnerUnrolling<Derived1, Derived2, Index+1, Stop>::run(dst, src, row_or_col);
+  }
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2, int Stop>
+struct ei_assign_novec_InnerUnrolling<Derived1, Derived2, Stop, Stop>
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &, const Derived2 &, int) {}
+};
+
+/**************************
+*** Inner vectorization ***
+**************************/
+
+template<typename Derived1, typename Derived2, int Index, int Stop>
+struct ei_assign_innervec_CompleteUnrolling
+{
+  enum {
+    row = int(Derived1::Flags)&RowMajorBit
+        ? Index / int(Derived1::ColsAtCompileTime)
+        : Index % Derived1::RowsAtCompileTime,
+    col = int(Derived1::Flags)&RowMajorBit
+        ? Index % int(Derived1::ColsAtCompileTime)
+        : Index / Derived1::RowsAtCompileTime,
+    SrcAlignment = ei_assign_traits<Derived1,Derived2>::SrcAlignment
+  };
+
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    dst.template copyPacket<Derived2, Aligned, SrcAlignment>(row, col, src);
+    ei_assign_innervec_CompleteUnrolling<Derived1, Derived2,
+      Index+ei_packet_traits<typename Derived1::Scalar>::size, Stop>::run(dst, src);
+  }
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2, int Stop>
+struct ei_assign_innervec_CompleteUnrolling<Derived1, Derived2, Stop, Stop>
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &, const Derived2 &) {}
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2, int Index, int Stop>
+struct ei_assign_innervec_InnerUnrolling
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src, int row_or_col)
+  {
+    const int row = int(Derived1::Flags)&RowMajorBit ? row_or_col : Index;
+    const int col = int(Derived1::Flags)&RowMajorBit ? Index : row_or_col;
+    dst.template copyPacket<Derived2, Aligned, Aligned>(row, col, src);
+    ei_assign_innervec_InnerUnrolling<Derived1, Derived2,
+      Index+ei_packet_traits<typename Derived1::Scalar>::size, Stop>::run(dst, src, row_or_col);
+  }
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2, int Stop>
+struct ei_assign_innervec_InnerUnrolling<Derived1, Derived2, Stop, Stop>
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &, const Derived2 &, int) {}
+};
+
+/***************************************************************************
+* Part 3 : implementation of all cases
+***************************************************************************/
+
+template<typename Derived1, typename Derived2,
+         int Vectorization = ei_assign_traits<Derived1, Derived2>::Vectorization,
+         int Unrolling = ei_assign_traits<Derived1, Derived2>::Unrolling>
+struct ei_assign_impl;
+
+/***********************
+*** No vectorization ***
+***********************/
+
+template<typename Derived1, typename Derived2>
+struct ei_assign_impl<Derived1, Derived2, NoVectorization, NoUnrolling>
+{
+  inline static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    const int innerSize = dst.innerSize();
+    const int outerSize = dst.outerSize();
+    for(int j = 0; j < outerSize; ++j)
+      for(int i = 0; i < innerSize; ++i)
+      {
+        if(int(Derived1::Flags)&RowMajorBit)
+          dst.copyCoeff(j, i, src);
+        else
+          dst.copyCoeff(i, j, src);
+      }
+  }
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2>
+struct ei_assign_impl<Derived1, Derived2, NoVectorization, CompleteUnrolling>
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    ei_assign_novec_CompleteUnrolling<Derived1, Derived2, 0, Derived1::SizeAtCompileTime>
+      ::run(dst, src);
+  }
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2>
+struct ei_assign_impl<Derived1, Derived2, NoVectorization, InnerUnrolling>
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    const bool rowMajor = int(Derived1::Flags)&RowMajorBit;
+    const int innerSize = rowMajor ? Derived1::ColsAtCompileTime : Derived1::RowsAtCompileTime;
+    const int outerSize = dst.outerSize();
+    for(int j = 0; j < outerSize; ++j)
+      ei_assign_novec_InnerUnrolling<Derived1, Derived2, 0, innerSize>
+        ::run(dst, src, j);
+  }
+};
+
+/**************************
+*** Inner vectorization ***
+**************************/
+
+template<typename Derived1, typename Derived2>
+struct ei_assign_impl<Derived1, Derived2, InnerVectorization, NoUnrolling>
+{
+  inline static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    const int innerSize = dst.innerSize();
+    const int outerSize = dst.outerSize();
+    const int packetSize = ei_packet_traits<typename Derived1::Scalar>::size;
+    for(int j = 0; j < outerSize; ++j)
+      for(int i = 0; i < innerSize; i+=packetSize)
+      {
+        if(int(Derived1::Flags)&RowMajorBit)
+          dst.template copyPacket<Derived2, Aligned, Aligned>(j, i, src);
+        else
+          dst.template copyPacket<Derived2, Aligned, Aligned>(i, j, src);
+      }
+  }
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2>
+struct ei_assign_impl<Derived1, Derived2, InnerVectorization, CompleteUnrolling>
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    ei_assign_innervec_CompleteUnrolling<Derived1, Derived2, 0, Derived1::SizeAtCompileTime>
+      ::run(dst, src);
+  }
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2>
+struct ei_assign_impl<Derived1, Derived2, InnerVectorization, InnerUnrolling>
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    const bool rowMajor = int(Derived1::Flags)&RowMajorBit;
+    const int innerSize = rowMajor ? Derived1::ColsAtCompileTime : Derived1::RowsAtCompileTime;
+    const int outerSize = dst.outerSize();
+    for(int j = 0; j < outerSize; ++j)
+      ei_assign_innervec_InnerUnrolling<Derived1, Derived2, 0, innerSize>
+        ::run(dst, src, j);
+  }
+};
+
+/***************************
+*** Linear vectorization ***
+***************************/
+
+template<typename Derived1, typename Derived2>
+struct ei_assign_impl<Derived1, Derived2, LinearVectorization, NoUnrolling>
+{
+  inline static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    const int size = dst.size();
+    const int packetSize = ei_packet_traits<typename Derived1::Scalar>::size;
+    const int alignedStart = ei_assign_traits<Derived1,Derived2>::DstIsAligned ? 0
+                           : ei_alignmentOffset(&dst.coeffRef(0), size);
+    const int alignedEnd = alignedStart + ((size-alignedStart)/packetSize)*packetSize;
+
+    for(int index = 0; index < alignedStart; ++index)
+      dst.copyCoeff(index, src);
+
+    for(int index = alignedStart; index < alignedEnd; index += packetSize)
+    {
+      dst.template copyPacket<Derived2, Aligned, ei_assign_traits<Derived1,Derived2>::SrcAlignment>(index, src);
+    }
+
+    for(int index = alignedEnd; index < size; ++index)
+      dst.copyCoeff(index, src);
+  }
+};
+
+template<typename Derived1, typename Derived2>
+struct ei_assign_impl<Derived1, Derived2, LinearVectorization, CompleteUnrolling>
+{
+  EIGEN_STRONG_INLINE static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    const int size = Derived1::SizeAtCompileTime;
+    const int packetSize = ei_packet_traits<typename Derived1::Scalar>::size;
+    const int alignedSize = (size/packetSize)*packetSize;
+
+    ei_assign_innervec_CompleteUnrolling<Derived1, Derived2, 0, alignedSize>::run(dst, src);
+    ei_assign_novec_CompleteUnrolling<Derived1, Derived2, alignedSize, size>::run(dst, src);
+  }
+};
+
+/**************************
+*** Slice vectorization ***
+***************************/
+
+template<typename Derived1, typename Derived2>
+struct ei_assign_impl<Derived1, Derived2, SliceVectorization, NoUnrolling>
+{
+  inline static void run(Derived1 &dst, const Derived2 &src)
+  {
+    const int packetSize = ei_packet_traits<typename Derived1::Scalar>::size;
+    const int packetAlignedMask = packetSize - 1;
+    const int innerSize = dst.innerSize();
+    const int outerSize = dst.outerSize();
+    const int alignedStep = (packetSize - dst.stride() % packetSize) & packetAlignedMask;
+    int alignedStart = ei_assign_traits<Derived1,Derived2>::DstIsAligned ? 0
+                     : ei_alignmentOffset(&dst.coeffRef(0,0), innerSize);
+
+    for(int i = 0; i < outerSize; ++i)
+    {
+      const int alignedEnd = alignedStart + ((innerSize-alignedStart) & ~packetAlignedMask);
+
+      // do the non-vectorizable part of the assignment
+      for (int index = 0; index<alignedStart ; ++index)
+      {
+        if(Derived1::Flags&RowMajorBit)
+          dst.copyCoeff(i, index, src);
+        else
+          dst.copyCoeff(index, i, src);
+      }
+
+      // do the vectorizable part of the assignment
+      for (int index = alignedStart; index<alignedEnd; index+=packetSize)
+      {
+        if(Derived1::Flags&RowMajorBit)
+          dst.template copyPacket<Derived2, Aligned, Unaligned>(i, index, src);
+        else
+          dst.template copyPacket<Derived2, Aligned, Unaligned>(index, i, src);
+      }
+
+      // do the non-vectorizable part of the assignment
+      for (int index = alignedEnd; index<innerSize ; ++index)
+      {
+        if(Derived1::Flags&RowMajorBit)
+          dst.copyCoeff(i, index, src);
+        else
+          dst.copyCoeff(index, i, src);
+      }
+
+      alignedStart = std::min<int>((alignedStart+alignedStep)%packetSize, innerSize);
+    }
+  }
+};
+
+/***************************************************************************
+* Part 4 : implementation of MatrixBase methods
+***************************************************************************/
+
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE Derived& MatrixBase<Derived>
+  ::lazyAssign(const MatrixBase<OtherDerived>& other)
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_SAME_MATRIX_SIZE(Derived,OtherDerived)
+  EIGEN_STATIC_ASSERT((ei_is_same_type<typename Derived::Scalar, typename OtherDerived::Scalar>::ret),
+    YOU_MIXED_DIFFERENT_NUMERIC_TYPES__YOU_NEED_TO_USE_THE_CAST_METHOD_OF_MATRIXBASE_TO_CAST_NUMERIC_TYPES_EXPLICITLY)
+  ei_assert(rows() == other.rows() && cols() == other.cols());
+  ei_assign_impl<Derived, OtherDerived>::run(derived(),other.derived());
+  return derived();
+}
+
+template<typename Derived, typename OtherDerived,
+         bool EvalBeforeAssigning = (int(OtherDerived::Flags) & EvalBeforeAssigningBit) != 0,
+         bool NeedToTranspose = Derived::IsVectorAtCompileTime
+                && OtherDerived::IsVectorAtCompileTime
+                && int(Derived::RowsAtCompileTime) == int(OtherDerived::ColsAtCompileTime)
+                && int(Derived::ColsAtCompileTime) == int(OtherDerived::RowsAtCompileTime)
+                && int(Derived::SizeAtCompileTime) != 1>
+struct ei_assign_selector;
+
+template<typename Derived, typename OtherDerived>
+struct ei_assign_selector<Derived,OtherDerived,false,false> {
+  EIGEN_STRONG_INLINE static Derived& run(Derived& dst, const OtherDerived& other) { return dst.lazyAssign(other.derived()); }
+};
+template<typename Derived, typename OtherDerived>
+struct ei_assign_selector<Derived,OtherDerived,true,false> {
+  EIGEN_STRONG_INLINE static Derived& run(Derived& dst, const OtherDerived& other) { return dst.lazyAssign(other.eval()); }
+};
+template<typename Derived, typename OtherDerived>
+struct ei_assign_selector<Derived,OtherDerived,false,true> {
+  EIGEN_STRONG_INLINE static Derived& run(Derived& dst, const OtherDerived& other) { return dst.lazyAssign(other.transpose()); }
+};
+template<typename Derived, typename OtherDerived>
+struct ei_assign_selector<Derived,OtherDerived,true,true> {
+  EIGEN_STRONG_INLINE static Derived& run(Derived& dst, const OtherDerived& other) { return dst.lazyAssign(other.transpose().eval()); }
+};
+
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE Derived& MatrixBase<Derived>
+  ::operator=(const MatrixBase<OtherDerived>& other)
+{
+  return ei_assign_selector<Derived,OtherDerived>::run(derived(), other.derived());
+}
+
+#endif // EIGEN_ASSIGN_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Block.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Block.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..7f422aa
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,752 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_BLOCK_H
+#define EIGEN_BLOCK_H
+
+/** \class Block
+  *
+  * \brief Expression of a fixed-size or dynamic-size block
+  *
+  * \param MatrixType the type of the object in which we are taking a block
+  * \param BlockRows the number of rows of the block we are taking at compile time (optional)
+  * \param BlockCols the number of columns of the block we are taking at compile time (optional)
+  * \param _PacketAccess allows to enforce aligned loads and stores if set to ForceAligned.
+  *                      The default is AsRequested. This parameter is internaly used by Eigen
+  *                      in expressions such as \code mat.block() += other; \endcode and most of
+  *                      the time this is the only way it is used.
+  * \param _DirectAccessStatus \internal used for partial specialization
+  *
+  * This class represents an expression of either a fixed-size or dynamic-size block. It is the return
+  * type of MatrixBase::block(int,int,int,int) and MatrixBase::block<int,int>(int,int) and
+  * most of the time this is the only way it is used.
+  *
+  * However, if you want to directly maniputate block expressions,
+  * for instance if you want to write a function returning such an expression, you
+  * will need to use this class.
+  *
+  * Here is an example illustrating the dynamic case:
+  * \include class_Block.cpp
+  * Output: \verbinclude class_Block.out
+  *
+  * \note Even though this expression has dynamic size, in the case where \a MatrixType
+  * has fixed size, this expression inherits a fixed maximal size which means that evaluating
+  * it does not cause a dynamic memory allocation.
+  *
+  * Here is an example illustrating the fixed-size case:
+  * \include class_FixedBlock.cpp
+  * Output: \verbinclude class_FixedBlock.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::block(int,int,int,int), MatrixBase::block(int,int), class VectorBlock
+  */
+
+template<typename MatrixType, int BlockRows, int BlockCols, int _PacketAccess, int _DirectAccessStatus>
+struct ei_traits<Block<MatrixType, BlockRows, BlockCols, _PacketAccess, _DirectAccessStatus> >
+{
+  typedef typename ei_traits<MatrixType>::Scalar Scalar;
+  typedef typename ei_nested<MatrixType>::type MatrixTypeNested;
+  typedef typename ei_unref<MatrixTypeNested>::type _MatrixTypeNested;
+  enum{
+    RowsAtCompileTime = ei_traits<MatrixType>::RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : BlockRows,
+    ColsAtCompileTime = ei_traits<MatrixType>::ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : BlockCols,
+    MaxRowsAtCompileTime = RowsAtCompileTime == 1 ? 1
+      : (BlockRows==Dynamic ? int(ei_traits<MatrixType>::MaxRowsAtCompileTime) : BlockRows),
+    MaxColsAtCompileTime = ColsAtCompileTime == 1 ? 1
+      : (BlockCols==Dynamic ? int(ei_traits<MatrixType>::MaxColsAtCompileTime) : BlockCols),
+    RowMajor = int(ei_traits<MatrixType>::Flags)&RowMajorBit,
+    InnerSize = RowMajor ? int(ColsAtCompileTime) : int(RowsAtCompileTime),
+    InnerMaxSize = RowMajor ? int(MaxColsAtCompileTime) : int(MaxRowsAtCompileTime),
+    MaskPacketAccessBit = (InnerMaxSize == Dynamic || (InnerSize >= ei_packet_traits<Scalar>::size))
+                        ? PacketAccessBit : 0,
+    FlagsLinearAccessBit = (RowsAtCompileTime == 1 || ColsAtCompileTime == 1) ? LinearAccessBit : 0,
+    Flags = (ei_traits<MatrixType>::Flags & (HereditaryBits | MaskPacketAccessBit | DirectAccessBit)) | FlagsLinearAccessBit,
+    CoeffReadCost = ei_traits<MatrixType>::CoeffReadCost,
+    PacketAccess = _PacketAccess
+  };
+  typedef typename ei_meta_if<int(PacketAccess)==ForceAligned,
+                 Block<MatrixType, BlockRows, BlockCols, _PacketAccess, _DirectAccessStatus>&,
+                 Block<MatrixType, BlockRows, BlockCols, ForceAligned, _DirectAccessStatus> >::ret AlignedDerivedType;
+};
+
+template<typename MatrixType, int BlockRows, int BlockCols, int PacketAccess, int _DirectAccessStatus> class Block
+  : public MatrixBase<Block<MatrixType, BlockRows, BlockCols, PacketAccess, _DirectAccessStatus> >
+{
+  public:
+
+    EIGEN_GENERIC_PUBLIC_INTERFACE(Block)
+
+    class InnerIterator;
+
+    /** Column or Row constructor
+      */
+    inline Block(const MatrixType& matrix, int i)
+      : m_matrix(matrix),
+        // It is a row if and only if BlockRows==1 and BlockCols==MatrixType::ColsAtCompileTime,
+        // and it is a column if and only if BlockRows==MatrixType::RowsAtCompileTime and BlockCols==1,
+        // all other cases are invalid.
+        // The case a 1x1 matrix seems ambiguous, but the result is the same anyway.
+        m_startRow( (BlockRows==1) && (BlockCols==MatrixType::ColsAtCompileTime) ? i : 0),
+        m_startCol( (BlockRows==MatrixType::RowsAtCompileTime) && (BlockCols==1) ? i : 0),
+        m_blockRows(matrix.rows()), // if it is a row, then m_blockRows has a fixed-size of 1, so no pb to try to overwrite it
+        m_blockCols(matrix.cols())  // same for m_blockCols
+    {
+      ei_assert( (i>=0) && (
+          ((BlockRows==1) && (BlockCols==MatrixType::ColsAtCompileTime) && i<matrix.rows())
+        ||((BlockRows==MatrixType::RowsAtCompileTime) && (BlockCols==1) && i<matrix.cols())));
+    }
+
+    /** Fixed-size constructor
+      */
+    inline Block(const MatrixType& matrix, int startRow, int startCol)
+      : m_matrix(matrix), m_startRow(startRow), m_startCol(startCol),
+        m_blockRows(matrix.rows()), m_blockCols(matrix.cols())
+    {
+      EIGEN_STATIC_ASSERT(RowsAtCompileTime!=Dynamic && ColsAtCompileTime!=Dynamic,THIS_METHOD_IS_ONLY_FOR_FIXED_SIZE)
+      ei_assert(startRow >= 0 && BlockRows >= 1 && startRow + BlockRows <= matrix.rows()
+          && startCol >= 0 && BlockCols >= 1 && startCol + BlockCols <= matrix.cols());
+    }
+
+    /** Dynamic-size constructor
+      */
+    inline Block(const MatrixType& matrix,
+          int startRow, int startCol,
+          int blockRows, int blockCols)
+      : m_matrix(matrix), m_startRow(startRow), m_startCol(startCol),
+                          m_blockRows(blockRows), m_blockCols(blockCols)
+    {
+      ei_assert((RowsAtCompileTime==Dynamic || RowsAtCompileTime==blockRows)
+          && (ColsAtCompileTime==Dynamic || ColsAtCompileTime==blockCols));
+      ei_assert(startRow >= 0 && blockRows >= 1 && startRow + blockRows <= matrix.rows()
+          && startCol >= 0 && blockCols >= 1 && startCol + blockCols <= matrix.cols());
+    }
+
+    EIGEN_INHERIT_ASSIGNMENT_OPERATORS(Block)
+
+    inline int rows() const { return m_blockRows.value(); }
+    inline int cols() const { return m_blockCols.value(); }
+
+    inline Scalar& coeffRef(int row, int col)
+    {
+      return m_matrix.const_cast_derived()
+               .coeffRef(row + m_startRow.value(), col + m_startCol.value());
+    }
+
+    inline const Scalar coeff(int row, int col) const
+    {
+      return m_matrix.coeff(row + m_startRow.value(), col + m_startCol.value());
+    }
+
+    inline Scalar& coeffRef(int index)
+    {
+      return m_matrix.const_cast_derived()
+             .coeffRef(m_startRow.value() + (RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : index),
+                       m_startCol.value() + (RowsAtCompileTime == 1 ? index : 0));
+    }
+
+    inline const Scalar coeff(int index) const
+    {
+      return m_matrix
+             .coeff(m_startRow.value() + (RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : index),
+                    m_startCol.value() + (RowsAtCompileTime == 1 ? index : 0));
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    inline PacketScalar packet(int row, int col) const
+    {
+      return m_matrix.template packet<Unaligned>
+              (row + m_startRow.value(), col + m_startCol.value());
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    inline void writePacket(int row, int col, const PacketScalar& x)
+    {
+      m_matrix.const_cast_derived().template writePacket<Unaligned>
+              (row + m_startRow.value(), col + m_startCol.value(), x);
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    inline PacketScalar packet(int index) const
+    {
+      return m_matrix.template packet<Unaligned>
+              (m_startRow.value() + (RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : index),
+               m_startCol.value() + (RowsAtCompileTime == 1 ? index : 0));
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    inline void writePacket(int index, const PacketScalar& x)
+    {
+      m_matrix.const_cast_derived().template writePacket<Unaligned>
+         (m_startRow.value() + (RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : index),
+          m_startCol.value() + (RowsAtCompileTime == 1 ? index : 0), x);
+    }
+
+  protected:
+
+    const typename MatrixType::Nested m_matrix;
+    const ei_int_if_dynamic<MatrixType::RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : Dynamic> m_startRow;
+    const ei_int_if_dynamic<MatrixType::ColsAtCompileTime == 1 ? 0 : Dynamic> m_startCol;
+    const ei_int_if_dynamic<RowsAtCompileTime> m_blockRows;
+    const ei_int_if_dynamic<ColsAtCompileTime> m_blockCols;
+};
+
+/** \internal */
+template<typename MatrixType, int BlockRows, int BlockCols, int PacketAccess>
+class Block<MatrixType,BlockRows,BlockCols,PacketAccess,HasDirectAccess>
+  : public MapBase<Block<MatrixType, BlockRows, BlockCols,PacketAccess,HasDirectAccess> >
+{
+  public:
+
+    _EIGEN_GENERIC_PUBLIC_INTERFACE(Block, MapBase<Block>)
+
+    class InnerIterator;
+    typedef typename ei_traits<Block>::AlignedDerivedType AlignedDerivedType;
+    friend class Block<MatrixType,BlockRows,BlockCols,PacketAccess==AsRequested?ForceAligned:AsRequested,HasDirectAccess>;
+
+    EIGEN_INHERIT_ASSIGNMENT_OPERATORS(Block)
+
+    AlignedDerivedType _convertToForceAligned()
+    {
+      return Block<MatrixType,BlockRows,BlockCols,ForceAligned,HasDirectAccess>
+                    (m_matrix, Base::m_data, Base::m_rows.value(), Base::m_cols.value());
+    }
+
+    /** Column or Row constructor
+      */
+    inline Block(const MatrixType& matrix, int i)
+      : Base(&matrix.const_cast_derived().coeffRef(
+              (BlockRows==1) && (BlockCols==MatrixType::ColsAtCompileTime) ? i : 0,
+              (BlockRows==MatrixType::RowsAtCompileTime) && (BlockCols==1) ? i : 0),
+             BlockRows==1 ? 1 : matrix.rows(),
+             BlockCols==1 ? 1 : matrix.cols()),
+        m_matrix(matrix)
+    {
+      ei_assert( (i>=0) && (
+          ((BlockRows==1) && (BlockCols==MatrixType::ColsAtCompileTime) && i<matrix.rows())
+        ||((BlockRows==MatrixType::RowsAtCompileTime) && (BlockCols==1) && i<matrix.cols())));
+    }
+
+    /** Fixed-size constructor
+      */
+    inline Block(const MatrixType& matrix, int startRow, int startCol)
+      : Base(&matrix.const_cast_derived().coeffRef(startRow,startCol)), m_matrix(matrix)
+    {
+      ei_assert(startRow >= 0 && BlockRows >= 1 && startRow + BlockRows <= matrix.rows()
+             && startCol >= 0 && BlockCols >= 1 && startCol + BlockCols <= matrix.cols());
+    }
+
+    /** Dynamic-size constructor
+      */
+    inline Block(const MatrixType& matrix,
+          int startRow, int startCol,
+          int blockRows, int blockCols)
+      : Base(&matrix.const_cast_derived().coeffRef(startRow,startCol), blockRows, blockCols),
+        m_matrix(matrix)
+    {
+      ei_assert((RowsAtCompileTime==Dynamic || RowsAtCompileTime==blockRows)
+             && (ColsAtCompileTime==Dynamic || ColsAtCompileTime==blockCols));
+      ei_assert(startRow >= 0 && blockRows >= 1 && startRow + blockRows <= matrix.rows()
+             && startCol >= 0 && blockCols >= 1 && startCol + blockCols <= matrix.cols());
+    }
+
+    inline int stride(void) const { return m_matrix.stride(); }
+
+  protected:
+
+    /** \internal used by allowAligned() */
+    inline Block(const MatrixType& matrix, const Scalar* data, int blockRows, int blockCols)
+      : Base(data, blockRows, blockCols), m_matrix(matrix)
+    {}
+
+    const typename MatrixType::Nested m_matrix;
+};
+
+/** \returns a dynamic-size expression of a block in *this.
+  *
+  * \param startRow the first row in the block
+  * \param startCol the first column in the block
+  * \param blockRows the number of rows in the block
+  * \param blockCols the number of columns in the block
+  *
+  * \addexample BlockIntIntIntInt \label How to reference a sub-matrix (dynamic-size)
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_block_int_int_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_block_int_int_int_int.out
+  *
+  * \note Even though the returned expression has dynamic size, in the case
+  * when it is applied to a fixed-size matrix, it inherits a fixed maximal size,
+  * which means that evaluating it does not cause a dynamic memory allocation.
+  *
+  * \sa class Block, block(int,int)
+  */
+template<typename Derived>
+inline typename BlockReturnType<Derived>::Type MatrixBase<Derived>
+  ::block(int startRow, int startCol, int blockRows, int blockCols)
+{
+  return typename BlockReturnType<Derived>::Type(derived(), startRow, startCol, blockRows, blockCols);
+}
+
+/** This is the const version of block(int,int,int,int). */
+template<typename Derived>
+inline const typename BlockReturnType<Derived>::Type MatrixBase<Derived>
+  ::block(int startRow, int startCol, int blockRows, int blockCols) const
+{
+  return typename BlockReturnType<Derived>::Type(derived(), startRow, startCol, blockRows, blockCols);
+}
+
+/** \returns a dynamic-size expression of a segment (i.e. a vector block) in *this.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * \addexample SegmentIntInt \label How to reference a sub-vector (dynamic size)
+  *
+  * \param start the first coefficient in the segment
+  * \param size the number of coefficients in the segment
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_segment_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_segment_int_int.out
+  *
+  * \note Even though the returned expression has dynamic size, in the case
+  * when it is applied to a fixed-size vector, it inherits a fixed maximal size,
+  * which means that evaluating it does not cause a dynamic memory allocation.
+  *
+  * \sa class Block, segment(int)
+  */
+template<typename Derived>
+inline typename BlockReturnType<Derived>::SubVectorType MatrixBase<Derived>
+  ::segment(int start, int size)
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return typename BlockReturnType<Derived>::SubVectorType(derived(), RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : start,
+                                   ColsAtCompileTime == 1 ? 0 : start,
+                                   RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : size,
+                                   ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : size);
+}
+
+/** This is the const version of segment(int,int).*/
+template<typename Derived>
+inline const typename BlockReturnType<Derived>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::segment(int start, int size) const
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return typename BlockReturnType<Derived>::SubVectorType(derived(), RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : start,
+                                   ColsAtCompileTime == 1 ? 0 : start,
+                                   RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : size,
+                                   ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : size);
+}
+
+/** \returns a dynamic-size expression of the first coefficients of *this.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * \param size the number of coefficients in the block
+  *
+  * \addexample BlockInt \label How to reference a sub-vector (fixed-size)
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_start_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_start_int.out
+  *
+  * \note Even though the returned expression has dynamic size, in the case
+  * when it is applied to a fixed-size vector, it inherits a fixed maximal size,
+  * which means that evaluating it does not cause a dynamic memory allocation.
+  *
+  * \sa class Block, block(int,int)
+  */
+template<typename Derived>
+inline typename BlockReturnType<Derived,Dynamic>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::start(int size)
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return Block<Derived,
+               RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : Dynamic,
+               ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : Dynamic>
+              (derived(), 0, 0,
+               RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : size,
+               ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : size);
+}
+
+/** This is the const version of start(int).*/
+template<typename Derived>
+inline const typename BlockReturnType<Derived,Dynamic>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::start(int size) const
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return Block<Derived,
+               RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : Dynamic,
+               ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : Dynamic>
+              (derived(), 0, 0,
+               RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : size,
+               ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : size);
+}
+
+/** \returns a dynamic-size expression of the last coefficients of *this.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * \param size the number of coefficients in the block
+  *
+  * \addexample BlockEnd \label How to reference the end of a vector (fixed-size)
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_end_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_end_int.out
+  *
+  * \note Even though the returned expression has dynamic size, in the case
+  * when it is applied to a fixed-size vector, it inherits a fixed maximal size,
+  * which means that evaluating it does not cause a dynamic memory allocation.
+  *
+  * \sa class Block, block(int,int)
+  */
+template<typename Derived>
+inline typename BlockReturnType<Derived,Dynamic>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::end(int size)
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return Block<Derived,
+               RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : Dynamic,
+               ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : Dynamic>
+              (derived(),
+               RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : rows() - size,
+               ColsAtCompileTime == 1 ? 0 : cols() - size,
+               RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : size,
+               ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : size);
+}
+
+/** This is the const version of end(int).*/
+template<typename Derived>
+inline const typename BlockReturnType<Derived,Dynamic>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::end(int size) const
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return Block<Derived,
+               RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : Dynamic,
+               ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : Dynamic>
+              (derived(),
+               RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : rows() - size,
+               ColsAtCompileTime == 1 ? 0 : cols() - size,
+               RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : size,
+               ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : size);
+}
+
+/** \returns a fixed-size expression of a segment (i.e. a vector block) in \c *this
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * The template parameter \a Size is the number of coefficients in the block
+  *
+  * \param start the index of the first element of the sub-vector
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_template_int_segment.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_template_int_segment.out
+  *
+  * \sa class Block
+  */
+template<typename Derived>
+template<int Size>
+inline typename BlockReturnType<Derived,Size>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::segment(int start)
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return Block<Derived,  (RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size),
+                         (ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size)>
+              (derived(), RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : start,
+                          ColsAtCompileTime == 1 ? 0 : start);
+}
+
+/** This is the const version of segment<int>(int).*/
+template<typename Derived>
+template<int Size>
+inline const typename BlockReturnType<Derived,Size>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::segment(int start) const
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return Block<Derived,  (RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size),
+                         (ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size)>
+              (derived(), RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : start,
+                          ColsAtCompileTime == 1 ? 0 : start);
+}
+
+/** \returns a fixed-size expression of the first coefficients of *this.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * The template parameter \a Size is the number of coefficients in the block
+  *
+  * \addexample BlockStart \label How to reference the start of a vector (fixed-size)
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_template_int_start.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_template_int_start.out
+  *
+  * \sa class Block
+  */
+template<typename Derived>
+template<int Size>
+inline typename BlockReturnType<Derived,Size>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::start()
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return Block<Derived, (RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size),
+                        (ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size)>(derived(), 0, 0);
+}
+
+/** This is the const version of start<int>().*/
+template<typename Derived>
+template<int Size>
+inline const typename BlockReturnType<Derived,Size>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::start() const
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return Block<Derived, (RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size),
+                        (ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size)>(derived(), 0, 0);
+}
+
+/** \returns a fixed-size expression of the last coefficients of *this.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * The template parameter \a Size is the number of coefficients in the block
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_template_int_end.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_template_int_end.out
+  *
+  * \sa class Block
+  */
+template<typename Derived>
+template<int Size>
+inline typename BlockReturnType<Derived,Size>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::end()
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return Block<Derived, RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size,
+                        ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size>
+           (derived(),
+            RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : rows() - Size,
+            ColsAtCompileTime == 1 ? 0 : cols() - Size);
+}
+
+/** This is the const version of end<int>.*/
+template<typename Derived>
+template<int Size>
+inline const typename BlockReturnType<Derived,Size>::SubVectorType
+MatrixBase<Derived>::end() const
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return Block<Derived, RowsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size,
+                        ColsAtCompileTime == 1 ? 1 : Size>
+           (derived(),
+            RowsAtCompileTime == 1 ? 0 : rows() - Size,
+            ColsAtCompileTime == 1 ? 0 : cols() - Size);
+}
+
+/** \returns a dynamic-size expression of a corner of *this.
+  *
+  * \param type the type of corner. Can be \a Eigen::TopLeft, \a Eigen::TopRight,
+  * \a Eigen::BottomLeft, \a Eigen::BottomRight.
+  * \param cRows the number of rows in the corner
+  * \param cCols the number of columns in the corner
+  *
+  * \addexample BlockCornerDynamicSize \label How to reference a sub-corner of a matrix
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_corner_enum_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_corner_enum_int_int.out
+  *
+  * \note Even though the returned expression has dynamic size, in the case
+  * when it is applied to a fixed-size matrix, it inherits a fixed maximal size,
+  * which means that evaluating it does not cause a dynamic memory allocation.
+  *
+  * \sa class Block, block(int,int,int,int)
+  */
+template<typename Derived>
+inline typename BlockReturnType<Derived>::Type MatrixBase<Derived>
+  ::corner(CornerType type, int cRows, int cCols)
+{
+  switch(type)
+  {
+    default:
+      ei_assert(false && "Bad corner type.");
+    case TopLeft:
+      return typename BlockReturnType<Derived>::Type(derived(), 0, 0, cRows, cCols);
+    case TopRight:
+      return typename BlockReturnType<Derived>::Type(derived(), 0, cols() - cCols, cRows, cCols);
+    case BottomLeft:
+      return typename BlockReturnType<Derived>::Type(derived(), rows() - cRows, 0, cRows, cCols);
+    case BottomRight:
+      return typename BlockReturnType<Derived>::Type(derived(), rows() - cRows, cols() - cCols, cRows, cCols);
+  }
+}
+
+/** This is the const version of corner(CornerType, int, int).*/
+template<typename Derived>
+inline const typename BlockReturnType<Derived>::Type
+MatrixBase<Derived>::corner(CornerType type, int cRows, int cCols) const
+{
+  switch(type)
+  {
+    default:
+      ei_assert(false && "Bad corner type.");
+    case TopLeft:
+      return typename BlockReturnType<Derived>::Type(derived(), 0, 0, cRows, cCols);
+    case TopRight:
+      return typename BlockReturnType<Derived>::Type(derived(), 0, cols() - cCols, cRows, cCols);
+    case BottomLeft:
+      return typename BlockReturnType<Derived>::Type(derived(), rows() - cRows, 0, cRows, cCols);
+    case BottomRight:
+      return typename BlockReturnType<Derived>::Type(derived(), rows() - cRows, cols() - cCols, cRows, cCols);
+  }
+}
+
+/** \returns a fixed-size expression of a corner of *this.
+  *
+  * \param type the type of corner. Can be \a Eigen::TopLeft, \a Eigen::TopRight,
+  * \a Eigen::BottomLeft, \a Eigen::BottomRight.
+  *
+  * The template parameters CRows and CCols arethe number of rows and columns in the corner.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_template_int_int_corner_enum.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_template_int_int_corner_enum.out
+  *
+  * \sa class Block, block(int,int,int,int)
+  */
+template<typename Derived>
+template<int CRows, int CCols>
+inline typename BlockReturnType<Derived, CRows, CCols>::Type
+MatrixBase<Derived>::corner(CornerType type)
+{
+  switch(type)
+  {
+    default:
+      ei_assert(false && "Bad corner type.");
+    case TopLeft:
+      return Block<Derived, CRows, CCols>(derived(), 0, 0);
+    case TopRight:
+      return Block<Derived, CRows, CCols>(derived(), 0, cols() - CCols);
+    case BottomLeft:
+      return Block<Derived, CRows, CCols>(derived(), rows() - CRows, 0);
+    case BottomRight:
+      return Block<Derived, CRows, CCols>(derived(), rows() - CRows, cols() - CCols);
+  }
+}
+
+/** This is the const version of corner<int, int>(CornerType).*/
+template<typename Derived>
+template<int CRows, int CCols>
+inline const typename BlockReturnType<Derived, CRows, CCols>::Type
+MatrixBase<Derived>::corner(CornerType type) const
+{
+  switch(type)
+  {
+    default:
+      ei_assert(false && "Bad corner type.");
+    case TopLeft:
+      return Block<Derived, CRows, CCols>(derived(), 0, 0);
+    case TopRight:
+      return Block<Derived, CRows, CCols>(derived(), 0, cols() - CCols);
+    case BottomLeft:
+      return Block<Derived, CRows, CCols>(derived(), rows() - CRows, 0);
+    case BottomRight:
+      return Block<Derived, CRows, CCols>(derived(), rows() - CRows, cols() - CCols);
+  }
+}
+
+/** \returns a fixed-size expression of a block in *this.
+  *
+  * The template parameters \a BlockRows and \a BlockCols are the number of
+  * rows and columns in the block.
+  *
+  * \param startRow the first row in the block
+  * \param startCol the first column in the block
+  *
+  * \addexample BlockSubMatrixFixedSize \label How to reference a sub-matrix (fixed-size)
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_block_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_block_int_int.out
+  *
+  * \note since block is a templated member, the keyword template has to be used
+  * if the matrix type is also a template parameter: \code m.template block<3,3>(1,1); \endcode
+  *
+  * \sa class Block, block(int,int,int,int)
+  */
+template<typename Derived>
+template<int BlockRows, int BlockCols>
+inline typename BlockReturnType<Derived, BlockRows, BlockCols>::Type
+MatrixBase<Derived>::block(int startRow, int startCol)
+{
+  return Block<Derived, BlockRows, BlockCols>(derived(), startRow, startCol);
+}
+
+/** This is the const version of block<>(int, int). */
+template<typename Derived>
+template<int BlockRows, int BlockCols>
+inline const typename BlockReturnType<Derived, BlockRows, BlockCols>::Type
+MatrixBase<Derived>::block(int startRow, int startCol) const
+{
+  return Block<Derived, BlockRows, BlockCols>(derived(), startRow, startCol);
+}
+
+/** \returns an expression of the \a i-th column of *this. Note that the numbering starts at 0.
+  *
+  * \addexample BlockColumn \label How to reference a single column of a matrix
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_col.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_col.out
+  *
+  * \sa row(), class Block */
+template<typename Derived>
+inline typename MatrixBase<Derived>::ColXpr
+MatrixBase<Derived>::col(int i)
+{
+  return ColXpr(derived(), i);
+}
+
+/** This is the const version of col(). */
+template<typename Derived>
+inline const typename MatrixBase<Derived>::ColXpr
+MatrixBase<Derived>::col(int i) const
+{
+  return ColXpr(derived(), i);
+}
+
+/** \returns an expression of the \a i-th row of *this. Note that the numbering starts at 0.
+  *
+  * \addexample BlockRow \label How to reference a single row of a matrix
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_row.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_row.out
+  *
+  * \sa col(), class Block */
+template<typename Derived>
+inline typename MatrixBase<Derived>::RowXpr
+MatrixBase<Derived>::row(int i)
+{
+  return RowXpr(derived(), i);
+}
+
+/** This is the const version of row(). */
+template<typename Derived>
+inline const typename MatrixBase<Derived>::RowXpr
+MatrixBase<Derived>::row(int i) const
+{
+  return RowXpr(derived(), i);
+}
+
+#endif // EIGEN_BLOCK_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CacheFriendlyProduct.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CacheFriendlyProduct.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..b1362b0
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,753 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_CACHE_FRIENDLY_PRODUCT_H
+#define EIGEN_CACHE_FRIENDLY_PRODUCT_H
+
+template <int L2MemorySize,typename Scalar>
+struct ei_L2_block_traits {
+  enum {width = 8 * ei_meta_sqrt<L2MemorySize/(64*sizeof(Scalar))>::ret };
+};
+
+#ifndef EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS
+
+template<typename Scalar>
+static void ei_cache_friendly_product(
+  int _rows, int _cols, int depth,
+  bool _lhsRowMajor, const Scalar* _lhs, int _lhsStride,
+  bool _rhsRowMajor, const Scalar* _rhs, int _rhsStride,
+  bool resRowMajor, Scalar* res, int resStride)
+{
+  const Scalar* EIGEN_RESTRICT lhs;
+  const Scalar* EIGEN_RESTRICT rhs;
+  int lhsStride, rhsStride, rows, cols;
+  bool lhsRowMajor;
+
+  if (resRowMajor)
+  {
+    lhs = _rhs;
+    rhs = _lhs;
+    lhsStride = _rhsStride;
+    rhsStride = _lhsStride;
+    cols = _rows;
+    rows = _cols;
+    lhsRowMajor = !_rhsRowMajor;
+    ei_assert(_lhsRowMajor);
+  }
+  else
+  {
+    lhs = _lhs;
+    rhs = _rhs;
+    lhsStride = _lhsStride;
+    rhsStride = _rhsStride;
+    rows = _rows;
+    cols = _cols;
+    lhsRowMajor = _lhsRowMajor;
+    ei_assert(!_rhsRowMajor);
+  }
+
+  typedef typename ei_packet_traits<Scalar>::type PacketType;
+
+  enum {
+    PacketSize = sizeof(PacketType)/sizeof(Scalar),
+    #if (defined __i386__)
+    // i386 architecture provides only 8 xmm registers,
+    // so let's reduce the max number of rows processed at once.
+    MaxBlockRows = 4,
+    MaxBlockRows_ClampingMask = 0xFFFFFC,
+    #else
+    MaxBlockRows = 8,
+    MaxBlockRows_ClampingMask = 0xFFFFF8,
+    #endif
+    // maximal size of the blocks fitted in L2 cache
+    MaxL2BlockSize = ei_L2_block_traits<EIGEN_TUNE_FOR_CPU_CACHE_SIZE,Scalar>::width
+  };
+
+  const bool resIsAligned = (PacketSize==1) || (((resStride%PacketSize) == 0) && (size_t(res)%16==0));
+
+  const int remainingSize = depth % PacketSize;
+  const int size = depth - remainingSize; // third dimension of the product clamped to packet boundaries
+  const int l2BlockRows = MaxL2BlockSize > rows ? rows : MaxL2BlockSize;
+  const int l2BlockCols = MaxL2BlockSize > cols ? cols : MaxL2BlockSize;
+  const int l2BlockSize = MaxL2BlockSize > size ? size : MaxL2BlockSize;
+  const int l2BlockSizeAligned = (1 + std::max(l2BlockSize,l2BlockCols)/PacketSize)*PacketSize;
+  const bool needRhsCopy = (PacketSize>1) && ((rhsStride%PacketSize!=0) || (size_t(rhs)%16!=0));
+  Scalar* EIGEN_RESTRICT block = 0;
+  const int allocBlockSize = l2BlockRows*size;
+  block = ei_aligned_stack_new(Scalar, allocBlockSize);
+  Scalar* EIGEN_RESTRICT rhsCopy
+    = ei_aligned_stack_new(Scalar, l2BlockSizeAligned*l2BlockSizeAligned);
+
+  // loops on each L2 cache friendly blocks of the result
+  for(int l2i=0; l2i<rows; l2i+=l2BlockRows)
+  {
+    const int l2blockRowEnd = std::min(l2i+l2BlockRows, rows);
+    const int l2blockRowEndBW = l2blockRowEnd & MaxBlockRows_ClampingMask;    // end of the rows aligned to bw
+    const int l2blockRemainingRows = l2blockRowEnd - l2blockRowEndBW;         // number of remaining rows
+    //const int l2blockRowEndBWPlusOne = l2blockRowEndBW + (l2blockRemainingRows?0:MaxBlockRows);
+
+    // build a cache friendly blocky matrix
+    int count = 0;
+
+    // copy l2blocksize rows of m_lhs to blocks of ps x bw
+    for(int l2k=0; l2k<size; l2k+=l2BlockSize)
+    {
+      const int l2blockSizeEnd = std::min(l2k+l2BlockSize, size);
+
+      for (int i = l2i; i<l2blockRowEndBW/*PlusOne*/; i+=MaxBlockRows)
+      {
+        // TODO merge the "if l2blockRemainingRows" using something like:
+        // const int blockRows = std::min(i+MaxBlockRows, rows) - i;
+
+        for (int k=l2k; k<l2blockSizeEnd; k+=PacketSize)
+        {
+          // TODO write these loops using meta unrolling
+          // negligible for large matrices but useful for small ones
+          if (lhsRowMajor)
+          {
+            for (int w=0; w<MaxBlockRows; ++w)
+              for (int s=0; s<PacketSize; ++s)
+                block[count++] = lhs[(i+w)*lhsStride + (k+s)];
+          }
+          else
+          {
+            for (int w=0; w<MaxBlockRows; ++w)
+              for (int s=0; s<PacketSize; ++s)
+                block[count++] = lhs[(i+w) + (k+s)*lhsStride];
+          }
+        }
+      }
+      if (l2blockRemainingRows>0)
+      {
+        for (int k=l2k; k<l2blockSizeEnd; k+=PacketSize)
+        {
+          if (lhsRowMajor)
+          {
+            for (int w=0; w<l2blockRemainingRows; ++w)
+              for (int s=0; s<PacketSize; ++s)
+                block[count++] = lhs[(l2blockRowEndBW+w)*lhsStride + (k+s)];
+          }
+          else
+          {
+            for (int w=0; w<l2blockRemainingRows; ++w)
+              for (int s=0; s<PacketSize; ++s)
+                block[count++] = lhs[(l2blockRowEndBW+w) + (k+s)*lhsStride];
+          }
+        }
+      }
+    }
+
+    for(int l2j=0; l2j<cols; l2j+=l2BlockCols)
+    {
+      int l2blockColEnd = std::min(l2j+l2BlockCols, cols);
+
+      for(int l2k=0; l2k<size; l2k+=l2BlockSize)
+      {
+        // acumulate bw rows of lhs time a single column of rhs to a bw x 1 block of res
+        int l2blockSizeEnd = std::min(l2k+l2BlockSize, size);
+
+        // if not aligned, copy the rhs block
+        if (needRhsCopy)
+          for(int l1j=l2j; l1j<l2blockColEnd; l1j+=1)
+          {
+            ei_internal_assert(l2BlockSizeAligned*(l1j-l2j)+(l2blockSizeEnd-l2k) < l2BlockSizeAligned*l2BlockSizeAligned);
+            memcpy(rhsCopy+l2BlockSizeAligned*(l1j-l2j),&(rhs[l1j*rhsStride+l2k]),(l2blockSizeEnd-l2k)*sizeof(Scalar));
+          }
+
+        // for each bw x 1 result's block
+        for(int l1i=l2i; l1i<l2blockRowEndBW; l1i+=MaxBlockRows)
+        {
+          int offsetblock = l2k * (l2blockRowEnd-l2i) + (l1i-l2i)*(l2blockSizeEnd-l2k) - l2k*MaxBlockRows;
+          const Scalar* EIGEN_RESTRICT localB = &block[offsetblock];
+
+          for(int l1j=l2j; l1j<l2blockColEnd; l1j+=1)
+          {
+            const Scalar* EIGEN_RESTRICT rhsColumn;
+            if (needRhsCopy)
+              rhsColumn = &(rhsCopy[l2BlockSizeAligned*(l1j-l2j)-l2k]);
+            else
+              rhsColumn = &(rhs[l1j*rhsStride]);
+
+            PacketType dst[MaxBlockRows];
+            dst[3] = dst[2] = dst[1] = dst[0] = ei_pset1(Scalar(0.));
+            if (MaxBlockRows==8)
+              dst[7] = dst[6] = dst[5] = dst[4] = dst[0];
+
+            PacketType tmp;
+
+            for(int k=l2k; k<l2blockSizeEnd; k+=PacketSize)
+            {
+              tmp = ei_ploadu(&rhsColumn[k]);
+              PacketType A0, A1, A2, A3, A4, A5;
+              A0 = ei_pload(localB + k*MaxBlockRows);
+              A1 = ei_pload(localB + k*MaxBlockRows+1*PacketSize);
+              A2 = ei_pload(localB + k*MaxBlockRows+2*PacketSize);
+              A3 = ei_pload(localB + k*MaxBlockRows+3*PacketSize);
+              if (MaxBlockRows==8) A4 = ei_pload(localB + k*MaxBlockRows+4*PacketSize);
+              if (MaxBlockRows==8) A5 = ei_pload(localB + k*MaxBlockRows+5*PacketSize);
+              dst[0] = ei_pmadd(tmp, A0, dst[0]);
+              if (MaxBlockRows==8) A0 = ei_pload(localB + k*MaxBlockRows+6*PacketSize);
+              dst[1] = ei_pmadd(tmp, A1, dst[1]);
+              if (MaxBlockRows==8) A1 = ei_pload(localB + k*MaxBlockRows+7*PacketSize);
+              dst[2] = ei_pmadd(tmp, A2, dst[2]);
+              dst[3] = ei_pmadd(tmp, A3, dst[3]);
+              if (MaxBlockRows==8)
+              {
+                dst[4] = ei_pmadd(tmp, A4, dst[4]);
+                dst[5] = ei_pmadd(tmp, A5, dst[5]);
+                dst[6] = ei_pmadd(tmp, A0, dst[6]);
+                dst[7] = ei_pmadd(tmp, A1, dst[7]);
+              }
+            }
+
+            Scalar* EIGEN_RESTRICT localRes = &(res[l1i + l1j*resStride]);
+
+            if (PacketSize>1 && resIsAligned)
+            {
+              // the result is aligned: let's do packet reduction
+              ei_pstore(&(localRes[0]), ei_padd(ei_pload(&(localRes[0])), ei_preduxp(&dst[0])));
+              if (PacketSize==2)
+                ei_pstore(&(localRes[2]), ei_padd(ei_pload(&(localRes[2])), ei_preduxp(&(dst[2]))));
+              if (MaxBlockRows==8)
+              {
+                ei_pstore(&(localRes[4]), ei_padd(ei_pload(&(localRes[4])), ei_preduxp(&(dst[4]))));
+                if (PacketSize==2)
+                  ei_pstore(&(localRes[6]), ei_padd(ei_pload(&(localRes[6])), ei_preduxp(&(dst[6]))));
+              }
+            }
+            else
+            {
+              // not aligned => per coeff packet reduction
+              localRes[0] += ei_predux(dst[0]);
+              localRes[1] += ei_predux(dst[1]);
+              localRes[2] += ei_predux(dst[2]);
+              localRes[3] += ei_predux(dst[3]);
+              if (MaxBlockRows==8)
+              {
+                localRes[4] += ei_predux(dst[4]);
+                localRes[5] += ei_predux(dst[5]);
+                localRes[6] += ei_predux(dst[6]);
+                localRes[7] += ei_predux(dst[7]);
+              }
+            }
+          }
+        }
+        if (l2blockRemainingRows>0)
+        {
+          int offsetblock = l2k * (l2blockRowEnd-l2i) + (l2blockRowEndBW-l2i)*(l2blockSizeEnd-l2k) - l2k*l2blockRemainingRows;
+          const Scalar* localB = &block[offsetblock];
+
+          for(int l1j=l2j; l1j<l2blockColEnd; l1j+=1)
+          {
+            const Scalar* EIGEN_RESTRICT rhsColumn;
+            if (needRhsCopy)
+              rhsColumn = &(rhsCopy[l2BlockSizeAligned*(l1j-l2j)-l2k]);
+            else
+              rhsColumn = &(rhs[l1j*rhsStride]);
+
+            PacketType dst[MaxBlockRows];
+            dst[3] = dst[2] = dst[1] = dst[0] = ei_pset1(Scalar(0.));
+            if (MaxBlockRows==8)
+              dst[7] = dst[6] = dst[5] = dst[4] = dst[0];
+
+            // let's declare a few other temporary registers
+            PacketType tmp;
+
+            for(int k=l2k; k<l2blockSizeEnd; k+=PacketSize)
+            {
+              tmp = ei_pload(&rhsColumn[k]);
+
+                                           dst[0] = ei_pmadd(tmp, ei_pload(&(localB[k*l2blockRemainingRows             ])), dst[0]);
+              if (l2blockRemainingRows>=2) dst[1] = ei_pmadd(tmp, ei_pload(&(localB[k*l2blockRemainingRows+  PacketSize])), dst[1]);
+              if (l2blockRemainingRows>=3) dst[2] = ei_pmadd(tmp, ei_pload(&(localB[k*l2blockRemainingRows+2*PacketSize])), dst[2]);
+              if (l2blockRemainingRows>=4) dst[3] = ei_pmadd(tmp, ei_pload(&(localB[k*l2blockRemainingRows+3*PacketSize])), dst[3]);
+              if (MaxBlockRows==8)
+              {
+                if (l2blockRemainingRows>=5) dst[4] = ei_pmadd(tmp, ei_pload(&(localB[k*l2blockRemainingRows+4*PacketSize])), dst[4]);
+                if (l2blockRemainingRows>=6) dst[5] = ei_pmadd(tmp, ei_pload(&(localB[k*l2blockRemainingRows+5*PacketSize])), dst[5]);
+                if (l2blockRemainingRows>=7) dst[6] = ei_pmadd(tmp, ei_pload(&(localB[k*l2blockRemainingRows+6*PacketSize])), dst[6]);
+                if (l2blockRemainingRows>=8) dst[7] = ei_pmadd(tmp, ei_pload(&(localB[k*l2blockRemainingRows+7*PacketSize])), dst[7]);
+              }
+            }
+
+            Scalar* EIGEN_RESTRICT localRes = &(res[l2blockRowEndBW + l1j*resStride]);
+
+            // process the remaining rows once at a time
+                                         localRes[0] += ei_predux(dst[0]);
+            if (l2blockRemainingRows>=2) localRes[1] += ei_predux(dst[1]);
+            if (l2blockRemainingRows>=3) localRes[2] += ei_predux(dst[2]);
+            if (l2blockRemainingRows>=4) localRes[3] += ei_predux(dst[3]);
+            if (MaxBlockRows==8)
+            {
+              if (l2blockRemainingRows>=5) localRes[4] += ei_predux(dst[4]);
+              if (l2blockRemainingRows>=6) localRes[5] += ei_predux(dst[5]);
+              if (l2blockRemainingRows>=7) localRes[6] += ei_predux(dst[6]);
+              if (l2blockRemainingRows>=8) localRes[7] += ei_predux(dst[7]);
+            }
+
+          }
+        }
+      }
+    }
+  }
+  if (PacketSize>1 && remainingSize)
+  {
+    if (lhsRowMajor)
+    {
+      for (int j=0; j<cols; ++j)
+        for (int i=0; i<rows; ++i)
+        {
+          Scalar tmp = lhs[i*lhsStride+size] * rhs[j*rhsStride+size];
+          // FIXME this loop get vectorized by the compiler !
+          for (int k=1; k<remainingSize; ++k)
+            tmp += lhs[i*lhsStride+size+k] * rhs[j*rhsStride+size+k];
+          res[i+j*resStride] += tmp;
+        }
+    }
+    else
+    {
+      for (int j=0; j<cols; ++j)
+        for (int i=0; i<rows; ++i)
+        {
+          Scalar tmp = lhs[i+size*lhsStride] * rhs[j*rhsStride+size];
+          for (int k=1; k<remainingSize; ++k)
+            tmp += lhs[i+(size+k)*lhsStride] * rhs[j*rhsStride+size+k];
+          res[i+j*resStride] += tmp;
+        }
+    }
+  }
+
+  ei_aligned_stack_delete(Scalar, block, allocBlockSize);
+  ei_aligned_stack_delete(Scalar, rhsCopy, l2BlockSizeAligned*l2BlockSizeAligned);
+}
+
+#endif // EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS
+
+/* Optimized col-major matrix * vector product:
+ * This algorithm processes 4 columns at onces that allows to both reduce
+ * the number of load/stores of the result by a factor 4 and to reduce
+ * the instruction dependency. Moreover, we know that all bands have the
+ * same alignment pattern.
+ * TODO: since rhs gets evaluated only once, no need to evaluate it
+ */
+template<typename Scalar, typename RhsType>
+static EIGEN_DONT_INLINE void ei_cache_friendly_product_colmajor_times_vector(
+  int size,
+  const Scalar* lhs, int lhsStride,
+  const RhsType& rhs,
+  Scalar* res)
+{
+  #ifdef _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS
+  #error _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS has already been defined
+  #endif
+  #define _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS(A0,A13,A2) \
+    ei_pstore(&res[j], \
+      ei_padd(ei_pload(&res[j]), \
+        ei_padd( \
+          ei_padd(ei_pmul(ptmp0,EIGEN_CAT(ei_ploa , A0)(&lhs0[j])), \
+                  ei_pmul(ptmp1,EIGEN_CAT(ei_ploa , A13)(&lhs1[j]))), \
+          ei_padd(ei_pmul(ptmp2,EIGEN_CAT(ei_ploa , A2)(&lhs2[j])), \
+                  ei_pmul(ptmp3,EIGEN_CAT(ei_ploa , A13)(&lhs3[j]))) )))
+
+  typedef typename ei_packet_traits<Scalar>::type Packet;
+  const int PacketSize = sizeof(Packet)/sizeof(Scalar);
+
+  enum { AllAligned = 0, EvenAligned, FirstAligned, NoneAligned };
+  const int columnsAtOnce = 4;
+  const int peels = 2;
+  const int PacketAlignedMask = PacketSize-1;
+  const int PeelAlignedMask = PacketSize*peels-1;
+
+  // How many coeffs of the result do we have to skip to be aligned.
+  // Here we assume data are at least aligned on the base scalar type that is mandatory anyway.
+  const int alignedStart = ei_alignmentOffset(res,size);
+  const int alignedSize = PacketSize>1 ? alignedStart + ((size-alignedStart) & ~PacketAlignedMask) : 0;
+  const int peeledSize  = peels>1 ? alignedStart + ((alignedSize-alignedStart) & ~PeelAlignedMask) : alignedStart;
+
+  const int alignmentStep = PacketSize>1 ? (PacketSize - lhsStride % PacketSize) & PacketAlignedMask : 0;
+  int alignmentPattern = alignmentStep==0 ? AllAligned
+                       : alignmentStep==(PacketSize/2) ? EvenAligned
+                       : FirstAligned;
+
+  // we cannot assume the first element is aligned because of sub-matrices
+  const int lhsAlignmentOffset = ei_alignmentOffset(lhs,size);
+
+  // find how many columns do we have to skip to be aligned with the result (if possible)
+  int skipColumns = 0;
+  if (PacketSize>1)
+  {
+    ei_internal_assert(size_t(lhs+lhsAlignmentOffset)%sizeof(Packet)==0 || size<PacketSize);
+
+    while (skipColumns<PacketSize &&
+           alignedStart != ((lhsAlignmentOffset + alignmentStep*skipColumns)%PacketSize))
+      ++skipColumns;
+    if (skipColumns==PacketSize)
+    {
+      // nothing can be aligned, no need to skip any column
+      alignmentPattern = NoneAligned;
+      skipColumns = 0;
+    }
+    else
+    {
+      skipColumns = std::min(skipColumns,rhs.size());
+      // note that the skiped columns are processed later.
+    }
+
+    ei_internal_assert((alignmentPattern==NoneAligned) || (size_t(lhs+alignedStart+lhsStride*skipColumns)%sizeof(Packet))==0);
+  }
+
+  int offset1 = (FirstAligned && alignmentStep==1?3:1);
+  int offset3 = (FirstAligned && alignmentStep==1?1:3);
+
+  int columnBound = ((rhs.size()-skipColumns)/columnsAtOnce)*columnsAtOnce + skipColumns;
+  for (int i=skipColumns; i<columnBound; i+=columnsAtOnce)
+  {
+    Packet ptmp0 = ei_pset1(rhs[i]),   ptmp1 = ei_pset1(rhs[i+offset1]),
+           ptmp2 = ei_pset1(rhs[i+2]), ptmp3 = ei_pset1(rhs[i+offset3]);
+
+    // this helps a lot generating better binary code
+    const Scalar *lhs0 = lhs + i*lhsStride, *lhs1 = lhs + (i+offset1)*lhsStride,
+                 *lhs2 = lhs + (i+2)*lhsStride, *lhs3 = lhs + (i+offset3)*lhsStride;
+
+    if (PacketSize>1)
+    {
+      /* explicit vectorization */
+      // process initial unaligned coeffs
+      for (int j=0; j<alignedStart; ++j)
+        res[j] += ei_pfirst(ptmp0)*lhs0[j] + ei_pfirst(ptmp1)*lhs1[j] + ei_pfirst(ptmp2)*lhs2[j] + ei_pfirst(ptmp3)*lhs3[j];
+
+      if (alignedSize>alignedStart)
+      {
+        switch(alignmentPattern)
+        {
+          case AllAligned:
+            for (int j = alignedStart; j<alignedSize; j+=PacketSize)
+              _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS(d,d,d);
+            break;
+          case EvenAligned:
+            for (int j = alignedStart; j<alignedSize; j+=PacketSize)
+              _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS(d,du,d);
+            break;
+          case FirstAligned:
+            if(peels>1)
+            {
+              Packet A00, A01, A02, A03, A10, A11, A12, A13;
+
+              A01 = ei_pload(&lhs1[alignedStart-1]);
+              A02 = ei_pload(&lhs2[alignedStart-2]);
+              A03 = ei_pload(&lhs3[alignedStart-3]);
+
+              for (int j = alignedStart; j<peeledSize; j+=peels*PacketSize)
+              {
+                A11 = ei_pload(&lhs1[j-1+PacketSize]);  ei_palign<1>(A01,A11);
+                A12 = ei_pload(&lhs2[j-2+PacketSize]);  ei_palign<2>(A02,A12);
+                A13 = ei_pload(&lhs3[j-3+PacketSize]);  ei_palign<3>(A03,A13);
+
+                A00 = ei_pload (&lhs0[j]);
+                A10 = ei_pload (&lhs0[j+PacketSize]);
+                A00 = ei_pmadd(ptmp0, A00, ei_pload(&res[j]));
+                A10 = ei_pmadd(ptmp0, A10, ei_pload(&res[j+PacketSize]));
+
+                A00 = ei_pmadd(ptmp1, A01, A00);
+                A01 = ei_pload(&lhs1[j-1+2*PacketSize]);  ei_palign<1>(A11,A01);
+                A00 = ei_pmadd(ptmp2, A02, A00);
+                A02 = ei_pload(&lhs2[j-2+2*PacketSize]);  ei_palign<2>(A12,A02);
+                A00 = ei_pmadd(ptmp3, A03, A00);
+                ei_pstore(&res[j],A00);
+                A03 = ei_pload(&lhs3[j-3+2*PacketSize]);  ei_palign<3>(A13,A03);
+                A10 = ei_pmadd(ptmp1, A11, A10);
+                A10 = ei_pmadd(ptmp2, A12, A10);
+                A10 = ei_pmadd(ptmp3, A13, A10);
+                ei_pstore(&res[j+PacketSize],A10);
+              }
+            }
+            for (int j = peeledSize; j<alignedSize; j+=PacketSize)
+              _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS(d,du,du);
+            break;
+          default:
+            for (int j = alignedStart; j<alignedSize; j+=PacketSize)
+              _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS(du,du,du);
+            break;
+        }
+      }
+    } // end explicit vectorization
+
+    /* process remaining coeffs (or all if there is no explicit vectorization) */
+    for (int j=alignedSize; j<size; ++j)
+      res[j] += ei_pfirst(ptmp0)*lhs0[j] + ei_pfirst(ptmp1)*lhs1[j] + ei_pfirst(ptmp2)*lhs2[j] + ei_pfirst(ptmp3)*lhs3[j];
+  }
+
+  // process remaining first and last columns (at most columnsAtOnce-1)
+  int end = rhs.size();
+  int start = columnBound;
+  do
+  {
+    for (int i=start; i<end; ++i)
+    {
+      Packet ptmp0 = ei_pset1(rhs[i]);
+      const Scalar* lhs0 = lhs + i*lhsStride;
+
+      if (PacketSize>1)
+      {
+        /* explicit vectorization */
+        // process first unaligned result's coeffs
+        for (int j=0; j<alignedStart; ++j)
+          res[j] += ei_pfirst(ptmp0) * lhs0[j];
+
+        // process aligned result's coeffs
+        if ((size_t(lhs0+alignedStart)%sizeof(Packet))==0)
+          for (int j = alignedStart;j<alignedSize;j+=PacketSize)
+            ei_pstore(&res[j], ei_pmadd(ptmp0,ei_pload(&lhs0[j]),ei_pload(&res[j])));
+        else
+          for (int j = alignedStart;j<alignedSize;j+=PacketSize)
+            ei_pstore(&res[j], ei_pmadd(ptmp0,ei_ploadu(&lhs0[j]),ei_pload(&res[j])));
+      }
+
+      // process remaining scalars (or all if no explicit vectorization)
+      for (int j=alignedSize; j<size; ++j)
+        res[j] += ei_pfirst(ptmp0) * lhs0[j];
+    }
+    if (skipColumns)
+    {
+      start = 0;
+      end = skipColumns;
+      skipColumns = 0;
+    }
+    else
+      break;
+  } while(PacketSize>1);
+  #undef _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS
+}
+
+// TODO add peeling to mask unaligned load/stores
+template<typename Scalar, typename ResType>
+static EIGEN_DONT_INLINE void ei_cache_friendly_product_rowmajor_times_vector(
+  const Scalar* lhs, int lhsStride,
+  const Scalar* rhs, int rhsSize,
+  ResType& res)
+{
+  #ifdef _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS
+  #error _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS has already been defined
+  #endif
+
+  #define _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS(A0,A13,A2) {\
+    Packet b = ei_pload(&rhs[j]); \
+    ptmp0 = ei_pmadd(b, EIGEN_CAT(ei_ploa,A0) (&lhs0[j]), ptmp0); \
+    ptmp1 = ei_pmadd(b, EIGEN_CAT(ei_ploa,A13)(&lhs1[j]), ptmp1); \
+    ptmp2 = ei_pmadd(b, EIGEN_CAT(ei_ploa,A2) (&lhs2[j]), ptmp2); \
+    ptmp3 = ei_pmadd(b, EIGEN_CAT(ei_ploa,A13)(&lhs3[j]), ptmp3); }
+
+  typedef typename ei_packet_traits<Scalar>::type Packet;
+  const int PacketSize = sizeof(Packet)/sizeof(Scalar);
+
+  enum { AllAligned=0, EvenAligned=1, FirstAligned=2, NoneAligned=3 };
+  const int rowsAtOnce = 4;
+  const int peels = 2;
+  const int PacketAlignedMask = PacketSize-1;
+  const int PeelAlignedMask = PacketSize*peels-1;
+  const int size = rhsSize;
+
+  // How many coeffs of the result do we have to skip to be aligned.
+  // Here we assume data are at least aligned on the base scalar type that is mandatory anyway.
+  const int alignedStart = ei_alignmentOffset(rhs, size);
+  const int alignedSize = PacketSize>1 ? alignedStart + ((size-alignedStart) & ~PacketAlignedMask) : 0;
+  const int peeledSize  = peels>1 ? alignedStart + ((alignedSize-alignedStart) & ~PeelAlignedMask) : alignedStart;
+
+  const int alignmentStep = PacketSize>1 ? (PacketSize - lhsStride % PacketSize) & PacketAlignedMask : 0;
+  int alignmentPattern = alignmentStep==0 ? AllAligned
+                       : alignmentStep==(PacketSize/2) ? EvenAligned
+                       : FirstAligned;
+
+  // we cannot assume the first element is aligned because of sub-matrices
+  const int lhsAlignmentOffset = ei_alignmentOffset(lhs,size);
+
+  // find how many rows do we have to skip to be aligned with rhs (if possible)
+  int skipRows = 0;
+  if (PacketSize>1)
+  {
+    ei_internal_assert(size_t(lhs+lhsAlignmentOffset)%sizeof(Packet)==0  || size<PacketSize);
+
+    while (skipRows<PacketSize &&
+           alignedStart != ((lhsAlignmentOffset + alignmentStep*skipRows)%PacketSize))
+      ++skipRows;
+    if (skipRows==PacketSize)
+    {
+      // nothing can be aligned, no need to skip any column
+      alignmentPattern = NoneAligned;
+      skipRows = 0;
+    }
+    else
+    {
+      skipRows = std::min(skipRows,res.size());
+      // note that the skiped columns are processed later.
+    }
+    ei_internal_assert((alignmentPattern==NoneAligned) || PacketSize==1
+      || (size_t(lhs+alignedStart+lhsStride*skipRows)%sizeof(Packet))==0);
+  }
+
+  int offset1 = (FirstAligned && alignmentStep==1?3:1);
+  int offset3 = (FirstAligned && alignmentStep==1?1:3);
+
+  int rowBound = ((res.size()-skipRows)/rowsAtOnce)*rowsAtOnce + skipRows;
+  for (int i=skipRows; i<rowBound; i+=rowsAtOnce)
+  {
+    Scalar tmp0 = Scalar(0), tmp1 = Scalar(0), tmp2 = Scalar(0), tmp3 = Scalar(0);
+
+    // this helps the compiler generating good binary code
+    const Scalar *lhs0 = lhs + i*lhsStride,     *lhs1 = lhs + (i+offset1)*lhsStride,
+                 *lhs2 = lhs + (i+2)*lhsStride, *lhs3 = lhs + (i+offset3)*lhsStride;
+
+    if (PacketSize>1)
+    {
+      /* explicit vectorization */
+      Packet ptmp0 = ei_pset1(Scalar(0)), ptmp1 = ei_pset1(Scalar(0)), ptmp2 = ei_pset1(Scalar(0)), ptmp3 = ei_pset1(Scalar(0));
+
+      // process initial unaligned coeffs
+      // FIXME this loop get vectorized by the compiler !
+      for (int j=0; j<alignedStart; ++j)
+      {
+        Scalar b = rhs[j];
+        tmp0 += b*lhs0[j]; tmp1 += b*lhs1[j]; tmp2 += b*lhs2[j]; tmp3 += b*lhs3[j];
+      }
+
+      if (alignedSize>alignedStart)
+      {
+        switch(alignmentPattern)
+        {
+          case AllAligned:
+            for (int j = alignedStart; j<alignedSize; j+=PacketSize)
+              _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS(d,d,d);
+            break;
+          case EvenAligned:
+            for (int j = alignedStart; j<alignedSize; j+=PacketSize)
+              _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS(d,du,d);
+            break;
+          case FirstAligned:
+            if (peels>1)
+            {
+              /* Here we proccess 4 rows with with two peeled iterations to hide
+               * tghe overhead of unaligned loads. Moreover unaligned loads are handled
+               * using special shift/move operations between the two aligned packets
+               * overlaping the desired unaligned packet. This is *much* more efficient
+               * than basic unaligned loads.
+               */
+              Packet A01, A02, A03, b, A11, A12, A13;
+              A01 = ei_pload(&lhs1[alignedStart-1]);
+              A02 = ei_pload(&lhs2[alignedStart-2]);
+              A03 = ei_pload(&lhs3[alignedStart-3]);
+
+              for (int j = alignedStart; j<peeledSize; j+=peels*PacketSize)
+              {
+                b = ei_pload(&rhs[j]);
+                A11 = ei_pload(&lhs1[j-1+PacketSize]);  ei_palign<1>(A01,A11);
+                A12 = ei_pload(&lhs2[j-2+PacketSize]);  ei_palign<2>(A02,A12);
+                A13 = ei_pload(&lhs3[j-3+PacketSize]);  ei_palign<3>(A03,A13);
+
+                ptmp0 = ei_pmadd(b, ei_pload (&lhs0[j]), ptmp0);
+                ptmp1 = ei_pmadd(b, A01, ptmp1);
+                A01 = ei_pload(&lhs1[j-1+2*PacketSize]);  ei_palign<1>(A11,A01);
+                ptmp2 = ei_pmadd(b, A02, ptmp2);
+                A02 = ei_pload(&lhs2[j-2+2*PacketSize]);  ei_palign<2>(A12,A02);
+                ptmp3 = ei_pmadd(b, A03, ptmp3);
+                A03 = ei_pload(&lhs3[j-3+2*PacketSize]);  ei_palign<3>(A13,A03);
+
+                b = ei_pload(&rhs[j+PacketSize]);
+                ptmp0 = ei_pmadd(b, ei_pload (&lhs0[j+PacketSize]), ptmp0);
+                ptmp1 = ei_pmadd(b, A11, ptmp1);
+                ptmp2 = ei_pmadd(b, A12, ptmp2);
+                ptmp3 = ei_pmadd(b, A13, ptmp3);
+              }
+            }
+            for (int j = peeledSize; j<alignedSize; j+=PacketSize)
+              _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS(d,du,du);
+            break;
+          default:
+            for (int j = alignedStart; j<alignedSize; j+=PacketSize)
+              _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS(du,du,du);
+            break;
+        }
+        tmp0 += ei_predux(ptmp0);
+        tmp1 += ei_predux(ptmp1);
+        tmp2 += ei_predux(ptmp2);
+        tmp3 += ei_predux(ptmp3);
+      }
+    } // end explicit vectorization
+
+    // process remaining coeffs (or all if no explicit vectorization)
+    // FIXME this loop get vectorized by the compiler !
+    for (int j=alignedSize; j<size; ++j)
+    {
+      Scalar b = rhs[j];
+      tmp0 += b*lhs0[j]; tmp1 += b*lhs1[j]; tmp2 += b*lhs2[j]; tmp3 += b*lhs3[j];
+    }
+    res[i] += tmp0; res[i+offset1] += tmp1; res[i+2] += tmp2; res[i+offset3] += tmp3;
+  }
+
+  // process remaining first and last rows (at most columnsAtOnce-1)
+  int end = res.size();
+  int start = rowBound;
+  do
+  {
+    for (int i=start; i<end; ++i)
+    {
+      Scalar tmp0 = Scalar(0);
+      Packet ptmp0 = ei_pset1(tmp0);
+      const Scalar* lhs0 = lhs + i*lhsStride;
+      // process first unaligned result's coeffs
+      // FIXME this loop get vectorized by the compiler !
+      for (int j=0; j<alignedStart; ++j)
+        tmp0 += rhs[j] * lhs0[j];
+
+      if (alignedSize>alignedStart)
+      {
+        // process aligned rhs coeffs
+        if ((size_t(lhs0+alignedStart)%sizeof(Packet))==0)
+          for (int j = alignedStart;j<alignedSize;j+=PacketSize)
+            ptmp0 = ei_pmadd(ei_pload(&rhs[j]), ei_pload(&lhs0[j]), ptmp0);
+        else
+          for (int j = alignedStart;j<alignedSize;j+=PacketSize)
+            ptmp0 = ei_pmadd(ei_pload(&rhs[j]), ei_ploadu(&lhs0[j]), ptmp0);
+        tmp0 += ei_predux(ptmp0);
+      }
+
+      // process remaining scalars
+      // FIXME this loop get vectorized by the compiler !
+      for (int j=alignedSize; j<size; ++j)
+        tmp0 += rhs[j] * lhs0[j];
+      res[i] += tmp0;
+    }
+    if (skipRows)
+    {
+      start = 0;
+      end = skipRows;
+      skipRows = 0;
+    }
+    else
+      break;
+  } while(PacketSize>1);
+
+  #undef _EIGEN_ACCUMULATE_PACKETS
+}
+
+#endif // EIGEN_CACHE_FRIENDLY_PRODUCT_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Coeffs.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Coeffs.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..23a8422
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,384 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_COEFFS_H
+#define EIGEN_COEFFS_H
+
+/** Short version: don't use this function, use
+  * \link operator()(int,int) const \endlink instead.
+  *
+  * Long version: this function is similar to
+  * \link operator()(int,int) const \endlink, but without the assertion.
+  * Use this for limiting the performance cost of debugging code when doing
+  * repeated coefficient access. Only use this when it is guaranteed that the
+  * parameters \a row and \a col are in range.
+  *
+  * If EIGEN_INTERNAL_DEBUGGING is defined, an assertion will be made, making this
+  * function equivalent to \link operator()(int,int) const \endlink.
+  *
+  * \sa operator()(int,int) const, coeffRef(int,int), coeff(int) const
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename ei_traits<Derived>::Scalar MatrixBase<Derived>
+  ::coeff(int row, int col) const
+{
+  ei_internal_assert(row >= 0 && row < rows()
+                     && col >= 0 && col < cols());
+  return derived().coeff(row, col);
+}
+
+/** \returns the coefficient at given the given row and column.
+  *
+  * \sa operator()(int,int), operator[](int) const
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename ei_traits<Derived>::Scalar MatrixBase<Derived>
+  ::operator()(int row, int col) const
+{
+  ei_assert(row >= 0 && row < rows()
+      && col >= 0 && col < cols());
+  return derived().coeff(row, col);
+}
+
+/** Short version: don't use this function, use
+  * \link operator()(int,int) \endlink instead.
+  *
+  * Long version: this function is similar to
+  * \link operator()(int,int) \endlink, but without the assertion.
+  * Use this for limiting the performance cost of debugging code when doing
+  * repeated coefficient access. Only use this when it is guaranteed that the
+  * parameters \a row and \a col are in range.
+  *
+  * If EIGEN_INTERNAL_DEBUGGING is defined, an assertion will be made, making this
+  * function equivalent to \link operator()(int,int) \endlink.
+  *
+  * \sa operator()(int,int), coeff(int, int) const, coeffRef(int)
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_traits<Derived>::Scalar& MatrixBase<Derived>
+  ::coeffRef(int row, int col)
+{
+  ei_internal_assert(row >= 0 && row < rows()
+                     && col >= 0 && col < cols());
+  return derived().coeffRef(row, col);
+}
+
+/** \returns a reference to the coefficient at given the given row and column.
+  *
+  * \sa operator()(int,int) const, operator[](int)
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_traits<Derived>::Scalar& MatrixBase<Derived>
+  ::operator()(int row, int col)
+{
+  ei_assert(row >= 0 && row < rows()
+      && col >= 0 && col < cols());
+  return derived().coeffRef(row, col);
+}
+
+/** Short version: don't use this function, use
+  * \link operator[](int) const \endlink instead.
+  *
+  * Long version: this function is similar to
+  * \link operator[](int) const \endlink, but without the assertion.
+  * Use this for limiting the performance cost of debugging code when doing
+  * repeated coefficient access. Only use this when it is guaranteed that the
+  * parameter \a index is in range.
+  *
+  * If EIGEN_INTERNAL_DEBUGGING is defined, an assertion will be made, making this
+  * function equivalent to \link operator[](int) const \endlink.
+  *
+  * \sa operator[](int) const, coeffRef(int), coeff(int,int) const
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename ei_traits<Derived>::Scalar MatrixBase<Derived>
+  ::coeff(int index) const
+{
+  ei_internal_assert(index >= 0 && index < size());
+  return derived().coeff(index);
+}
+
+/** \returns the coefficient at given index.
+  *
+  * This method is allowed only for vector expressions, and for matrix expressions having the LinearAccessBit.
+  *
+  * \sa operator[](int), operator()(int,int) const, x() const, y() const,
+  * z() const, w() const
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename ei_traits<Derived>::Scalar MatrixBase<Derived>
+  ::operator[](int index) const
+{
+  ei_assert(index >= 0 && index < size());
+  return derived().coeff(index);
+}
+
+/** \returns the coefficient at given index.
+  *
+  * This is synonymous to operator[](int) const.
+  *
+  * This method is allowed only for vector expressions, and for matrix expressions having the LinearAccessBit.
+  *
+  * \sa operator[](int), operator()(int,int) const, x() const, y() const,
+  * z() const, w() const
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename ei_traits<Derived>::Scalar MatrixBase<Derived>
+  ::operator()(int index) const
+{
+  ei_assert(index >= 0 && index < size());
+  return derived().coeff(index);
+}
+
+/** Short version: don't use this function, use
+  * \link operator[](int) \endlink instead.
+  *
+  * Long version: this function is similar to
+  * \link operator[](int) \endlink, but without the assertion.
+  * Use this for limiting the performance cost of debugging code when doing
+  * repeated coefficient access. Only use this when it is guaranteed that the
+  * parameters \a row and \a col are in range.
+  *
+  * If EIGEN_INTERNAL_DEBUGGING is defined, an assertion will be made, making this
+  * function equivalent to \link operator[](int) \endlink.
+  *
+  * \sa operator[](int), coeff(int) const, coeffRef(int,int)
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_traits<Derived>::Scalar& MatrixBase<Derived>
+  ::coeffRef(int index)
+{
+  ei_internal_assert(index >= 0 && index < size());
+  return derived().coeffRef(index);
+}
+
+/** \returns a reference to the coefficient at given index.
+  *
+  * This method is allowed only for vector expressions, and for matrix expressions having the LinearAccessBit.
+  *
+  * \sa operator[](int) const, operator()(int,int), x(), y(), z(), w()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_traits<Derived>::Scalar& MatrixBase<Derived>
+  ::operator[](int index)
+{
+  ei_assert(index >= 0 && index < size());
+  return derived().coeffRef(index);
+}
+
+/** \returns a reference to the coefficient at given index.
+  *
+  * This is synonymous to operator[](int).
+  *
+  * This method is allowed only for vector expressions, and for matrix expressions having the LinearAccessBit.
+  *
+  * \sa operator[](int) const, operator()(int,int), x(), y(), z(), w()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_traits<Derived>::Scalar& MatrixBase<Derived>
+  ::operator()(int index)
+{
+  ei_assert(index >= 0 && index < size());
+  return derived().coeffRef(index);
+}
+
+/** equivalent to operator[](0).  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename ei_traits<Derived>::Scalar MatrixBase<Derived>
+  ::x() const { return (*this)[0]; }
+
+/** equivalent to operator[](1).  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename ei_traits<Derived>::Scalar MatrixBase<Derived>
+  ::y() const { return (*this)[1]; }
+
+/** equivalent to operator[](2).  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename ei_traits<Derived>::Scalar MatrixBase<Derived>
+  ::z() const { return (*this)[2]; }
+
+/** equivalent to operator[](3).  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename ei_traits<Derived>::Scalar MatrixBase<Derived>
+  ::w() const { return (*this)[3]; }
+
+/** equivalent to operator[](0).  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_traits<Derived>::Scalar& MatrixBase<Derived>
+  ::x() { return (*this)[0]; }
+
+/** equivalent to operator[](1).  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_traits<Derived>::Scalar& MatrixBase<Derived>
+  ::y() { return (*this)[1]; }
+
+/** equivalent to operator[](2).  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_traits<Derived>::Scalar& MatrixBase<Derived>
+  ::z() { return (*this)[2]; }
+
+/** equivalent to operator[](3).  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_traits<Derived>::Scalar& MatrixBase<Derived>
+  ::w() { return (*this)[3]; }
+
+/** \returns the packet of coefficients starting at the given row and column. It is your responsibility
+  * to ensure that a packet really starts there. This method is only available on expressions having the
+  * PacketAccessBit.
+  *
+  * The \a LoadMode parameter may have the value \a Aligned or \a Unaligned. Its effect is to select
+  * the appropriate vectorization instruction. Aligned access is faster, but is only possible for packets
+  * starting at an address which is a multiple of the packet size.
+  */
+template<typename Derived>
+template<int LoadMode>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_packet_traits<typename ei_traits<Derived>::Scalar>::type
+MatrixBase<Derived>::packet(int row, int col) const
+{
+  ei_internal_assert(row >= 0 && row < rows()
+                     && col >= 0 && col < cols());
+  return derived().template packet<LoadMode>(row,col);
+}
+
+/** Stores the given packet of coefficients, at the given row and column of this expression. It is your responsibility
+  * to ensure that a packet really starts there. This method is only available on expressions having the
+  * PacketAccessBit.
+  *
+  * The \a LoadMode parameter may have the value \a Aligned or \a Unaligned. Its effect is to select
+  * the appropriate vectorization instruction. Aligned access is faster, but is only possible for packets
+  * starting at an address which is a multiple of the packet size.
+  */
+template<typename Derived>
+template<int StoreMode>
+EIGEN_STRONG_INLINE void MatrixBase<Derived>::writePacket
+(int row, int col, const typename ei_packet_traits<typename ei_traits<Derived>::Scalar>::type& x)
+{
+  ei_internal_assert(row >= 0 && row < rows()
+                     && col >= 0 && col < cols());
+  derived().template writePacket<StoreMode>(row,col,x);
+}
+
+/** \returns the packet of coefficients starting at the given index. It is your responsibility
+  * to ensure that a packet really starts there. This method is only available on expressions having the
+  * PacketAccessBit and the LinearAccessBit.
+  *
+  * The \a LoadMode parameter may have the value \a Aligned or \a Unaligned. Its effect is to select
+  * the appropriate vectorization instruction. Aligned access is faster, but is only possible for packets
+  * starting at an address which is a multiple of the packet size.
+  */
+template<typename Derived>
+template<int LoadMode>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename ei_packet_traits<typename ei_traits<Derived>::Scalar>::type
+MatrixBase<Derived>::packet(int index) const
+{
+  ei_internal_assert(index >= 0 && index < size());
+  return derived().template packet<LoadMode>(index);
+}
+
+/** Stores the given packet of coefficients, at the given index in this expression. It is your responsibility
+  * to ensure that a packet really starts there. This method is only available on expressions having the
+  * PacketAccessBit and the LinearAccessBit.
+  *
+  * The \a LoadMode parameter may have the value \a Aligned or \a Unaligned. Its effect is to select
+  * the appropriate vectorization instruction. Aligned access is faster, but is only possible for packets
+  * starting at an address which is a multiple of the packet size.
+  */
+template<typename Derived>
+template<int StoreMode>
+EIGEN_STRONG_INLINE void MatrixBase<Derived>::writePacket
+(int index, const typename ei_packet_traits<typename ei_traits<Derived>::Scalar>::type& x)
+{
+  ei_internal_assert(index >= 0 && index < size());
+  derived().template writePacket<StoreMode>(index,x);
+}
+
+#ifndef EIGEN_PARSED_BY_DOXYGEN
+
+/** \internal Copies the coefficient at position (row,col) of other into *this.
+  *
+  * This method is overridden in SwapWrapper, allowing swap() assignments to share 99% of their code
+  * with usual assignments.
+  *
+  * Outside of this internal usage, this method has probably no usefulness. It is hidden in the public API dox.
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE void MatrixBase<Derived>::copyCoeff(int row, int col, const MatrixBase<OtherDerived>& other)
+{
+  ei_internal_assert(row >= 0 && row < rows()
+                     && col >= 0 && col < cols());
+  derived().coeffRef(row, col) = other.derived().coeff(row, col);
+}
+
+/** \internal Copies the coefficient at the given index of other into *this.
+  *
+  * This method is overridden in SwapWrapper, allowing swap() assignments to share 99% of their code
+  * with usual assignments.
+  *
+  * Outside of this internal usage, this method has probably no usefulness. It is hidden in the public API dox.
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE void MatrixBase<Derived>::copyCoeff(int index, const MatrixBase<OtherDerived>& other)
+{
+  ei_internal_assert(index >= 0 && index < size());
+  derived().coeffRef(index) = other.derived().coeff(index);
+}
+
+/** \internal Copies the packet at position (row,col) of other into *this.
+  *
+  * This method is overridden in SwapWrapper, allowing swap() assignments to share 99% of their code
+  * with usual assignments.
+  *
+  * Outside of this internal usage, this method has probably no usefulness. It is hidden in the public API dox.
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived, int StoreMode, int LoadMode>
+EIGEN_STRONG_INLINE void MatrixBase<Derived>::copyPacket(int row, int col, const MatrixBase<OtherDerived>& other)
+{
+  ei_internal_assert(row >= 0 && row < rows()
+                     && col >= 0 && col < cols());
+  derived().template writePacket<StoreMode>(row, col,
+    other.derived().template packet<LoadMode>(row, col));
+}
+
+/** \internal Copies the packet at the given index of other into *this.
+  *
+  * This method is overridden in SwapWrapper, allowing swap() assignments to share 99% of their code
+  * with usual assignments.
+  *
+  * Outside of this internal usage, this method has probably no usefulness. It is hidden in the public API dox.
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived, int StoreMode, int LoadMode>
+EIGEN_STRONG_INLINE void MatrixBase<Derived>::copyPacket(int index, const MatrixBase<OtherDerived>& other)
+{
+  ei_internal_assert(index >= 0 && index < size());
+  derived().template writePacket<StoreMode>(index,
+    other.derived().template packet<LoadMode>(index));
+}
+
+#endif
+
+#endif // EIGEN_COEFFS_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CommaInitializer.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CommaInitializer.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..ed28e0c
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,149 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_COMMAINITIALIZER_H
+#define EIGEN_COMMAINITIALIZER_H
+
+/** \class CommaInitializer
+  *
+  * \brief Helper class used by the comma initializer operator
+  *
+  * This class is internally used to implement the comma initializer feature. It is
+  * the return type of MatrixBase::operator<<, and most of the time this is the only
+  * way it is used.
+  *
+  * \sa \ref MatrixBaseCommaInitRef "MatrixBase::operator<<", CommaInitializer::finished()
+  */
+template<typename MatrixType>
+struct CommaInitializer
+{
+  typedef typename ei_traits<MatrixType>::Scalar Scalar;
+  inline CommaInitializer(MatrixType& mat, const Scalar& s)
+    : m_matrix(mat), m_row(0), m_col(1), m_currentBlockRows(1)
+  {
+    m_matrix.coeffRef(0,0) = s;
+  }
+
+  template<typename OtherDerived>
+  inline CommaInitializer(MatrixType& mat, const MatrixBase<OtherDerived>& other)
+    : m_matrix(mat), m_row(0), m_col(other.cols()), m_currentBlockRows(other.rows())
+  {
+    m_matrix.block(0, 0, other.rows(), other.cols()) = other;
+  }
+
+  /* inserts a scalar value in the target matrix */
+  CommaInitializer& operator,(const Scalar& s)
+  {
+    if (m_col==m_matrix.cols())
+    {
+      m_row+=m_currentBlockRows;
+      m_col = 0;
+      m_currentBlockRows = 1;
+      ei_assert(m_row<m_matrix.rows()
+        && "Too many rows passed to comma initializer (operator<<)");
+    }
+    ei_assert(m_col<m_matrix.cols()
+      && "Too many coefficients passed to comma initializer (operator<<)");
+    ei_assert(m_currentBlockRows==1);
+    m_matrix.coeffRef(m_row, m_col++) = s;
+    return *this;
+  }
+
+  /* inserts a matrix expression in the target matrix */
+  template<typename OtherDerived>
+  CommaInitializer& operator,(const MatrixBase<OtherDerived>& other)
+  {
+    if (m_col==m_matrix.cols())
+    {
+      m_row+=m_currentBlockRows;
+      m_col = 0;
+      m_currentBlockRows = other.rows();
+      ei_assert(m_row+m_currentBlockRows<=m_matrix.rows()
+        && "Too many rows passed to comma initializer (operator<<)");
+    }
+    ei_assert(m_col<m_matrix.cols()
+      && "Too many coefficients passed to comma initializer (operator<<)");
+    ei_assert(m_currentBlockRows==other.rows());
+    if (OtherDerived::SizeAtCompileTime != Dynamic)
+      m_matrix.template block<OtherDerived::RowsAtCompileTime != Dynamic ? OtherDerived::RowsAtCompileTime : 1,
+                              OtherDerived::ColsAtCompileTime != Dynamic ? OtherDerived::ColsAtCompileTime : 1>
+                    (m_row, m_col) = other;
+    else
+      m_matrix.block(m_row, m_col, other.rows(), other.cols()) = other;
+    m_col += other.cols();
+    return *this;
+  }
+
+  inline ~CommaInitializer()
+  {
+    ei_assert((m_row+m_currentBlockRows) == m_matrix.rows()
+         && m_col == m_matrix.cols()
+         && "Too few coefficients passed to comma initializer (operator<<)");
+  }
+
+  /** \returns the built matrix once all its coefficients have been set.
+    * Calling finished is 100% optional. Its purpose is to write expressions
+    * like this:
+    * \code
+    * quaternion.fromRotationMatrix((Matrix3f() << axis0, axis1, axis2).finished());
+    * \endcode
+    */
+  inline MatrixType& finished() { return m_matrix; }
+
+  MatrixType& m_matrix;   // target matrix
+  int m_row;              // current row id
+  int m_col;              // current col id
+  int m_currentBlockRows; // current block height
+};
+
+/** \anchor MatrixBaseCommaInitRef
+  * Convenient operator to set the coefficients of a matrix.
+  *
+  * The coefficients must be provided in a row major order and exactly match
+  * the size of the matrix. Otherwise an assertion is raised.
+  *
+  * \addexample CommaInit \label How to easily set all the coefficients of a matrix
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_set.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_set.out
+  *
+  * \sa CommaInitializer::finished(), class CommaInitializer
+  */
+template<typename Derived>
+inline CommaInitializer<Derived> MatrixBase<Derived>::operator<< (const Scalar& s)
+{
+  return CommaInitializer<Derived>(*static_cast<Derived*>(this), s);
+}
+
+/** \sa operator<<(const Scalar&) */
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived>
+inline CommaInitializer<Derived>
+MatrixBase<Derived>::operator<<(const MatrixBase<OtherDerived>& other)
+{
+  return CommaInitializer<Derived>(*static_cast<Derived *>(this), other);
+}
+
+#endif // EIGEN_COMMAINITIALIZER_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CoreInstantiations.cpp b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CoreInstantiations.cpp
new file mode 100644 (file)
index 0000000..56a9448
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,47 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifdef EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS
+#undef EIGEN_EXTERN_INSTANTIATIONS
+#endif
+
+#include "../../Core"
+
+namespace Eigen
+{
+
+#define EIGEN_INSTANTIATE_PRODUCT(TYPE) \
+template static void ei_cache_friendly_product<TYPE>( \
+  int _rows, int _cols, int depth, \
+  bool _lhsRowMajor, const TYPE* _lhs, int _lhsStride, \
+  bool _rhsRowMajor, const TYPE* _rhs, int _rhsStride, \
+  bool resRowMajor, TYPE* res, int resStride)
+
+EIGEN_INSTANTIATE_PRODUCT(float);
+EIGEN_INSTANTIATE_PRODUCT(double);
+EIGEN_INSTANTIATE_PRODUCT(int);
+EIGEN_INSTANTIATE_PRODUCT(std::complex<float>);
+EIGEN_INSTANTIATE_PRODUCT(std::complex<double>);
+
+}
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Cwise.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Cwise.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..0e92dce
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,211 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+// Copyright (C) 2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_CWISE_H
+#define EIGEN_CWISE_H
+
+/** \internal
+  * convenient macro to defined the return type of a cwise binary operation */
+#define EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(OP) \
+    CwiseBinaryOp<OP<typename ei_traits<ExpressionType>::Scalar>, ExpressionType, OtherDerived>
+
+#define EIGEN_CWISE_PRODUCT_RETURN_TYPE \
+    CwiseBinaryOp< \
+      ei_scalar_product_op< \
+        typename ei_scalar_product_traits< \
+          typename ei_traits<ExpressionType>::Scalar, \
+          typename ei_traits<OtherDerived>::Scalar \
+        >::ReturnType \
+      >, \
+      ExpressionType, \
+      OtherDerived \
+    >
+
+/** \internal
+  * convenient macro to defined the return type of a cwise unary operation */
+#define EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(OP) \
+    CwiseUnaryOp<OP<typename ei_traits<ExpressionType>::Scalar>, ExpressionType>
+
+/** \internal
+  * convenient macro to defined the return type of a cwise comparison to a scalar */
+#define EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(OP) \
+    CwiseBinaryOp<OP<typename ei_traits<ExpressionType>::Scalar>, ExpressionType, \
+        NestByValue<typename ExpressionType::ConstantReturnType> >
+
+/** \class Cwise
+  *
+  * \brief Pseudo expression providing additional coefficient-wise operations
+  *
+  * \param ExpressionType the type of the object on which to do coefficient-wise operations
+  *
+  * This class represents an expression with additional coefficient-wise features.
+  * It is the return type of MatrixBase::cwise()
+  * and most of the time this is the only way it is used.
+  *
+  * Note that some methods are defined in the \ref Array module.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_cwise_const.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_cwise_const.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::cwise() const, MatrixBase::cwise()
+  */
+template<typename ExpressionType> class Cwise
+{
+  public:
+
+    typedef typename ei_traits<ExpressionType>::Scalar Scalar;
+    typedef typename ei_meta_if<ei_must_nest_by_value<ExpressionType>::ret,
+        ExpressionType, const ExpressionType&>::ret ExpressionTypeNested;
+    typedef CwiseUnaryOp<ei_scalar_add_op<Scalar>, ExpressionType> ScalarAddReturnType;
+
+    inline Cwise(const ExpressionType& matrix) : m_matrix(matrix) {}
+
+    /** \internal */
+    inline const ExpressionType& _expression() const { return m_matrix; }
+
+    template<typename OtherDerived>
+    const EIGEN_CWISE_PRODUCT_RETURN_TYPE
+    operator*(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const;
+
+    template<typename OtherDerived>
+    const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_quotient_op)
+    operator/(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const;
+
+    template<typename OtherDerived>
+    const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_min_op)
+    min(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const;
+
+    template<typename OtherDerived>
+    const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_max_op)
+    max(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const;
+
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_abs_op)      abs() const;
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_abs2_op)     abs2() const;
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_square_op)   square() const;
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_cube_op)     cube() const;
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_inverse_op)  inverse() const;
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_sqrt_op)     sqrt() const;
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_exp_op)      exp() const;
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_log_op)      log() const;
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_cos_op)      cos() const;
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_sin_op)      sin() const;
+    const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_pow_op)      pow(const Scalar& exponent) const;
+
+    const ScalarAddReturnType
+    operator+(const Scalar& scalar) const;
+
+    /** \relates Cwise */
+    friend const ScalarAddReturnType
+    operator+(const Scalar& scalar, const Cwise& mat)
+    { return mat + scalar; }
+
+    ExpressionType& operator+=(const Scalar& scalar);
+
+    const ScalarAddReturnType
+    operator-(const Scalar& scalar) const;
+
+    ExpressionType& operator-=(const Scalar& scalar);
+
+    template<typename OtherDerived>
+    inline ExpressionType& operator*=(const MatrixBase<OtherDerived> &other);
+
+    template<typename OtherDerived>
+    inline ExpressionType& operator/=(const MatrixBase<OtherDerived> &other);
+
+    template<typename OtherDerived> const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::less)
+    operator<(const MatrixBase<OtherDerived>& other) const;
+
+    template<typename OtherDerived> const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::less_equal)
+    operator<=(const MatrixBase<OtherDerived>& other) const;
+
+    template<typename OtherDerived> const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::greater)
+    operator>(const MatrixBase<OtherDerived>& other) const;
+
+    template<typename OtherDerived> const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::greater_equal)
+    operator>=(const MatrixBase<OtherDerived>& other) const;
+
+    template<typename OtherDerived> const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::equal_to)
+    operator==(const MatrixBase<OtherDerived>& other) const;
+
+    template<typename OtherDerived> const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(std::not_equal_to)
+    operator!=(const MatrixBase<OtherDerived>& other) const;
+
+    // comparisons to a scalar value
+    const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::less)
+    operator<(Scalar s) const;
+
+    const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::less_equal)
+    operator<=(Scalar s) const;
+
+    const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::greater)
+    operator>(Scalar s) const;
+
+    const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::greater_equal)
+    operator>=(Scalar s) const;
+
+    const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::equal_to)
+    operator==(Scalar s) const;
+
+    const EIGEN_CWISE_COMP_TO_SCALAR_RETURN_TYPE(std::not_equal_to)
+    operator!=(Scalar s) const;
+
+    // allow to extend Cwise outside Eigen
+    #ifdef EIGEN_CWISE_PLUGIN
+    #include EIGEN_CWISE_PLUGIN
+    #endif
+
+  protected:
+    ExpressionTypeNested m_matrix;
+};
+
+/** \returns a Cwise wrapper of *this providing additional coefficient-wise operations
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_cwise_const.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_cwise_const.out
+  *
+  * \sa class Cwise, cwise()
+  */
+template<typename Derived>
+inline const Cwise<Derived>
+MatrixBase<Derived>::cwise() const
+{
+  return derived();
+}
+
+/** \returns a Cwise wrapper of *this providing additional coefficient-wise operations
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_cwise.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_cwise.out
+  *
+  * \sa class Cwise, cwise() const
+  */
+template<typename Derived>
+inline Cwise<Derived>
+MatrixBase<Derived>::cwise()
+{
+  return derived();
+}
+
+#endif // EIGEN_CWISE_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CwiseBinaryOp.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CwiseBinaryOp.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..c4223e2
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,304 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_CWISE_BINARY_OP_H
+#define EIGEN_CWISE_BINARY_OP_H
+
+/** \class CwiseBinaryOp
+  *
+  * \brief Generic expression of a coefficient-wise operator between two matrices or vectors
+  *
+  * \param BinaryOp template functor implementing the operator
+  * \param Lhs the type of the left-hand side
+  * \param Rhs the type of the right-hand side
+  *
+  * This class represents an expression of a generic binary operator of two matrices or vectors.
+  * It is the return type of the operator+, operator-, and the Cwise methods, and most
+  * of the time this is the only way it is used.
+  *
+  * However, if you want to write a function returning such an expression, you
+  * will need to use this class.
+  *
+  * \sa MatrixBase::binaryExpr(const MatrixBase<OtherDerived> &,const CustomBinaryOp &) const, class CwiseUnaryOp, class CwiseNullaryOp
+  */
+template<typename BinaryOp, typename Lhs, typename Rhs>
+struct ei_traits<CwiseBinaryOp<BinaryOp, Lhs, Rhs> >
+{
+  // even though we require Lhs and Rhs to have the same scalar type (see CwiseBinaryOp constructor),
+  // we still want to handle the case when the result type is different.
+  typedef typename ei_result_of<
+                     BinaryOp(
+                       typename Lhs::Scalar,
+                       typename Rhs::Scalar
+                     )
+                   >::type Scalar;
+  typedef typename Lhs::Nested LhsNested;
+  typedef typename Rhs::Nested RhsNested;
+  typedef typename ei_unref<LhsNested>::type _LhsNested;
+  typedef typename ei_unref<RhsNested>::type _RhsNested;
+  enum {
+    LhsCoeffReadCost = _LhsNested::CoeffReadCost,
+    RhsCoeffReadCost = _RhsNested::CoeffReadCost,
+    LhsFlags = _LhsNested::Flags,
+    RhsFlags = _RhsNested::Flags,
+    RowsAtCompileTime = Lhs::RowsAtCompileTime,
+    ColsAtCompileTime = Lhs::ColsAtCompileTime,
+    MaxRowsAtCompileTime = Lhs::MaxRowsAtCompileTime,
+    MaxColsAtCompileTime = Lhs::MaxColsAtCompileTime,
+    Flags = (int(LhsFlags) | int(RhsFlags)) & (
+        HereditaryBits
+      | (int(LhsFlags) & int(RhsFlags) & (LinearAccessBit | AlignedBit))
+      | (ei_functor_traits<BinaryOp>::PacketAccess && ((int(LhsFlags) & RowMajorBit)==(int(RhsFlags) & RowMajorBit))
+        ? (int(LhsFlags) & int(RhsFlags) & PacketAccessBit) : 0)),
+    CoeffReadCost = LhsCoeffReadCost + RhsCoeffReadCost + ei_functor_traits<BinaryOp>::Cost
+  };
+};
+
+template<typename BinaryOp, typename Lhs, typename Rhs>
+class CwiseBinaryOp : ei_no_assignment_operator,
+  public MatrixBase<CwiseBinaryOp<BinaryOp, Lhs, Rhs> >
+{
+  public:
+
+    EIGEN_GENERIC_PUBLIC_INTERFACE(CwiseBinaryOp)
+    typedef typename ei_traits<CwiseBinaryOp>::LhsNested LhsNested;
+    typedef typename ei_traits<CwiseBinaryOp>::RhsNested RhsNested;
+
+    EIGEN_STRONG_INLINE CwiseBinaryOp(const Lhs& lhs, const Rhs& rhs, const BinaryOp& func = BinaryOp())
+      : m_lhs(lhs), m_rhs(rhs), m_functor(func)
+    {
+      // we require Lhs and Rhs to have the same scalar type. Currently there is no example of a binary functor
+      // that would take two operands of different types. If there were such an example, then this check should be
+      // moved to the BinaryOp functors, on a per-case basis. This would however require a change in the BinaryOp functors, as
+      // currently they take only one typename Scalar template parameter.
+      // It is tempting to always allow mixing different types but remember that this is often impossible in the vectorized paths.
+      // So allowing mixing different types gives very unexpected errors when enabling vectorization, when the user tries to
+      // add together a float matrix and a double matrix.
+      EIGEN_STATIC_ASSERT((ei_functor_allows_mixing_real_and_complex<BinaryOp>::ret
+                           ? int(ei_is_same_type<typename Lhs::RealScalar, typename Rhs::RealScalar>::ret)
+                           : int(ei_is_same_type<typename Lhs::Scalar, typename Rhs::Scalar>::ret)),
+        YOU_MIXED_DIFFERENT_NUMERIC_TYPES__YOU_NEED_TO_USE_THE_CAST_METHOD_OF_MATRIXBASE_TO_CAST_NUMERIC_TYPES_EXPLICITLY)
+      // require the sizes to match
+      EIGEN_STATIC_ASSERT_SAME_MATRIX_SIZE(Lhs, Rhs)
+      ei_assert(lhs.rows() == rhs.rows() && lhs.cols() == rhs.cols());
+    }
+
+    EIGEN_STRONG_INLINE int rows() const { return m_lhs.rows(); }
+    EIGEN_STRONG_INLINE int cols() const { return m_lhs.cols(); }
+
+    EIGEN_STRONG_INLINE const Scalar coeff(int row, int col) const
+    {
+      return m_functor(m_lhs.coeff(row, col), m_rhs.coeff(row, col));
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    EIGEN_STRONG_INLINE PacketScalar packet(int row, int col) const
+    {
+      return m_functor.packetOp(m_lhs.template packet<LoadMode>(row, col), m_rhs.template packet<LoadMode>(row, col));
+    }
+
+    EIGEN_STRONG_INLINE const Scalar coeff(int index) const
+    {
+      return m_functor(m_lhs.coeff(index), m_rhs.coeff(index));
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    EIGEN_STRONG_INLINE PacketScalar packet(int index) const
+    {
+      return m_functor.packetOp(m_lhs.template packet<LoadMode>(index), m_rhs.template packet<LoadMode>(index));
+    }
+
+  protected:
+    const LhsNested m_lhs;
+    const RhsNested m_rhs;
+    const BinaryOp m_functor;
+};
+
+/**\returns an expression of the difference of \c *this and \a other
+  *
+  * \note If you want to substract a given scalar from all coefficients, see Cwise::operator-().
+  *
+  * \sa class CwiseBinaryOp, MatrixBase::operator-=(), Cwise::operator-()
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const CwiseBinaryOp<ei_scalar_difference_op<typename ei_traits<Derived>::Scalar>,
+                                 Derived, OtherDerived>
+MatrixBase<Derived>::operator-(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return CwiseBinaryOp<ei_scalar_difference_op<Scalar>,
+                       Derived, OtherDerived>(derived(), other.derived());
+}
+
+/** replaces \c *this by \c *this - \a other.
+  *
+  * \returns a reference to \c *this
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE Derived &
+MatrixBase<Derived>::operator-=(const MatrixBase<OtherDerived> &other)
+{
+  return *this = *this - other;
+}
+
+/** \relates MatrixBase
+  *
+  * \returns an expression of the sum of \c *this and \a other
+  *
+  * \note If you want to add a given scalar to all coefficients, see Cwise::operator+().
+  *
+  * \sa class CwiseBinaryOp, MatrixBase::operator+=(), Cwise::operator+()
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const CwiseBinaryOp<ei_scalar_sum_op<typename ei_traits<Derived>::Scalar>, Derived, OtherDerived>
+MatrixBase<Derived>::operator+(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return CwiseBinaryOp<ei_scalar_sum_op<Scalar>, Derived, OtherDerived>(derived(), other.derived());
+}
+
+/** replaces \c *this by \c *this + \a other.
+  *
+  * \returns a reference to \c *this
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE Derived &
+MatrixBase<Derived>::operator+=(const MatrixBase<OtherDerived>& other)
+{
+  return *this = *this + other;
+}
+
+/** \returns an expression of the Schur product (coefficient wise product) of *this and \a other
+  *
+  * Example: \include Cwise_product.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_product.out
+  *
+  * \sa class CwiseBinaryOp, operator/(), square()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const EIGEN_CWISE_PRODUCT_RETURN_TYPE
+Cwise<ExpressionType>::operator*(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_PRODUCT_RETURN_TYPE(_expression(), other.derived());
+}
+
+/** \returns an expression of the coefficient-wise quotient of *this and \a other
+  *
+  * Example: \include Cwise_quotient.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_quotient.out
+  *
+  * \sa class CwiseBinaryOp, operator*(), inverse()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_quotient_op)
+Cwise<ExpressionType>::operator/(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_quotient_op)(_expression(), other.derived());
+}
+
+/** Replaces this expression by its coefficient-wise product with \a other.
+  *
+  * Example: \include Cwise_times_equal.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_times_equal.out
+  *
+  * \sa operator*(), operator/=()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+inline ExpressionType& Cwise<ExpressionType>::operator*=(const MatrixBase<OtherDerived> &other)
+{
+  return m_matrix.const_cast_derived() = *this * other;
+}
+
+/** Replaces this expression by its coefficient-wise quotient by \a other.
+  *
+  * Example: \include Cwise_slash_equal.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_slash_equal.out
+  *
+  * \sa operator/(), operator*=()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+inline ExpressionType& Cwise<ExpressionType>::operator/=(const MatrixBase<OtherDerived> &other)
+{
+  return m_matrix.const_cast_derived() = *this / other;
+}
+
+/** \returns an expression of the coefficient-wise min of *this and \a other
+  *
+  * Example: \include Cwise_min.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_min.out
+  *
+  * \sa class CwiseBinaryOp
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_min_op)
+Cwise<ExpressionType>::min(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_min_op)(_expression(), other.derived());
+}
+
+/** \returns an expression of the coefficient-wise max of *this and \a other
+  *
+  * Example: \include Cwise_max.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_max.out
+  *
+  * \sa class CwiseBinaryOp
+  */
+template<typename ExpressionType>
+template<typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_max_op)
+Cwise<ExpressionType>::max(const MatrixBase<OtherDerived> &other) const
+{
+  return EIGEN_CWISE_BINOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_max_op)(_expression(), other.derived());
+}
+
+/** \returns an expression of a custom coefficient-wise operator \a func of *this and \a other
+  *
+  * The template parameter \a CustomBinaryOp is the type of the functor
+  * of the custom operator (see class CwiseBinaryOp for an example)
+  *
+  * \addexample CustomCwiseBinaryFunctors \label How to use custom coeff wise binary functors
+  *
+  * Here is an example illustrating the use of custom functors:
+  * \include class_CwiseBinaryOp.cpp
+  * Output: \verbinclude class_CwiseBinaryOp.out
+  *
+  * \sa class CwiseBinaryOp, MatrixBase::operator+, MatrixBase::operator-, Cwise::operator*, Cwise::operator/
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename CustomBinaryOp, typename OtherDerived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const CwiseBinaryOp<CustomBinaryOp, Derived, OtherDerived>
+MatrixBase<Derived>::binaryExpr(const MatrixBase<OtherDerived> &other, const CustomBinaryOp& func) const
+{
+  return CwiseBinaryOp<CustomBinaryOp, Derived, OtherDerived>(derived(), other.derived(), func);
+}
+
+#endif // EIGEN_CWISE_BINARY_OP_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CwiseNullaryOp.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CwiseNullaryOp.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..4ee5b58
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,763 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_CWISE_NULLARY_OP_H
+#define EIGEN_CWISE_NULLARY_OP_H
+
+/** \class CwiseNullaryOp
+  *
+  * \brief Generic expression of a matrix where all coefficients are defined by a functor
+  *
+  * \param NullaryOp template functor implementing the operator
+  *
+  * This class represents an expression of a generic nullary operator.
+  * It is the return type of the Ones(), Zero(), Constant(), Identity() and Random() functions,
+  * and most of the time this is the only way it is used.
+  *
+  * However, if you want to write a function returning such an expression, you
+  * will need to use this class.
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, class CwiseBinaryOp, MatrixBase::NullaryExpr()
+  */
+template<typename NullaryOp, typename MatrixType>
+struct ei_traits<CwiseNullaryOp<NullaryOp, MatrixType> > : ei_traits<MatrixType>
+{
+  enum {
+    Flags = (ei_traits<MatrixType>::Flags
+      & (  HereditaryBits
+         | (ei_functor_has_linear_access<NullaryOp>::ret ? LinearAccessBit : 0)
+         | (ei_functor_traits<NullaryOp>::PacketAccess ? PacketAccessBit : 0)))
+      | (ei_functor_traits<NullaryOp>::IsRepeatable ? 0 : EvalBeforeNestingBit),
+    CoeffReadCost = ei_functor_traits<NullaryOp>::Cost
+  };
+};
+
+template<typename NullaryOp, typename MatrixType>
+class CwiseNullaryOp : ei_no_assignment_operator,
+  public MatrixBase<CwiseNullaryOp<NullaryOp, MatrixType> >
+{
+  public:
+
+    EIGEN_GENERIC_PUBLIC_INTERFACE(CwiseNullaryOp)
+
+    CwiseNullaryOp(int rows, int cols, const NullaryOp& func = NullaryOp())
+      : m_rows(rows), m_cols(cols), m_functor(func)
+    {
+      ei_assert(rows > 0
+          && (RowsAtCompileTime == Dynamic || RowsAtCompileTime == rows)
+          && cols > 0
+          && (ColsAtCompileTime == Dynamic || ColsAtCompileTime == cols));
+    }
+
+    EIGEN_STRONG_INLINE int rows() const { return m_rows.value(); }
+    EIGEN_STRONG_INLINE int cols() const { return m_cols.value(); }
+
+    EIGEN_STRONG_INLINE const Scalar coeff(int rows, int cols) const
+    {
+      return m_functor(rows, cols);
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    EIGEN_STRONG_INLINE PacketScalar packet(int, int) const
+    {
+      return m_functor.packetOp();
+    }
+
+    EIGEN_STRONG_INLINE const Scalar coeff(int index) const
+    {
+      if(RowsAtCompileTime == 1)
+        return m_functor(0, index);
+      else
+        return m_functor(index, 0);
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    EIGEN_STRONG_INLINE PacketScalar packet(int) const
+    {
+      return m_functor.packetOp();
+    }
+
+  protected:
+    const ei_int_if_dynamic<RowsAtCompileTime> m_rows;
+    const ei_int_if_dynamic<ColsAtCompileTime> m_cols;
+    const NullaryOp m_functor;
+};
+
+
+/** \returns an expression of a matrix defined by a custom functor \a func
+  *
+  * The parameters \a rows and \a cols are the number of rows and of columns of
+  * the returned matrix. Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size matrix types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a rows and \a cols as arguments, so Zero() should be used
+  * instead.
+  *
+  * The template parameter \a CustomNullaryOp is the type of the functor.
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename CustomNullaryOp>
+EIGEN_STRONG_INLINE const CwiseNullaryOp<CustomNullaryOp, Derived>
+MatrixBase<Derived>::NullaryExpr(int rows, int cols, const CustomNullaryOp& func)
+{
+  return CwiseNullaryOp<CustomNullaryOp, Derived>(rows, cols, func);
+}
+
+/** \returns an expression of a matrix defined by a custom functor \a func
+  *
+  * The parameter \a size is the size of the returned vector.
+  * Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size vector types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a size as argument, so Zero() should be used
+  * instead.
+  *
+  * The template parameter \a CustomNullaryOp is the type of the functor.
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename CustomNullaryOp>
+EIGEN_STRONG_INLINE const CwiseNullaryOp<CustomNullaryOp, Derived>
+MatrixBase<Derived>::NullaryExpr(int size, const CustomNullaryOp& func)
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  ei_assert(IsVectorAtCompileTime);
+  if(RowsAtCompileTime == 1) return CwiseNullaryOp<CustomNullaryOp, Derived>(1, size, func);
+  else return CwiseNullaryOp<CustomNullaryOp, Derived>(size, 1, func);
+}
+
+/** \returns an expression of a matrix defined by a custom functor \a func
+  *
+  * This variant is only for fixed-size MatrixBase types. For dynamic-size types, you
+  * need to use the variants taking size arguments.
+  *
+  * The template parameter \a CustomNullaryOp is the type of the functor.
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename CustomNullaryOp>
+EIGEN_STRONG_INLINE const CwiseNullaryOp<CustomNullaryOp, Derived>
+MatrixBase<Derived>::NullaryExpr(const CustomNullaryOp& func)
+{
+  return CwiseNullaryOp<CustomNullaryOp, Derived>(RowsAtCompileTime, ColsAtCompileTime, func);
+}
+
+/** \returns an expression of a constant matrix of value \a value
+  *
+  * The parameters \a rows and \a cols are the number of rows and of columns of
+  * the returned matrix. Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size matrix types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a rows and \a cols as arguments, so Zero() should be used
+  * instead.
+  *
+  * The template parameter \a CustomNullaryOp is the type of the functor.
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ConstantReturnType
+MatrixBase<Derived>::Constant(int rows, int cols, const Scalar& value)
+{
+  return NullaryExpr(rows, cols, ei_scalar_constant_op<Scalar>(value));
+}
+
+/** \returns an expression of a constant matrix of value \a value
+  *
+  * The parameter \a size is the size of the returned vector.
+  * Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size vector types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a size as argument, so Zero() should be used
+  * instead.
+  *
+  * The template parameter \a CustomNullaryOp is the type of the functor.
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ConstantReturnType
+MatrixBase<Derived>::Constant(int size, const Scalar& value)
+{
+  return NullaryExpr(size, ei_scalar_constant_op<Scalar>(value));
+}
+
+/** \returns an expression of a constant matrix of value \a value
+  *
+  * This variant is only for fixed-size MatrixBase types. For dynamic-size types, you
+  * need to use the variants taking size arguments.
+  *
+  * The template parameter \a CustomNullaryOp is the type of the functor.
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ConstantReturnType
+MatrixBase<Derived>::Constant(const Scalar& value)
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_FIXED_SIZE(Derived)
+  return NullaryExpr(RowsAtCompileTime, ColsAtCompileTime, ei_scalar_constant_op<Scalar>(value));
+}
+
+/** \returns true if all coefficients in this matrix are approximately equal to \a value, to within precision \a prec */
+template<typename Derived>
+bool MatrixBase<Derived>::isApproxToConstant
+(const Scalar& value, RealScalar prec) const
+{
+  for(int j = 0; j < cols(); ++j)
+    for(int i = 0; i < rows(); ++i)
+      if(!ei_isApprox(coeff(i, j), value, prec))
+        return false;
+  return true;
+}
+
+/** This is just an alias for isApproxToConstant().
+  *
+  * \returns true if all coefficients in this matrix are approximately equal to \a value, to within precision \a prec */
+template<typename Derived>
+bool MatrixBase<Derived>::isConstant
+(const Scalar& value, RealScalar prec) const
+{
+  return isApproxToConstant(value, prec);
+}
+
+/** Alias for setConstant(): sets all coefficients in this expression to \a value.
+  *
+  * \sa setConstant(), Constant(), class CwiseNullaryOp
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE void MatrixBase<Derived>::fill(const Scalar& value)
+{
+  setConstant(value);
+}
+
+/** Sets all coefficients in this expression to \a value.
+  *
+  * \sa fill(), setConstant(int,const Scalar&), setConstant(int,int,const Scalar&), setZero(), setOnes(), Constant(), class CwiseNullaryOp, setZero(), setOnes()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE Derived& MatrixBase<Derived>::setConstant(const Scalar& value)
+{
+  return derived() = Constant(rows(), cols(), value);
+}
+
+/** Resizes to the given \a size, and sets all coefficients in this expression to the given \a value.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * Example: \include Matrix_set_int.cpp
+  * Output: \verbinclude Matrix_setConstant_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setConstant(const Scalar&), setConstant(int,int,const Scalar&), class CwiseNullaryOp, MatrixBase::Constant(const Scalar&)
+  */
+template<typename _Scalar, int _Rows, int _Cols, int _Options, int _MaxRows, int _MaxCols>
+EIGEN_STRONG_INLINE Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>&
+Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>::setConstant(int size, const Scalar& value)
+{
+  resize(size);
+  return setConstant(value);
+}
+
+/** Resizes to the given size, and sets all coefficients in this expression to the given \a value.
+  *
+  * \param rows the new number of rows
+  * \param cols the new number of columns
+  *
+  * Example: \include Matrix_setConstant_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude Matrix_setConstant_int_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setConstant(const Scalar&), setConstant(int,const Scalar&), class CwiseNullaryOp, MatrixBase::Constant(const Scalar&)
+  */
+template<typename _Scalar, int _Rows, int _Cols, int _Options, int _MaxRows, int _MaxCols>
+EIGEN_STRONG_INLINE Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>&
+Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>::setConstant(int rows, int cols, const Scalar& value)
+{
+  resize(rows, cols);
+  return setConstant(value);
+}
+
+
+// zero:
+
+/** \returns an expression of a zero matrix.
+  *
+  * The parameters \a rows and \a cols are the number of rows and of columns of
+  * the returned matrix. Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size matrix types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a rows and \a cols as arguments, so Zero() should be used
+  * instead.
+  *
+  * \addexample Zero \label How to take get a zero matrix
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_zero_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_zero_int_int.out
+  *
+  * \sa Zero(), Zero(int)
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ConstantReturnType
+MatrixBase<Derived>::Zero(int rows, int cols)
+{
+  return Constant(rows, cols, Scalar(0));
+}
+
+/** \returns an expression of a zero vector.
+  *
+  * The parameter \a size is the size of the returned vector.
+  * Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size vector types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a size as argument, so Zero() should be used
+  * instead.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_zero_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_zero_int.out
+  *
+  * \sa Zero(), Zero(int,int)
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ConstantReturnType
+MatrixBase<Derived>::Zero(int size)
+{
+  return Constant(size, Scalar(0));
+}
+
+/** \returns an expression of a fixed-size zero matrix or vector.
+  *
+  * This variant is only for fixed-size MatrixBase types. For dynamic-size types, you
+  * need to use the variants taking size arguments.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_zero.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_zero.out
+  *
+  * \sa Zero(int), Zero(int,int)
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ConstantReturnType
+MatrixBase<Derived>::Zero()
+{
+  return Constant(Scalar(0));
+}
+
+/** \returns true if *this is approximately equal to the zero matrix,
+  *          within the precision given by \a prec.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_isZero.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_isZero.out
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp, Zero()
+  */
+template<typename Derived>
+bool MatrixBase<Derived>::isZero(RealScalar prec) const
+{
+  for(int j = 0; j < cols(); ++j)
+    for(int i = 0; i < rows(); ++i)
+      if(!ei_isMuchSmallerThan(coeff(i, j), static_cast<Scalar>(1), prec))
+        return false;
+  return true;
+}
+
+/** Sets all coefficients in this expression to zero.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_setZero.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_setZero.out
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp, Zero()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE Derived& MatrixBase<Derived>::setZero()
+{
+  return setConstant(Scalar(0));
+}
+
+/** Resizes to the given \a size, and sets all coefficients in this expression to zero.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * Example: \include Matrix_setZero_int.cpp
+  * Output: \verbinclude Matrix_setZero_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setZero(), setZero(int,int), class CwiseNullaryOp, MatrixBase::Zero()
+  */
+template<typename _Scalar, int _Rows, int _Cols, int _Options, int _MaxRows, int _MaxCols>
+EIGEN_STRONG_INLINE Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>&
+Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>::setZero(int size)
+{
+  resize(size);
+  return setConstant(Scalar(0));
+}
+
+/** Resizes to the given size, and sets all coefficients in this expression to zero.
+  *
+  * \param rows the new number of rows
+  * \param cols the new number of columns
+  *
+  * Example: \include Matrix_setZero_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude Matrix_setZero_int_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setZero(), setZero(int), class CwiseNullaryOp, MatrixBase::Zero()
+  */
+template<typename _Scalar, int _Rows, int _Cols, int _Options, int _MaxRows, int _MaxCols>
+EIGEN_STRONG_INLINE Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>&
+Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>::setZero(int rows, int cols)
+{
+  resize(rows, cols);
+  return setConstant(Scalar(0));
+}
+
+// ones:
+
+/** \returns an expression of a matrix where all coefficients equal one.
+  *
+  * The parameters \a rows and \a cols are the number of rows and of columns of
+  * the returned matrix. Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size matrix types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a rows and \a cols as arguments, so Ones() should be used
+  * instead.
+  *
+  * \addexample One \label How to get a matrix with all coefficients equal one
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_ones_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_ones_int_int.out
+  *
+  * \sa Ones(), Ones(int), isOnes(), class Ones
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ConstantReturnType
+MatrixBase<Derived>::Ones(int rows, int cols)
+{
+  return Constant(rows, cols, Scalar(1));
+}
+
+/** \returns an expression of a vector where all coefficients equal one.
+  *
+  * The parameter \a size is the size of the returned vector.
+  * Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size vector types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a size as argument, so Ones() should be used
+  * instead.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_ones_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_ones_int.out
+  *
+  * \sa Ones(), Ones(int,int), isOnes(), class Ones
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ConstantReturnType
+MatrixBase<Derived>::Ones(int size)
+{
+  return Constant(size, Scalar(1));
+}
+
+/** \returns an expression of a fixed-size matrix or vector where all coefficients equal one.
+  *
+  * This variant is only for fixed-size MatrixBase types. For dynamic-size types, you
+  * need to use the variants taking size arguments.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_ones.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_ones.out
+  *
+  * \sa Ones(int), Ones(int,int), isOnes(), class Ones
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ConstantReturnType
+MatrixBase<Derived>::Ones()
+{
+  return Constant(Scalar(1));
+}
+
+/** \returns true if *this is approximately equal to the matrix where all coefficients
+  *          are equal to 1, within the precision given by \a prec.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_isOnes.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_isOnes.out
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp, Ones()
+  */
+template<typename Derived>
+bool MatrixBase<Derived>::isOnes
+(RealScalar prec) const
+{
+  return isApproxToConstant(Scalar(1), prec);
+}
+
+/** Sets all coefficients in this expression to one.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_setOnes.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_setOnes.out
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp, Ones()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE Derived& MatrixBase<Derived>::setOnes()
+{
+  return setConstant(Scalar(1));
+}
+
+/** Resizes to the given \a size, and sets all coefficients in this expression to one.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * Example: \include Matrix_setOnes_int.cpp
+  * Output: \verbinclude Matrix_setOnes_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setOnes(), setOnes(int,int), class CwiseNullaryOp, MatrixBase::Ones()
+  */
+template<typename _Scalar, int _Rows, int _Cols, int _Options, int _MaxRows, int _MaxCols>
+EIGEN_STRONG_INLINE Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>&
+Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>::setOnes(int size)
+{
+  resize(size);
+  return setConstant(Scalar(1));
+}
+
+/** Resizes to the given size, and sets all coefficients in this expression to one.
+  *
+  * \param rows the new number of rows
+  * \param cols the new number of columns
+  *
+  * Example: \include Matrix_setOnes_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude Matrix_setOnes_int_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setOnes(), setOnes(int), class CwiseNullaryOp, MatrixBase::Ones()
+  */
+template<typename _Scalar, int _Rows, int _Cols, int _Options, int _MaxRows, int _MaxCols>
+EIGEN_STRONG_INLINE Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>&
+Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>::setOnes(int rows, int cols)
+{
+  resize(rows, cols);
+  return setConstant(Scalar(1));
+}
+
+// Identity:
+
+/** \returns an expression of the identity matrix (not necessarily square).
+  *
+  * The parameters \a rows and \a cols are the number of rows and of columns of
+  * the returned matrix. Must be compatible with this MatrixBase type.
+  *
+  * This variant is meant to be used for dynamic-size matrix types. For fixed-size types,
+  * it is redundant to pass \a rows and \a cols as arguments, so Identity() should be used
+  * instead.
+  *
+  * \addexample Identity \label How to get an identity matrix
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_identity_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_identity_int_int.out
+  *
+  * \sa Identity(), setIdentity(), isIdentity()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::IdentityReturnType
+MatrixBase<Derived>::Identity(int rows, int cols)
+{
+  return NullaryExpr(rows, cols, ei_scalar_identity_op<Scalar>());
+}
+
+/** \returns an expression of the identity matrix (not necessarily square).
+  *
+  * This variant is only for fixed-size MatrixBase types. For dynamic-size types, you
+  * need to use the variant taking size arguments.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_identity.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_identity.out
+  *
+  * \sa Identity(int,int), setIdentity(), isIdentity()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::IdentityReturnType
+MatrixBase<Derived>::Identity()
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_FIXED_SIZE(Derived)
+  return NullaryExpr(RowsAtCompileTime, ColsAtCompileTime, ei_scalar_identity_op<Scalar>());
+}
+
+/** \returns true if *this is approximately equal to the identity matrix
+  *          (not necessarily square),
+  *          within the precision given by \a prec.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_isIdentity.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_isIdentity.out
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp, Identity(), Identity(int,int), setIdentity()
+  */
+template<typename Derived>
+bool MatrixBase<Derived>::isIdentity
+(RealScalar prec) const
+{
+  for(int j = 0; j < cols(); ++j)
+  {
+    for(int i = 0; i < rows(); ++i)
+    {
+      if(i == j)
+      {
+        if(!ei_isApprox(coeff(i, j), static_cast<Scalar>(1), prec))
+          return false;
+      }
+      else
+      {
+        if(!ei_isMuchSmallerThan(coeff(i, j), static_cast<RealScalar>(1), prec))
+          return false;
+      }
+    }
+  }
+  return true;
+}
+
+template<typename Derived, bool Big = (Derived::SizeAtCompileTime>=16)>
+struct ei_setIdentity_impl
+{
+  static EIGEN_STRONG_INLINE Derived& run(Derived& m)
+  {
+    return m = Derived::Identity(m.rows(), m.cols());
+  }
+};
+
+template<typename Derived>
+struct ei_setIdentity_impl<Derived, true>
+{
+  static EIGEN_STRONG_INLINE Derived& run(Derived& m)
+  {
+    m.setZero();
+    const int size = std::min(m.rows(), m.cols());
+    for(int i = 0; i < size; ++i) m.coeffRef(i,i) = typename Derived::Scalar(1);
+    return m;
+  }
+};
+
+/** Writes the identity expression (not necessarily square) into *this.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_setIdentity.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_setIdentity.out
+  *
+  * \sa class CwiseNullaryOp, Identity(), Identity(int,int), isIdentity()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE Derived& MatrixBase<Derived>::setIdentity()
+{
+  return ei_setIdentity_impl<Derived>::run(derived());
+}
+
+/** Resizes to the given size, and writes the identity expression (not necessarily square) into *this.
+  *
+  * \param rows the new number of rows
+  * \param cols the new number of columns
+  *
+  * Example: \include Matrix_setIdentity_int_int.cpp
+  * Output: \verbinclude Matrix_setIdentity_int_int.out
+  *
+  * \sa MatrixBase::setIdentity(), class CwiseNullaryOp, MatrixBase::Identity()
+  */
+template<typename _Scalar, int _Rows, int _Cols, int _Options, int _MaxRows, int _MaxCols>
+EIGEN_STRONG_INLINE Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>&
+Matrix<_Scalar, _Rows, _Cols, _Options, _MaxRows, _MaxCols>::setIdentity(int rows, int cols)
+{
+  resize(rows, cols);
+  return setIdentity();
+}
+
+/** \returns an expression of the i-th unit (basis) vector.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * \sa MatrixBase::Unit(int), MatrixBase::UnitX(), MatrixBase::UnitY(), MatrixBase::UnitZ(), MatrixBase::UnitW()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::BasisReturnType MatrixBase<Derived>::Unit(int size, int i)
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return BasisReturnType(SquareMatrixType::Identity(size,size), i);
+}
+
+/** \returns an expression of the i-th unit (basis) vector.
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * This variant is for fixed-size vector only.
+  *
+  * \sa MatrixBase::Unit(int,int), MatrixBase::UnitX(), MatrixBase::UnitY(), MatrixBase::UnitZ(), MatrixBase::UnitW()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::BasisReturnType MatrixBase<Derived>::Unit(int i)
+{
+  EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(Derived)
+  return BasisReturnType(SquareMatrixType::Identity(),i);
+}
+
+/** \returns an expression of the X axis unit vector (1{,0}^*)
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * \sa MatrixBase::Unit(int,int), MatrixBase::Unit(int), MatrixBase::UnitY(), MatrixBase::UnitZ(), MatrixBase::UnitW()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::BasisReturnType MatrixBase<Derived>::UnitX()
+{ return Derived::Unit(0); }
+
+/** \returns an expression of the Y axis unit vector (0,1{,0}^*)
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * \sa MatrixBase::Unit(int,int), MatrixBase::Unit(int), MatrixBase::UnitY(), MatrixBase::UnitZ(), MatrixBase::UnitW()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::BasisReturnType MatrixBase<Derived>::UnitY()
+{ return Derived::Unit(1); }
+
+/** \returns an expression of the Z axis unit vector (0,0,1{,0}^*)
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * \sa MatrixBase::Unit(int,int), MatrixBase::Unit(int), MatrixBase::UnitY(), MatrixBase::UnitZ(), MatrixBase::UnitW()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::BasisReturnType MatrixBase<Derived>::UnitZ()
+{ return Derived::Unit(2); }
+
+/** \returns an expression of the W axis unit vector (0,0,0,1)
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * \sa MatrixBase::Unit(int,int), MatrixBase::Unit(int), MatrixBase::UnitY(), MatrixBase::UnitZ(), MatrixBase::UnitW()
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::BasisReturnType MatrixBase<Derived>::UnitW()
+{ return Derived::Unit(3); }
+
+#endif // EIGEN_CWISE_NULLARY_OP_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CwiseUnaryOp.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/CwiseUnaryOp.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..076d568
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,229 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_CWISE_UNARY_OP_H
+#define EIGEN_CWISE_UNARY_OP_H
+
+/** \class CwiseUnaryOp
+  *
+  * \brief Generic expression of a coefficient-wise unary operator of a matrix or a vector
+  *
+  * \param UnaryOp template functor implementing the operator
+  * \param MatrixType the type of the matrix we are applying the unary operator
+  *
+  * This class represents an expression of a generic unary operator of a matrix or a vector.
+  * It is the return type of the unary operator-, of a matrix or a vector, and most
+  * of the time this is the only way it is used.
+  *
+  * \sa MatrixBase::unaryExpr(const CustomUnaryOp &) const, class CwiseBinaryOp, class CwiseNullaryOp
+  */
+template<typename UnaryOp, typename MatrixType>
+struct ei_traits<CwiseUnaryOp<UnaryOp, MatrixType> >
+ : ei_traits<MatrixType>
+{
+  typedef typename ei_result_of<
+                     UnaryOp(typename MatrixType::Scalar)
+                   >::type Scalar;
+  typedef typename MatrixType::Nested MatrixTypeNested;
+  typedef typename ei_unref<MatrixTypeNested>::type _MatrixTypeNested;
+  enum {
+    Flags = (_MatrixTypeNested::Flags & (
+      HereditaryBits | LinearAccessBit | AlignedBit
+      | (ei_functor_traits<UnaryOp>::PacketAccess ? PacketAccessBit : 0))),
+    CoeffReadCost = _MatrixTypeNested::CoeffReadCost + ei_functor_traits<UnaryOp>::Cost
+  };
+};
+
+template<typename UnaryOp, typename MatrixType>
+class CwiseUnaryOp : ei_no_assignment_operator,
+  public MatrixBase<CwiseUnaryOp<UnaryOp, MatrixType> >
+{
+  public:
+
+    EIGEN_GENERIC_PUBLIC_INTERFACE(CwiseUnaryOp)
+
+    inline CwiseUnaryOp(const MatrixType& mat, const UnaryOp& func = UnaryOp())
+      : m_matrix(mat), m_functor(func) {}
+
+    EIGEN_STRONG_INLINE int rows() const { return m_matrix.rows(); }
+    EIGEN_STRONG_INLINE int cols() const { return m_matrix.cols(); }
+
+    EIGEN_STRONG_INLINE const Scalar coeff(int row, int col) const
+    {
+      return m_functor(m_matrix.coeff(row, col));
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    EIGEN_STRONG_INLINE PacketScalar packet(int row, int col) const
+    {
+      return m_functor.packetOp(m_matrix.template packet<LoadMode>(row, col));
+    }
+
+    EIGEN_STRONG_INLINE const Scalar coeff(int index) const
+    {
+      return m_functor(m_matrix.coeff(index));
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    EIGEN_STRONG_INLINE PacketScalar packet(int index) const
+    {
+      return m_functor.packetOp(m_matrix.template packet<LoadMode>(index));
+    }
+
+  protected:
+    const typename MatrixType::Nested m_matrix;
+    const UnaryOp m_functor;
+};
+
+/** \returns an expression of a custom coefficient-wise unary operator \a func of *this
+  *
+  * The template parameter \a CustomUnaryOp is the type of the functor
+  * of the custom unary operator.
+  *
+  * \addexample CustomCwiseUnaryFunctors \label How to use custom coeff wise unary functors
+  *
+  * Example:
+  * \include class_CwiseUnaryOp.cpp
+  * Output: \verbinclude class_CwiseUnaryOp.out
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp, class CwiseBinarOp, MatrixBase::operator-, Cwise::abs
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename CustomUnaryOp>
+EIGEN_STRONG_INLINE const CwiseUnaryOp<CustomUnaryOp, Derived>
+MatrixBase<Derived>::unaryExpr(const CustomUnaryOp& func) const
+{
+  return CwiseUnaryOp<CustomUnaryOp, Derived>(derived(), func);
+}
+
+/** \returns an expression of the opposite of \c *this
+  */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const CwiseUnaryOp<ei_scalar_opposite_op<typename ei_traits<Derived>::Scalar>,Derived>
+MatrixBase<Derived>::operator-() const
+{
+  return derived();
+}
+
+/** \returns an expression of the coefficient-wise absolute value of \c *this
+  *
+  * Example: \include Cwise_abs.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_abs.out
+  *
+  * \sa abs2()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+EIGEN_STRONG_INLINE const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_abs_op)
+Cwise<ExpressionType>::abs() const
+{
+  return _expression();
+}
+
+/** \returns an expression of the coefficient-wise squared absolute value of \c *this
+  *
+  * Example: \include Cwise_abs2.cpp
+  * Output: \verbinclude Cwise_abs2.out
+  *
+  * \sa abs(), square()
+  */
+template<typename ExpressionType>
+EIGEN_STRONG_INLINE const EIGEN_CWISE_UNOP_RETURN_TYPE(ei_scalar_abs2_op)
+Cwise<ExpressionType>::abs2() const
+{
+  return _expression();
+}
+
+/** \returns an expression of the complex conjugate of \c *this.
+  *
+  * \sa adjoint() */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE typename MatrixBase<Derived>::ConjugateReturnType
+MatrixBase<Derived>::conjugate() const
+{
+  return ConjugateReturnType(derived());
+}
+
+/** \returns an expression of the real part of \c *this.
+  *
+  * \sa imag() */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::RealReturnType
+MatrixBase<Derived>::real() const { return derived(); }
+
+/** \returns an expression of the imaginary part of \c *this.
+  *
+  * \sa real() */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ImagReturnType
+MatrixBase<Derived>::imag() const { return derived(); }
+
+/** \returns an expression of *this with the \a Scalar type casted to
+  * \a NewScalar.
+  *
+  * The template parameter \a NewScalar is the type we are casting the scalars to.
+  *
+  * \sa class CwiseUnaryOp
+  */
+template<typename Derived>
+template<typename NewType>
+EIGEN_STRONG_INLINE const CwiseUnaryOp<ei_scalar_cast_op<typename ei_traits<Derived>::Scalar, NewType>, Derived>
+MatrixBase<Derived>::cast() const
+{
+  return derived();
+}
+
+/** \relates MatrixBase */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const typename MatrixBase<Derived>::ScalarMultipleReturnType
+MatrixBase<Derived>::operator*(const Scalar& scalar) const
+{
+  return CwiseUnaryOp<ei_scalar_multiple_op<Scalar>, Derived>
+    (derived(), ei_scalar_multiple_op<Scalar>(scalar));
+}
+
+/** \relates MatrixBase */
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE const CwiseUnaryOp<ei_scalar_quotient1_op<typename ei_traits<Derived>::Scalar>, Derived>
+MatrixBase<Derived>::operator/(const Scalar& scalar) const
+{
+  return CwiseUnaryOp<ei_scalar_quotient1_op<Scalar>, Derived>
+    (derived(), ei_scalar_quotient1_op<Scalar>(scalar));
+}
+
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE Derived&
+MatrixBase<Derived>::operator*=(const Scalar& other)
+{
+  return *this = *this * other;
+}
+
+template<typename Derived>
+EIGEN_STRONG_INLINE Derived&
+MatrixBase<Derived>::operator/=(const Scalar& other)
+{
+  return *this = *this / other;
+}
+
+#endif // EIGEN_CWISE_UNARY_OP_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/DiagonalCoeffs.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/DiagonalCoeffs.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..767fe5f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,124 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_DIAGONALCOEFFS_H
+#define EIGEN_DIAGONALCOEFFS_H
+
+/** \class DiagonalCoeffs
+  *
+  * \brief Expression of the main diagonal of a matrix
+  *
+  * \param MatrixType the type of the object in which we are taking the main diagonal
+  *
+  * The matrix is not required to be square.
+  *
+  * This class represents an expression of the main diagonal of a square matrix.
+  * It is the return type of MatrixBase::diagonal() and most of the time this is
+  * the only way it is used.
+  *
+  * \sa MatrixBase::diagonal()
+  */
+template<typename MatrixType>
+struct ei_traits<DiagonalCoeffs<MatrixType> >
+{
+  typedef typename MatrixType::Scalar Scalar;
+  typedef typename ei_nested<MatrixType>::type MatrixTypeNested;
+  typedef typename ei_unref<MatrixTypeNested>::type _MatrixTypeNested;
+  enum {
+    RowsAtCompileTime = int(MatrixType::SizeAtCompileTime) == Dynamic ? Dynamic
+                      : EIGEN_ENUM_MIN(MatrixType::RowsAtCompileTime,
+                                       MatrixType::ColsAtCompileTime),
+    ColsAtCompileTime = 1,
+    MaxRowsAtCompileTime = int(MatrixType::MaxSizeAtCompileTime) == Dynamic ? Dynamic
+                            : EIGEN_ENUM_MIN(MatrixType::MaxRowsAtCompileTime,
+                                             MatrixType::MaxColsAtCompileTime),
+    MaxColsAtCompileTime = 1,
+    Flags = (unsigned int)_MatrixTypeNested::Flags & (HereditaryBits | LinearAccessBit),
+    CoeffReadCost = _MatrixTypeNested::CoeffReadCost
+  };
+};
+
+template<typename MatrixType> class DiagonalCoeffs
+   : public MatrixBase<DiagonalCoeffs<MatrixType> >
+{
+  public:
+
+    EIGEN_GENERIC_PUBLIC_INTERFACE(DiagonalCoeffs)
+
+    inline DiagonalCoeffs(const MatrixType& matrix) : m_matrix(matrix) {}
+
+    EIGEN_INHERIT_ASSIGNMENT_OPERATORS(DiagonalCoeffs)
+
+    inline int rows() const { return std::min(m_matrix.rows(), m_matrix.cols()); }
+    inline int cols() const { return 1; }
+
+    inline Scalar& coeffRef(int row, int)
+    {
+      return m_matrix.const_cast_derived().coeffRef(row, row);
+    }
+
+    inline const Scalar coeff(int row, int) const
+    {
+      return m_matrix.coeff(row, row);
+    }
+
+    inline Scalar& coeffRef(int index)
+    {
+      return m_matrix.const_cast_derived().coeffRef(index, index);
+    }
+
+    inline const Scalar coeff(int index) const
+    {
+      return m_matrix.coeff(index, index);
+    }
+
+  protected:
+
+    const typename MatrixType::Nested m_matrix;
+};
+
+/** \returns an expression of the main diagonal of the matrix \c *this
+  *
+  * \c *this is not required to be square.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_diagonal.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_diagonal.out
+  *
+  * \sa class DiagonalCoeffs */
+template<typename Derived>
+inline DiagonalCoeffs<Derived>
+MatrixBase<Derived>::diagonal()
+{
+  return DiagonalCoeffs<Derived>(derived());
+}
+
+/** This is the const version of diagonal(). */
+template<typename Derived>
+inline const DiagonalCoeffs<Derived>
+MatrixBase<Derived>::diagonal() const
+{
+  return DiagonalCoeffs<Derived>(derived());
+}
+
+#endif // EIGEN_DIAGONALCOEFFS_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/DiagonalMatrix.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/DiagonalMatrix.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..01f01fd
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,144 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_DIAGONALMATRIX_H
+#define EIGEN_DIAGONALMATRIX_H
+
+/** \class DiagonalMatrix
+  * \nonstableyet 
+  *
+  * \brief Expression of a diagonal matrix
+  *
+  * \param CoeffsVectorType the type of the vector of diagonal coefficients
+  *
+  * This class is an expression of a diagonal matrix with given vector of diagonal
+  * coefficients. It is the return
+  * type of MatrixBase::diagonal(const OtherDerived&) and most of the time this is
+  * the only way it is used.
+  *
+  * \sa MatrixBase::diagonal(const OtherDerived&)
+  */
+template<typename CoeffsVectorType>
+struct ei_traits<DiagonalMatrix<CoeffsVectorType> >
+{
+  typedef typename CoeffsVectorType::Scalar Scalar;
+  typedef typename ei_nested<CoeffsVectorType>::type CoeffsVectorTypeNested;
+  typedef typename ei_unref<CoeffsVectorTypeNested>::type _CoeffsVectorTypeNested;
+  enum {
+    RowsAtCompileTime = CoeffsVectorType::SizeAtCompileTime,
+    ColsAtCompileTime = CoeffsVectorType::SizeAtCompileTime,
+    MaxRowsAtCompileTime = CoeffsVectorType::MaxSizeAtCompileTime,
+    MaxColsAtCompileTime = CoeffsVectorType::MaxSizeAtCompileTime,
+    Flags = (_CoeffsVectorTypeNested::Flags & HereditaryBits) | Diagonal,
+    CoeffReadCost = _CoeffsVectorTypeNested::CoeffReadCost
+  };
+};
+
+template<typename CoeffsVectorType>
+class DiagonalMatrix : ei_no_assignment_operator,
+   public MatrixBase<DiagonalMatrix<CoeffsVectorType> >
+{
+  public:
+
+    EIGEN_GENERIC_PUBLIC_INTERFACE(DiagonalMatrix)
+    typedef CoeffsVectorType _CoeffsVectorType;
+
+    // needed to evaluate a DiagonalMatrix<Xpr> to a DiagonalMatrix<NestByValue<Vector> >
+    template<typename OtherCoeffsVectorType>
+    inline DiagonalMatrix(const DiagonalMatrix<OtherCoeffsVectorType>& other) : m_coeffs(other.diagonal())
+    {
+      EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(CoeffsVectorType);
+      EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(OtherCoeffsVectorType);
+      ei_assert(m_coeffs.size() > 0);
+    }
+
+    inline DiagonalMatrix(const CoeffsVectorType& coeffs) : m_coeffs(coeffs)
+    {
+      EIGEN_STATIC_ASSERT_VECTOR_ONLY(CoeffsVectorType);
+      ei_assert(coeffs.size() > 0);
+    }
+
+    inline int rows() const { return m_coeffs.size(); }
+    inline int cols() const { return m_coeffs.size(); }
+
+    inline const Scalar coeff(int row, int col) const
+    {
+      return row == col ? m_coeffs.coeff(row) : static_cast<Scalar>(0);
+    }
+
+    inline const CoeffsVectorType& diagonal() const { return m_coeffs; }
+
+  protected:
+    const typename CoeffsVectorType::Nested m_coeffs;
+};
+
+/** \nonstableyet 
+  * \returns an expression of a diagonal matrix with *this as vector of diagonal coefficients
+  *
+  * \only_for_vectors
+  *
+  * \addexample AsDiagonalExample \label How to build a diagonal matrix from a vector
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_asDiagonal.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_asDiagonal.out
+  *
+  * \sa class DiagonalMatrix, isDiagonal()
+  **/
+template<typename Derived>
+inline const DiagonalMatrix<Derived>
+MatrixBase<Derived>::asDiagonal() const
+{
+  return derived();
+}
+
+/** \nonstableyet 
+  * \returns true if *this is approximately equal to a diagonal matrix,
+  *          within the precision given by \a prec.
+  *
+  * Example: \include MatrixBase_isDiagonal.cpp
+  * Output: \verbinclude MatrixBase_isDiagonal.out
+  *
+  * \sa asDiagonal()
+  */
+template<typename Derived>
+bool MatrixBase<Derived>::isDiagonal
+(RealScalar prec) const
+{
+  if(cols() != rows()) return false;
+  RealScalar maxAbsOnDiagonal = static_cast<RealScalar>(-1);
+  for(int j = 0; j < cols(); ++j)
+  {
+    RealScalar absOnDiagonal = ei_abs(coeff(j,j));
+    if(absOnDiagonal > maxAbsOnDiagonal) maxAbsOnDiagonal = absOnDiagonal;
+  }
+  for(int j = 0; j < cols(); ++j)
+    for(int i = 0; i < j; ++i)
+    {
+      if(!ei_isMuchSmallerThan(coeff(i, j), maxAbsOnDiagonal, prec)) return false;
+      if(!ei_isMuchSmallerThan(coeff(j, i), maxAbsOnDiagonal, prec)) return false;
+    }
+  return true;
+}
+
+#endif // EIGEN_DIAGONALMATRIX_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/DiagonalProduct.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/DiagonalProduct.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..f33a26f
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,130 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2008 Gael Guennebaud <g.gael@free.fr>
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// Eigen. If not, see <http://www.gnu.org/licenses/>.
+
+#ifndef EIGEN_DIAGONALPRODUCT_H
+#define EIGEN_DIAGONALPRODUCT_H
+
+/** \internal Specialization of ei_nested for DiagonalMatrix.
+ *  Unlike ei_nested, if the argument is a DiagonalMatrix and if it must be evaluated,
+ *  then it evaluated to a DiagonalMatrix having its own argument evaluated.
+ */
+template<typename T, int N> struct ei_nested_diagonal : ei_nested<T,N> {};
+template<typename T, int N> struct ei_nested_diagonal<DiagonalMatrix<T>,N >
+ : ei_nested<DiagonalMatrix<T>, N, DiagonalMatrix<NestByValue<typename ei_plain_matrix_type<T>::type> > >
+{};
+
+// specialization of ProductReturnType
+template<typename Lhs, typename Rhs>
+struct ProductReturnType<Lhs,Rhs,DiagonalProduct>
+{
+  typedef typename ei_nested_diagonal<Lhs,Rhs::ColsAtCompileTime>::type LhsNested;
+  typedef typename ei_nested_diagonal<Rhs,Lhs::RowsAtCompileTime>::type RhsNested;
+
+  typedef Product<LhsNested, RhsNested, DiagonalProduct> Type;
+};
+
+template<typename LhsNested, typename RhsNested>
+struct ei_traits<Product<LhsNested, RhsNested, DiagonalProduct> >
+{
+  // clean the nested types:
+  typedef typename ei_cleantype<LhsNested>::type _LhsNested;
+  typedef typename ei_cleantype<RhsNested>::type _RhsNested;
+  typedef typename _LhsNested::Scalar Scalar;
+
+  enum {
+    LhsFlags = _LhsNested::Flags,
+    RhsFlags = _RhsNested::Flags,
+    RowsAtCompileTime = _LhsNested::RowsAtCompileTime,
+    ColsAtCompileTime = _RhsNested::ColsAtCompileTime,
+    MaxRowsAtCompileTime = _LhsNested::MaxRowsAtCompileTime,
+    MaxColsAtCompileTime = _RhsNested::MaxColsAtCompileTime,
+
+    LhsIsDiagonal = (_LhsNested::Flags&Diagonal)==Diagonal,
+    RhsIsDiagonal = (_RhsNested::Flags&Diagonal)==Diagonal,
+
+    CanVectorizeRhs =  (!RhsIsDiagonal) && (RhsFlags & RowMajorBit) && (RhsFlags & PacketAccessBit)
+                     && (ColsAtCompileTime % ei_packet_traits<Scalar>::size == 0),
+
+    CanVectorizeLhs =  (!LhsIsDiagonal) && (!(LhsFlags & RowMajorBit)) && (LhsFlags & PacketAccessBit)
+                     && (RowsAtCompileTime % ei_packet_traits<Scalar>::size == 0),
+
+    RemovedBits = ~((RhsFlags & RowMajorBit) && (!CanVectorizeLhs) ? 0 : RowMajorBit),
+
+    Flags = ((unsigned int)(LhsFlags | RhsFlags) & HereditaryBits & RemovedBits)
+          | (((CanVectorizeLhs&&RhsIsDiagonal) || (CanVectorizeRhs&&LhsIsDiagonal)) ? PacketAccessBit : 0),
+
+    CoeffReadCost = NumTraits<Scalar>::MulCost + _LhsNested::CoeffReadCost + _RhsNested::CoeffReadCost
+  };
+};
+
+template<typename LhsNested, typename RhsNested> class Product<LhsNested, RhsNested, DiagonalProduct> : ei_no_assignment_operator,
+  public MatrixBase<Product<LhsNested, RhsNested, DiagonalProduct> >
+{
+    typedef typename ei_traits<Product>::_LhsNested _LhsNested;
+    typedef typename ei_traits<Product>::_RhsNested _RhsNested;
+
+    enum {
+      RhsIsDiagonal = (_RhsNested::Flags&Diagonal)==Diagonal
+    };
+
+  public:
+
+    EIGEN_GENERIC_PUBLIC_INTERFACE(Product)
+
+    template<typename Lhs, typename Rhs>
+    inline Product(const Lhs& lhs, const Rhs& rhs)
+      : m_lhs(lhs), m_rhs(rhs)
+    {
+      ei_assert(lhs.cols() == rhs.rows());
+    }
+
+    inline int rows() const { return m_lhs.rows(); }
+    inline int cols() const { return m_rhs.cols(); }
+
+    const Scalar coeff(int row, int col) const
+    {
+      const int unique = RhsIsDiagonal ? col : row;
+      return m_lhs.coeff(row, unique) * m_rhs.coeff(unique, col);
+    }
+
+    template<int LoadMode>
+    const PacketScalar packet(int row, int col) const
+    {
+      if (RhsIsDiagonal)
+      {
+        return ei_pmul(m_lhs.template packet<LoadMode>(row, col), ei_pset1(m_rhs.coeff(col, col)));
+      }
+      else
+      {
+        return ei_pmul(ei_pset1(m_lhs.coeff(row, row)), m_rhs.template packet<LoadMode>(row, col));
+      }
+    }
+
+  protected:
+    const LhsNested m_lhs;
+    const RhsNested m_rhs;
+};
+
+#endif // EIGEN_DIAGONALPRODUCT_H
diff --git a/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Dot.h b/extern/Eigen2/Eigen/src/Core/Dot.h
new file mode 100644 (file)
index 0000000..5838af7
--- /dev/null
@@ -0,0 +1,361 @@
+// This file is part of Eigen, a lightweight C++ template library
+// for linear algebra. Eigen itself is part of the KDE project.
+//
+// Copyright (C) 2006-2008 Benoit Jacob <jacob.benoit.1@gmail.com>
+//
+// Eigen is free software; you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU Lesser General Public
+// License as published by the Free Software Foundation; either
+// version 3 of the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Alternatively, you can redistribute it and/or
+// modify it under the terms of the GNU General Public License as
+// published by the Free Software Foundation; either version 2 of
+// the License, or (at your option) any later version.
+//
+// Eigen is distributed in the hope that it will be useful, but WITHOUT ANY
+// WARRANTY; without even the implied warranty of MERCHANTABILITY or FITNESS
+// FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the GNU Lesser General Public License or the
+// GNU General Public License for more details.
+//
+// You should have received a copy of the GNU Lesser General Public
+// License and a copy of the GNU General Public License along with
+// E